Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   

This is table  61  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16945030--16945072
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2
2
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1.08
16945030--16945072
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1.08
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1.8
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0
317
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29
21
20
1.98
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216
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29
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1
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1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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205
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1.92
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2
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0
0
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17012289--17012544
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2
5
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1.26
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2
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13
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17028303--17028384
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2.1
14
93
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51
89
0
0
10
0.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
28
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88
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2.1
18
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0
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1.55
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1.11
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21
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0
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20
29
29
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0
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19
20
26
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1.97
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3
12.0
3
93
0
63
63
0
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33
1.08
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27
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29
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0
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0
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50
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17
17
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
17059281--17059333
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1.80
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26
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0
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23
36
1.83
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4.2
26
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68
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2
27
1.13
17069339--17069400
27
2.3
26
78
8
70
51
11
0
37
1.38
17071276--17071336
30
2.0
30
90
0
95
39
6
24
29
1.80
17072999--17073036
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
17074672--17074703
12
2.7
12
100
0
64
18
40
40
0
1.51
17080466--17080503
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
17081932--17081987
15
3.9
15
75
15
57
76
1
1
19
0.96
17081932--17081989
11
5.4
11
74
17
59
77
1
1
18
0.94
17085650--17085697
10
4.9
10
78
12
55
68
0
6
25
1.12
17085650--17085697
20
2.5
20
90
10
73
68
0
6
25
1.12
17085721--17085749
15
1.9
15
100
0
58
41
6
0
51
1.28
17092807--17092902
40
2.5
38
83
6
120
36
37
11
14
1.82
17093995--17094061
33
2.0
33
97
0
125
61
5
16
16
1.53
17101693--17101802
26
4.2
26
97
0
193
33
6
24
35
1.81
17106790--17106896
25
4.2
25
96
3
189
32
5
26
35
1.80
17106790--17106896
51
2.1
50
94
5
189
32
5
26
35
1.80
17112599--17112708
26
4.2
26
97
0
193
34
5
23
36
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17135920--17135979
28
2.1
28
90
0
93
31
6
30
31
1.83
17141326--17141388
28
2.2
28
91
0
99
31
6
30
31
1.83
17146280--17146315
14
2.6
15
83
16
51
44
0
5
50
1.25
17152845--17152972
65
2.0
64
93
1
220
27
17
12
42
1.85
17159295--17159409
5
21.6
5
71
18
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24
1
0
73
0.99
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24
5.4
23
74
18
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25
1
0
72
0.99
17159336--17159413
22
3.6
21
80
13
95
26
2
1
69
1.09
17159292--17159420
28
4.5
28
74
20
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24
2
0
72
1.02
17159345--17159459
44
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43
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9
128
27
5
0
66
1.12
17159528--17159582
22
2.7
21
79
17
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12
3
7
76
1.12
17165097--17165179
11
7.5
11
77
8
87
2
1
32
63
1.15
17165115--17165179
21
3.1
21
88
4
87
1
1
30
66
1.10
17165118--17165177
32
1.9
30
86
6
84
1
1
30
66
1.11
17165412--17165460
26
2.0
25
84
8
64
30
0
6
63
1.19
17169385--17169455
19
3.7
19
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19
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18
11
1
69
1.26
17171026--17171127
12
8.3
12
82
5
80
13
5
5
74
1.19
17171022--17171105
6
13.7
6
87
6
98
14
5
2
77
1.06
17177810--17177843
17
2.0
17
100
0
68
23
5
35
35
1.79
17182294--17182342
26
2.0
24
88
8
71
63
6
0
30
1.19
17182313--17182371
21
2.8
21
78
12
59
69
8
0
22
1.15
17182418--17182450
15
2.1
16
88
11
50
69
0
0
30
0.88
17183358--17183431
31
2.4
32
88
4
107
25
14
13
45
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17184196--17184224
6
4.8
6
100
0
58
0
17
0
82
0.66
17187016--17187056
20
2.1
20
86
4
57
58
2
0
39
1.11
17188422--17188471
3
16.7
3
100
0
100
68
0
0
32
0.90
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3
8.7
3
100
0
52
65
34
0
0
0.93
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7
6.0
6
91
8
51
15
5
0
79
0.90
17192469--17192507
13
2.9
13
92
3
60
15
5
0
79
0.90
17193987--17194018
5
6.2
5
96
3
55
21
0
0
78
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9
100
0
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0
0
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0.40
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18.0
2
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54
45
0
2
51
1.16
17206890--17206985
40
2.4
41
84
6
117
26
30
16
27
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345