Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  59  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16411481--16411632
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1.82
16411640--16411727
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1
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0
0
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18
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.5
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16469613--16469663
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0
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1.03
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2.6
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20
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2.7
130
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405
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20
1.96
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2.1
43
91
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17
22
19
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1
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70
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81
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1
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33
10
1
53
1.46
16481830--16481868
3
13.3
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83
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53
30
2
2
64
1.21
16481831--16481863
17
1.9
17
93
0
57
30
3
3
63
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
0
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2.2
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1.98
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20
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47
0
10
42
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16553219--16553514
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147
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0
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2
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0
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0
0
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60
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1.35
16579684--16579734
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16
75
13
52
68
0
29
1
1.00
16579701--16579750
15
3.3
15
81
8
57
72
0
28
0
0.86
16579688--16579765
35
2.2
36
81
6
88
64
1
33
1
1.10
16581792--16581912
41
2.9
41
86
3
154
35
25
19
19
1.95
16585506--16585542
18
2.1
18
89
0
56
64
2
13
18
1.39
16587805--16587840
14
2.7
13
87
8
54
63
0
0
36
0.94
16592980--16593008
10
3.0
10
95
5
51
89
0
0
10
0.48
16599661--16599696
17
2.1
17
89
0
54
30
8
0
61
1.26
16602852--16602877
13
2.0
13
100
0
52
38
7
23
30
1.83
16603073--16603164
48
1.9
47
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12
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27
3
20
48
1.65
16604077--16604131
24
2.3
24
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21
29
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32
1.95
16607126--16607168
11
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11
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0
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37
18
0
44
1.50
16607103--16607168
32
2.0
33
85
8
91
37
16
1
43
1.57
16607119--16607169
22
2.4
21
87
9
77
37
17
0
45
1.49
16607301--16607436
48
2.8
48
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7
161
31
8
5
54
1.53
16609028--16609063
18
2.0
18
94
0
63
30
27
2
38
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16610332--16610417
43
2.0
43
95
0
154
36
31
10
22
1.88
16612600--16612975
126
3.0
126
88
0
545
28
18
17
35
1.94
16613510--16613582
20
3.8
20
76
20
91
43
24
0
31
1.54
16613660--16613708
14
3.3
15
77
11
57
46
32
0
20
1.51
16621305--16621354
22
2.1
25
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10
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34
4
0
62
1.14
16624061--16624091
16
1.9
16
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0
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41
0
3
54
1.16
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170
15
21
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45
1.84
16632812--16632893
26
3.2
26
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0
146
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25
6
30
1.80
16638573--16638654
26
3.2
25
93
6
137
37
26
4
30
1.77
16640103--16640273
90
1.9
90
89
2
263
29
21
20
28
1.98
16641309--16641340
16
2.0
16
93
0
55
43
0
3
53
1.16
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3
8.3
3
100
0
50
32
0
0
68
0.90
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2
19.0
2
88
5
58
48
0
0
51
1.00
16642637--16642755
51
2.3
53
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4
143
16
21
21
41
1.91
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36
2.3
36
87
0
123
33
15
16
34
1.91
16642877--16642960
18
4.7
18
86
0
105
33
15
16
34
1.91
16642909--16642976
18
3.8
18
80
7
68
32
13
14
39
1.85
16645567--16645697
51
2.6
51
92
0
217
35
16
21
27
1.94
16648651--16648677
13
2.1
13
100
0
54
22
37
25
14
1.93
16650343--16650457
54
2.1
54
83
3
142
38
22
21
17
1.93
16650343--16650457
27
4.3
26
83
9
124
38
22
21
17
1.93
16652073--16652182
26
4.2
26
94
2
168
36
23
4
35
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16654267--16654365
16
5.8
16
77
13
99
16
22
27
34
1.95
16654248--16654402
54
2.9
54
95
0
274
14
20
29
36
1.92
16660003--16660059
16
3.4
16
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21
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38
7
5
49
1.53
16660559--16660665
55
1.9
55
81
7
128
44
2
2
49
1.31
16660827--16660897
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4.4
16
87
0
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29
26
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38
1.79
16661053--16661094
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2.6
16
92
0
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30
7
30
30
1.84
16666668--16666751
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2.1
40
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10
100
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1
3
48
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153
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1.80
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3.4
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116
37
11
16
34
1.84
16669091--16669128
16
2.4
16
86
0
58
42
2
26
28
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345