Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  322  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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1.8
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28
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Period
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Copy
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Score
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28
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20
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96
25
22
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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23
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39
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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3.5
12
86
13
57
25
5
7
61
1.44
96703165--96703230
13
5.1
13
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7
80
36
25
7
30
1.84
96703165--96703230
26
2.5
26
87
0
105
36
25
7
30
1.84
96703818--96703857
18
2.3
18
86
4
55
35
0
0
65
0.93
96703818--96703864
15
2.9
16
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9
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36
0
0
63
0.94
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3
19.0
3
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7
80
0
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0
66
0.92
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9
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10
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10
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0
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0
64
0.94
96711071--96711109
16
2.5
15
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51
61
0
0
38
0.96
96712856--96712904
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2.0
23
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12
18
18
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1.76
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15
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9
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1.25
96715659--96715924
47
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47
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24
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1.83
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26
4.2
26
93
1
180
36
23
7
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1.83
96739453--96739486
15
2.3
15
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10
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0
20
1.28
96744518--96744555
12
3.0
13
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7
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34
0
0
65
0.93
96744771--96744822
12
4.4
12
75
4
52
71
7
5
15
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
43
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14
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31
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96751121--96751302
46
4.0
46
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1
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22
24
14
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1.91
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105
1.9
100
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1.97
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2.4
32
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33
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0
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0
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1.00
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0
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20
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1.70
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26
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2.0
36
100
0
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8
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22
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2
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2.0
40
100
0
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20
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16
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2
0
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2.7
20
75
8
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35
3
0
61
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96828949--96829029
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40
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2.0
18
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0
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0
2
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2.8
53
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15
26
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28
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29
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0
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5.3
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0
0
27
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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