Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8843904--8843949
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0
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2.3
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0
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18
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2.4
40
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102
13
14
34
37
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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3.6
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10
211
27
29
20
22
1.98
8864522--8864790
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5.8
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252
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1.98
8866263--8866342
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0
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2.4
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144
29
23
13
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8878860--8878930
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19
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132
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2.0
60
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1.9
20
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0
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2
10
47
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
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0
0
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0
0
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18
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22
17
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1.97
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6.6
72
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589
30
21
17
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8966351--8966405
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19
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0
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4
63
56
0
0
43
0.99
8970682--8970709
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
8976761--8976794
17
2.0
17
94
0
59
50
0
0
50
1.00
8992990--8993249
133
2.0
131
85
3
351
26
17
18
36
1.93
8994812--8994867
17
3.4
16
76
14
60
26
1
1
69
1.08
8994839--8994873
17
2.1
17
88
0
52
25
0
2
71
1.00
8998428--8998581
52
2.9
53
79
10
158
30
28
16
24
1.96
8999929--8999983
3
18.3
3
100
0
110
32
0
0
67
0.91
9004555--9004598
19
2.4
18
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65
0
4
29
1.12
9011001--9011044
23
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24
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9
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84
0
11
4
0.77
9010981--9011044
32
2.0
32
81
6
76
79
1
7
10
0.99
9011463--9011487
5
5.0
5
100
0
50
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0
0
20
0.72
9016518--9016555
19
1.9
19
89
5
58
15
10
2
71
1.25
9020578--9020617
19
2.2
19
86
8
57
7
12
5
75
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9024131--9024194
29
2.2
28
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8
74
37
1
9
51
1.44
9024209--9024234
12
2.2
12
100
0
52
53
0
0
46
1.00
9024570--9024640
37
2.0
35
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8
117
52
11
11
25
1.70
9029839--9029920
26
3.2
26
94
0
146
35
25
8
30
1.86
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35
2.0
35
100
0
140
37
5
25
31
1.80
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3.0
51
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10
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25
18
26
28
1.98
9036922--9036963
9
3.8
11
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17
52
35
2
4
57
1.33
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2
22.0
2
100
0
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0
0
50
1.00
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2.0
54
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0
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39
3
28
27
1.74
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3
10.0
3
100
0
60
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0
0
66
0.92
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1.9
37
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15
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1
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1.57
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5
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19
0
2
78
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9
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0
107
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1.91
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37
3.3
37
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4
176
48
12
4
34
1.62
9043933--9043977
18
2.3
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60
2
0
37
1.09
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1
135
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20
1.98
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39
4.7
39
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1
246
27
27
24
20
1.99
9046314--9046461
79
1.9
79
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0
233
29
26
22
21
1.99
9047150--9047299
72
2.1
72
82
0
174
34
28
12
25
1.91
9047168--9047303
24
5.7
24
83
0
164
34
28
12
24
1.92
9047167--9047303
72
1.9
72
86
0
193
34
29
12
24
1.92
9047241--9047312
24
3.0
24
72
22
62
36
26
12
25
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9048483--9048516
17
2.0
17
94
0
59
38
5
0
55
1.24
9049457--9049499
9
4.7
9
77
5
50
23
0
30
46
1.52
9054334--9054385
5
10.0
5
84
12
52
17
0
3
78
0.89
9054332--9054377
23
2.0
23
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8
67
17
0
4
78
0.91
9055269--9055452
97
1.9
97
100
0
368
30
12
2
54
1.52
9055301--9055487
51
3.8
51
73
17
212
29
15
2
51
1.57
9058821--9058859
2
19.5
2
100
0
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0
0
51
1.00
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2.0
99
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0
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
9065147--9065250
30
3.4
29
71
18
79
57
0
7
33
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345