Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  110  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
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4
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154
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2
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1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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20
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2
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58
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20
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36
82
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20
18
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2.0
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82
27
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2.3
20
85
14
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60
17
4
17
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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73
0
22
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0.99
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27
82
15
104
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0
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12
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209
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26
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1.83
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2.8
20
89
0
96
35
8
19
36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29772867--29772962
25
3.8
25
90
1
147
28
25
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1.98
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28
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27
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23
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1
114
33
19
25
21
1.97
29783602--29783749
25
6.0
25
84
2
165
31
19
27
20
1.97
29796976--29797020
23
2.0
23
90
0
72
22
26
17
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2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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18
2.6
18
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3
58
15
41
28
15
1.87
29800266--29800290
12
2.1
12
100
0
50
28
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16
0
1.41
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6
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0
2
15
0.77
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27
2.0
27
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7
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31
20
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1.95
29804176--29804227
27
2.0
26
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26
23
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1.94
29804179--29804238
27
2.3
27
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25
23
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1.97
29813411--29813444
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0
2
14
0.79
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18
2.2
19
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2
0
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52
5
0
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1.25
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24
2.5
24
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57
3
1
37
1.25
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27
2.1
27
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0
103
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26
5
0
1.11
29820416--29820457
20
2.1
20
82
8
50
69
28
2
0
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
17
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31
2.5
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18
1.92
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19
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16
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27
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17
2.1
18
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13
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2.0
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2.1
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18
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0
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2.0
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0
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6
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0
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0
0
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104
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26
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2.9
28
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2
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2.0
23
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0
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4
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0
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25
2.0
25
100
0
98
57
8
8
26
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29886201--29886244
23
1.9
22
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65
4
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27
1.23
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106
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0
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0
0
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0
0
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0
0
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0
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2.6
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46
0
0
53
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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