Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  90  of  345  ( 41379 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24627343--24627417
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1.30
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3.0
44
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0
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5
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0
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54
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24
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1.97
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2.0
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122
38
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20
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1.9
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4.7
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20
23
22
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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30
1.98
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25
2.8
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27
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0
0
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3.2
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2.2
20
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137
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100
0
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135
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19
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4.2
26
85
11
139
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25
5
32
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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24
22
29
1.99
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53
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1.29
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44
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10
201
31
18
23
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24771635--24771805
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18
23
25
1.97
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132
2.1
132
93
0
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17
24
27
1.97
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20
132
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1.94
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97
0
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14
25
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1.94
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292
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30
17
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29
1.97
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205
2.5
205
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0
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31
19
20
29
1.97
24774370--24774432
19
3.2
19
75
24
60
31
1
1
65
1.12
24774825--24774869
24
1.9
24
82
13
58
26
2
6
64
1.30
24775056--24775121
32
2.1
32
100
0
132
27
9
6
57
1.53
24775911--24776546
46
13.9
46
78
5
540
32
5
23
38
1.78
24776119--24776177
22
2.6
22
79
10
66
30
1
23
44
1.64
24775908--24776549
229
2.8
228
95
0
1149
32
5
23
38
1.78
24776348--24776406
22
2.6
22
79
10
66
30
1
23
44
1.64
24775911--24776544
23
27.7
23
78
7
488
32
5
23
38
1.78
24777254--24777334
42
1.9
42
87
0
117
23
12
30
33
1.92
24777921--24777970
20
2.5
20
83
0
55
38
0
20
42
1.52
24777944--24778022
26
3.0
26
85
3
106
30
2
22
44
1.66
24777994--24778065
20
3.6
20
79
3
65
38
8
13
38
1.75
24777944--24778042
26
4.0
25
70
21
75
32
3
21
43
1.68
24786606--24786636
14
2.2
14
94
0
53
16
0
6
77
0.97
24792242--24792274
13
2.4
14
90
5
50
30
9
0
60
1.27
24794508--24794537
14
2.2
14
94
5
53
33
6
20
40
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24796813--24796847
18
2.0
18
88
5
54
25
34
11
28
1.91
24800411--24800451
21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
24803602--24803628
14
1.9
14
100
0
54
37
14
18
29
1.91
24805249--24805273
3
8.3
3
100
0
50
68
0
0
32
0.90
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17
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16
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14
58
72
9
1
16
1.18
24810880--24810920
16
2.6
16
92
3
66
68
4
0
26
1.10
24814264--24814431
35
4.6
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7
189
33
23
10
32
1.89
24814259--24814431
75
2.4
73
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9
210
33
23
10
32
1.89
24819512--24819553
14
2.9
14
82
3
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52
4
0
42
1.22
24819516--24819565
15
3.4
15
80
2
57
48
12
0
40
1.40
24826177--24826214
7
5.6
7
84
6
51
76
0
0
23
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14
3.1
14
83
9
54
75
0
2
22
0.92
24826166--24826219
14
4.2
13
76
21
51
75
0
1
22
0.89
24828137--24828547
133
3.1
133
82
3
434
28
17
17
35
1.93
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89
4.4
89
81
4
405
28
18
16
35
1.93
24828137--24828530
44
8.9
44
82
5
391
28
18
17
35
1.94
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3.5
46
75
12
156
28
28
16
25
1.97
24837461--24837521
21
2.8
21
85
5
86
34
24
26
14
1.94
24837448--24837533
21
4.0
23
77
11
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37
23
23
16
1.94
24837724--24837818
28
3.6
24
81
13
93
46
33
4
15
1.66
24837738--24837821
28
3.0
28
91
1
132
46
30
3
19
1.66
24850869--24850950
11
7.8
11
68
20
59
56
1
1
41
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
24850902--24850950
20
2.3
20
79
6
53
57
0
0
42
0.99
24851350--24851384
9
3.9
9
88
0
52
37
0
0
62
0.95
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17
2.0
17
88
0
50
29
0
8
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1.26
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19
3.4
19
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1
15
35
1.56
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0
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0
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0
0.82
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27
28
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24853076--24853184
39
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107
24
19
25
30
1.98
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2.3
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0
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0
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5
25
36
1.78
24859744--24859877
26
5.2
26
94
3
218
33
5
24
36
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345