Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
Number
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Score
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Period
Size
Copy
Number
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Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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18
25
27
1.98
14702831--14702956
60
2.1
60
82
10
150
28
21
23
26
1.99
14702916--14702968
28
1.9
27
85
11
72
30
16
24
28
1.97
14703620--14703652
18
1.9
17
88
11
50
42
12
15
30
1.83
14704490--14704533
21
2.1
21
83
8
54
0
27
4
68
1.09
14712112--14712157
20
2.3
20
82
14
60
28
28
17
26
1.98
14712124--14712167
19
2.2
20
84
4
54
34
25
18
22
1.96
14718859--14719016
52
3.0
52
80
4
174
31
25
18
24
1.98
14721169--14721230
30
2.1
29
96
3
115
51
22
0
25
1.48
14725215--14725261
24
2.0
24
91
0
76
36
10
14
38
1.81
14744211--14744249
19
2.1
18
85
9
51
61
2
7
28
1.37
14751506--14751537
2
16.0
2
100
0
64
50
0
0
50
1.00
14752080--14752147
33
2.1
33
100
0
136
51
23
0
25
1.48
14769459--14769524
33
2.0
33
100
0
132
27
21
12
39
1.88
14770148--14770213
10
6.9
10
75
16
68
54
1
0
43
1.09
14773591--14773641
23
2.2
24
82
10
61
56
1
3
37
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14775071--14775101
15
2.1
15
100
0
62
19
6
25
48
1.72
14777396--14777438
17
2.4
18
75
21
54
51
0
6
41
1.29
14777475--14777521
24
1.9
25
86
4
69
76
2
8
12
1.09
14777534--14777573
20
2.1
18
90
9
62
67
0
32
0
0.91
14778340--14778388
20
2.5
20
82
0
62
28
16
22
32
1.95
14779466--14779520
22
2.5
22
87
0
74
23
38
23
14
1.92
14782430--14782507
21
3.8
21
81
3
97
21
16
16
44
1.86
14791533--14791630
49
2.0
49
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0
151
22
20
15
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1.89
14806620--14806716
49
2.0
48
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2
131
22
18
14
44
1.86
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5
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11
51
18
0
0
81
0.70
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1.8
93
96
0
317
27
29
21
20
1.98
14811818--14811993
46
3.8
46
79
12
216
28
29
21
20
1.98
14813373--14813453
42
1.9
42
94
0
144
30
18
22
28
1.97
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5
5.0
5
100
0
50
20
0
40
40
1.52
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21
2.0
22
85
4
59
61
0
9
28
1.27
14828210--14828271
22
2.8
23
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59
1
1
37
1.17
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22
2.0
24
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51
0
2
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1.13
14833213--14833237
13
1.9
13
100
0
50
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4
0
32
1.12
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15
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16
84
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55
53
0
7
38
1.30
14845264--14845323
21
3.0
21
80
4
61
21
21
16
40
1.92
14850042--14850090
6
7.7
6
84
11
53
77
6
2
14
1.05
14853319--14853343
7
3.6
7
100
0
50
72
0
0
28
0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14859375--14859475
3
32.7
3
85
7
123
29
6
0
62
1.28
14859548--14859614
3
22.3
3
90
6
109
29
1
1
67
1.09
14859553--14859635
18
4.6
18
88
8
82
28
1
2
67
1.11
14859765--14859814
21
2.4
21
84
15
68
26
6
6
62
1.42
14862248--14862291
16
2.6
16
82
10
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29
20
9
40
1.83
14864917--14865144
40
5.7
40
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370
25
27
22
24
2.00
14868317--14868490
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3.9
45
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1.96
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18
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93
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388
33
17
19
29
1.95
14868599--14868883
83
3.3
83
70
13
248
30
17
20
31
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345