Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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This is table  335  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100056059--100056145
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27
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3
24
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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12
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1.97
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2.2
175
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2.0
20
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1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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33
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1.82
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83
93
0
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21
19
32
1.97
100228100--100228279
44
4.1
44
77
8
213
26
26
16
30
1.97
100229653--100229938
136
2.1
137
96
0
520
32
25
18
24
1.97
100231723--100231858
26
5.2
26
94
0
236
36
25
5
33
1.78
100232462--100232535
1
74.0
1
83
0
85
0
9
0
90
0.45
100232449--100232535
5
15.8
6
82
10
75
1
10
0
88
0.57
100232449--100232535
8
11.2
8
80
12
94
1
10
0
88
0.57
100232449--100232535
15
6.2
14
83
9
106
1
10
0
88
0.57
100239016--100239175
18
8.9
18
85
8
220
36
14
11
38
1.82
100239016--100239175
35
4.5
35
91
5
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36
14
11
38
1.82
100239016--100239167
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2.9
53
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3
245
36
13
11
38
1.82
100243489--100243531
3
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3
100
0
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32
0
0
67
0.91
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17
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0
5
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1.12
100243592--100243616
11
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11
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0
50
28
0
8
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2
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0
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2.1
19
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30
35
12
22
1.91
100247345--100247385
11
3.6
11
87
6
64
78
7
4
9
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100247345--100247385
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3.5
12
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6
66
78
7
4
9
1.10
100263117--100263467
74
4.9
71
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5
357
28
15
22
33
1.95
100263117--100263418
144
2.1
145
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3
367
28
16
22
32
1.96
100263481--100263809
88
3.7
88
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0
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0
0
0.40
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2
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2
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0
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0
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1
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2
2
32
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14
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3.0
39
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3
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15
10
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16
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100271067--100271134
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3.1
23
70
24
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14
10
58
16
1.62
100271010--100271119
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5.8
18
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112
14
12
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15
1.66
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1.64
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15
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6
1.54
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2
1.37
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13
2.7
13
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0
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0
14
1.44
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35
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7
201
33
24
10
31
1.90
100285353--100285524
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226
33
23
11
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1.90
100292845--100293010
35
4.6
35
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192
33
24
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1.90
100292840--100293010
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2.4
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217
33
23
11
31
1.90
100294380--100294415
13
2.7
13
91
4
54
38
50
0
11
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100294806--100294847
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2.3
18
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4
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26
2
2
69
1.13
100297899--100298154
55
4.8
54
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13
232
35
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25
21
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100297907--100298107
108
1.8
110
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300
33
17
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1.96
100300942--100300973
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2.6
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0
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1
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20
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0
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2.5
23
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8
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61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345