Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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2.5
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10
28
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
1
47
1.10
7840776--7840808
8
4.2
8
92
7
59
87
0
12
0
0.53
7840776--7840807
15
2.1
15
100
0
64
87
0
12
0
0.54
7844563--7844622
30
2.0
30
96
0
111
28
3
11
56
1.51
7844748--7844782
12
3.0
12
95
4
63
65
0
0
34
0.93
7846989--7847026
3
12.7
3
88
0
58
0
31
0
68
0.90
7849624--7849670
16
2.8
17
79
17
53
46
0
2
51
1.13
7850374--7850436
22
2.9
22
75
0
72
22
7
4
65
1.38
7851541--7851578
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
7853472--7853745
46
6.0
46
92
0
406
38
14
24
22
1.92
7854779--7855214
237
1.8
237
85
2
608
28
19
17
34
1.95
7859072--7859134
31
2.0
31
93
0
108
36
22
4
36
1.75
7859368--7859455
21
4.2
21
83
1
88
46
15
19
18
1.84
7866668--7866745
19
4.3
18
75
16
72
58
3
2
34
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7866685--7866744
17
3.4
17
73
15
59
56
5
3
35
1.37
7866669--7866723
9
6.2
8
80
16
56
61
1
0
36
1.06
7867842--7867895
27
1.9
29
85
7
76
29
1
5
62
1.28
7869373--7869450
27
2.9
27
83
7
104
23
21
26
28
1.99
7869550--7869585
18
1.9
19
94
5
65
69
0
27
2
1.02
7872606--7872744
72
1.9
72
82
5
174
56
7
5
30
1.50
7872914--7872998
33
2.6
33
84
3
109
27
15
42
15
1.86
7875563--7875695
60
2.2
62
86
4
182
57
12
0
30
1.35
7875811--7875861
3
17.3
3
80
15
54
0
35
0
64
0.94
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13
6.0
14
79
12
66
0
35
0
64
0.94
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19
3.6
19
74
18
61
0
35
0
64
0.94
7876000--7876106
31
3.4
31
79
7
126
23
19
40
16
1.91
7876166--7876215
22
2.3
22
86
3
66
16
26
12
46
1.81
7876226--7876273
20
2.5
20
86
3
62
60
2
0
37
1.09
7877182--7877223
12
3.1
14
83
13
52
64
2
0
33
1.07
7877899--7877924
3
8.7
3
100
0
52
69
0
0
30
0.89
7881912--7881944
16
2.1
16
88
11
50
60
15
9
15
1.58
7888837--7888892
16
3.5
17
82
4
64
37
5
26
30
1.79
7889814--7890276
131
3.5
133
78
4
386
32
18
20
28
1.96
7891128--7891215
19
4.7
19
91
5
153
37
12
13
36
1.83
7894306--7894339
12
2.8
12
86
0
50
70
0
29
0
0.87
7896846--7896895
1
50.0
1
83
0
64
92
0
6
2
0.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7897775--7898482
44
16.3
44
74
9
492
32
17
23
26
1.96
7897775--7898477
132
5.4
132
91
1
1071
32
17
23
26
1.96
7897775--7898482
88
8.1
88
74
9
569
32
17
23
26
1.96
7898398--7898468
37
1.9
37
97
0
133
35
16
21
26
1.95
7899054--7899151
19
5.2
19
85
7
137
39
10
15
34
1.81
7899044--7899151
36
2.9
36
79
10
112
39
10
14
35
1.80
7900560--7900616
28
2.0
29
86
6
82
56
0
12
31
1.36
7900571--7900624
28
1.9
28
81
7
65
57
3
12
25
1.52
7901715--7901761
2
23.5
2
100
0
94
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0
0
48
1.00
7904986--7905077
24
3.8
24
85
0
112
38
28
8
25
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345