Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  17  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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36
16
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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13
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1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5969347--5969555
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12
22
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2.8
13
91
4
56
91
0
8
0
0.41
6011433--6011470
20
1.9
20
84
10
51
23
7
2
65
1.32
6017537--6017586
26
1.9
26
84
8
66
52
4
0
44
1.20
6021280--6021329
26
1.9
26
84
8
66
52
4
0
44
1.20
6025022--6025071
26
1.9
26
84
8
66
52
4
0
44
1.20
6028763--6028812
26
1.9
26
84
8
66
52
4
0
44
1.20
6032489--6032538
26
1.9
26
84
8
66
52
4
0
44
1.20
6036014--6036048
2
18.0
2
94
5
63
51
0
0
48
1.00
6036306--6036349
21
2.1
21
95
0
79
38
20
13
27
1.90
6038624--6038661
19
2.0
20
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15
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39
23
0
36
1.55
6038891--6039058
44
3.7
43
78
13
160
28
29
20
20
1.98
6038891--6039058
92
1.8
91
93
3
293
28
29
20
20
1.98
6039494--6039545
14
3.6
14
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10
50
23
28
7
40
1.82
6039488--6039566
30
2.6
30
100
0
158
26
27
6
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6039508--6039561
16
3.5
16
70
10
58
25
24
7
42
1.80
6042271--6042318
24
2.0
25
83
4
62
54
8
4
33
1.50
6042279--6042331
25
2.2
24
83
10
63
58
9
0
32
1.30
6043064--6043104
21
2.0
21
90
0
64
7
9
2
80
0.99
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15
3.8
15
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9
53
41
0
0
58
0.98
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31
2.4
29
86
9
90
33
0
1
64
1.02
6061885--6061955
29
2.4
30
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15
85
39
0
1
59
1.06
6067097--6067125
11
2.6
11
100
0
58
13
0
20
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1.26
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159
2.0
160
94
0
549
33
22
15
28
1.94
6072261--6072302
12
3.4
12
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57
16
0
7
76
1.00
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4
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4
90
0
52
50
0
9
40
1.34
6074473--6074516
8
5.5
8
91
0
61
50
0
9
40
1.34
6078298--6078336
19
2.0
20
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5
53
56
5
2
35
1.35
6082510--6082549
3
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3
100
0
80
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0
0
32
0.91
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1.9
30
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0
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27
3
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56
1.51
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16
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17
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10
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20
4
30
1.72
6089270--6089445
46
3.8
46
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182
20
21
28
28
1.98
6089266--6089438
93
1.9
93
92
2
294
20
21
29
27
1.98
6091325--6091359
2
17.5
2
100
0
70
0
0
48
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1.00
6092852--6092989
68
2.0
68
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0
222
22
18
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28
1.97
6098995--6099026
16
1.9
17
93
6
57
0
6
3
90
0.53
6102735--6102800
31
2.1
31
82
0
78
36
3
6
54
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6104247--6104321
31
2.4
32
77
6
82
37
8
14
40
1.76
6106390--6106432
18
2.4
18
100
0
86
46
39
0
13
1.44
6106889--6106934
7
6.9
7
82
5
51
86
6
2
4
0.75
6108245--6108360
56
2.1
56
80
6
130
31
4
10
54
1.54
6110599--6110654
20
2.6
22
83
5
80
33
3
8
53
1.49
6111617--6111645
2
14.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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2
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100
0
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0
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21
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0
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1.81
6134340--6134432
46
2.0
46
100
0
186
34
23
8
33
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345