Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  330  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98725446--98725478
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15
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0
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2.5
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0
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30
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1.40
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2.3
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2.1
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100
0
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13
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1.45
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3.9
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12
297
26
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35
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2.8
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1.52
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5.1
25
73
11
108
35
5
5
53
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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98787071--98787132
14
4.5
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80
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0
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98796661--98796793
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1.97
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17
1.9
17
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14
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25
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12
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39
4
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1.70
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25
2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
98819769--98819816
12
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20
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98822543--98822671
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4.1
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2
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0
0
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27
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2
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1
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12
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0
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0
0
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74
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98853971--98854013
9
4.6
9
80
11
50
11
4
9
74
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98855128--98855160
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1.9
17
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0
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5
2
66
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52
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1
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0.97
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3.3
25
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14
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20
3
3
71
1.17
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40
5.2
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211
25
25
22
25
2.00
98863285--98863490
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2.00
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26
22
25
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0
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257
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22
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25
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25
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1.96
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2.4
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20
24
20
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1.96
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10.3
27
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116
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19
34
1.83
98891019--98891493
54
8.8
54
82
5
514
41
7
23
28
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98891028--98891500
27
17.5
26
81
9
354
40
7
24
27
1.81
98891497--98891595
27
3.7
27
79
5
103
31
10
19
39
1.85
98891489--98891593
54
2.0
53
83
9
133
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20
37
1.87
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5.9
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89
2
698
40
7
23
28
1.81
98891505--98891610
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3.9
27
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74
34
9
17
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1.83
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2.5
12
94
0
51
53
0
10
36
1.35
98895049--98895077
4
7.2
4
100
0
58
24
0
0
75
0.80
98900255--98900288
16
2.1
16
88
0
50
61
0
0
38
0.96
98901008--98901105
48
2.1
48
98
1
189
45
11
12
30
1.76
98904735--98904779
23
2.0
23
86
0
63
44
2
6
46
1.42
98904884--98904934
20
2.5
21
75
9
61
15
17
13
52
1.74
98905400--98905464
20
3.1
20
75
18
60
18
12
9
60
1.58
98905388--98905457
20
3.3
20
77
18
70
17
8
11
62
1.52
98910745--98910778
17
2.0
17
100
0
68
52
17
0
29
1.45
98920835--98920901
17
3.9
17
78
3
62
61
0
1
37
1.05
98920898--98920929
10
3.4
10
83
16
50
65
0
6
28
1.16
98921135--98921174
13
3.1
13
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13
55
37
0
0
62
0.95
98921135--98921180
12
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14
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11
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41
0
0
58
0.98
98921778--98921844
9
7.6
8
73
17
53
25
4
0
70
1.06
98921828--98921921
36
2.6
36
75
11
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32
3
1
62
1.18
98921936--98922102
92
1.8
91
85
3
237
33
9
20
36
1.85
98921936--98922132
92
2.1
91
82
6
227
32
9
20
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98923000--98923097
40
2.5
40
84
0
133
38
21
8
31
1.83
98926308--98926332
8
3.1
8
100
0
50
64
0
12
24
1.27
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79
2.8
79
87
2
311
31
23
14
30
1.95
98931839--98931976
40
3.5
40
82
0
141
35
21
13
30
1.91
98931642--98931914
119
2.3
119
91
0
447
35
21
11
31
1.90
98933609--98933642
11
3.2
10
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12
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70
0
0
29
0.87
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34
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26
4
34
35
1.75
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50
2.0
50
98
0
195
21
12
20
45
1.84
98939900--98939942
12
3.6
12
93
0
77
32
32
25
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1.88
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24
2.0
24
96
0
89
30
28
28
12
1.93
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3
15.0
3
100
0
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0
0
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2.1
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11
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37
0
3
59
1.13
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8
3.1
8
100
0
50
24
0
0
76
0.80
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3
13.7
3
100
0
82
68
0
0
31
0.90
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28
2.0
28
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0
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26
35
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22
1.94
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26
4.2
26
96
0
175
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5
24
35
1.79
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27
5.2
27
85
2
147
17
22
22
37
1.94
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7.6
7
93
0
70
32
0
0
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0.91
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21
2.0
21
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0
64
26
53
4
14
1.61
98957939--98957985
15
3.2
15
77
14
53
36
44
4
14
1.65
98957980--98958027
7
6.7
7
76
4
51
50
29
0
20
1.49
98958500--98958694
39
4.6
39
69
18
147
26
21
21
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98958448--98958709
132
2.0
132
92
1
436
27
22
20
30
1.98
98958628--98958717
39
2.3
39
86
3
117
23
21
24
31
1.98
98962700--98962874
46
3.8
46
79
13
207
20
20
29
29
1.98
98962697--98962867
93
1.8
92
94
1
306
21
21
29
28
1.98
98966668--98966773
26
4.1
26
97
0
203
31
6
26
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1.82
98967947--98967976
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3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70
98968363--98968506
54
2.7
54
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2
245
16
25
24
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5.9
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18
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22
33
1.96
98968366--98968524
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2.0
80
84
8
207
18
25
22
33
1.96
98970663--98970777
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345