Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr12 103066607 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  103066607

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  81  of  345  ( 41379 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22198960--22199011
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0
0
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6
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1.02
22206680--22206746
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2.3
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2
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2.6
206
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0
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2.3
51
80
12
129
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3
0
59
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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115
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2.5
27
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2
0
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1.14
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1
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2.2
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90
0
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16
16
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2.0
29
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17
2.0
17
100
0
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3
38
50
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22235306--22235409
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38
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22
22
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17
23
23
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26
79
11
116
17
21
21
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1.92
22249834--22249944
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2.1
54
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17
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21
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24
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2.0
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18
28
24
1.98
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98
2.4
98
79
8
236
24
17
28
28
1.98
22273326--22273497
49
3.6
47
80
7
184
26
17
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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192
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1.99
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2.0
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2.0
42
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20
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29
1.96
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27
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12
123
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21
37
1.93
22309937--22310044
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2.0
54
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16
24
21
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2.0
22
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0
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27
4.1
27
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23
23
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1.92
22317735--22317846
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2.1
54
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15
23
23
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2.0
20
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2.0
60
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20
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100
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0
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144
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1.68
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28
1.98
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1.8
93
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290
21
20
29
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22380437--22380611
46
3.8
46
79
10
205
21
20
29
29
1.98
22380433--22380603
93
1.8
92
93
1
297
21
20
29
28
1.98
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2.1
178
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18
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0
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25
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22.7
3
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59
1
0
38
1.06
22389340--22389392
21
2.3
23
75
21
58
52
3
0
43
1.19
22394733--22394767
3
11.7
3
93
0
61
0
2
31
65
1.07
22401339--22401378
19
2.1
19
95
0
71
30
10
20
40
1.85
22406592--22406631
21
1.9
21
89
0
62
47
17
10
25
1.78
22409373--22409431
9
6.6
9
84
7
84
45
16
10
27
1.80
22410159--22410207
14
3.4
15
83
13
59
46
0
8
44
1.33
22410169--22410212
14
3.1
15
84
15
58
45
0
6
47
1.29
22410473--22410511
18
2.2
18
86
9
53
51
0
10
38
1.36
22411243--22411291
12
4.2
12
71
23
50
36
8
8
46
1.63
22416540--22416582
12
3.5
13
81
9
54
0
25
4
69
1.07
22416539--22416582
16
2.7
16
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3
52
0
25
4
70
1.06
22426110--22426201
46
2.0
46
97
0
175
32
9
19
38
1.85
22434054--22434091
18
2.1
18
90
0
58
13
36
7
42
1.73
22436191--22436768
307
1.9
306
82
3
732
36
14
9
39
1.79
22455176--22455206
7
4.4
7
95
0
53
25
0
29
45
1.54
22455176--22455212
14
2.6
14
86
0
56
24
0
29
45
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22455160--22455215
21
2.7
21
76
20
55
26
0
26
46
1.53
22458865--22458927
30
2.1
30
91
5
101
26
3
12
57
1.51
22459049--22459082
11
3.0
11
95
4
59
70
0
0
29
0.87
22459284--22459313
9
3.4
9
90
9
53
63
0
0
36
0.95
22459279--22459400
55
2.2
54
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5
147
53
4
2
40
1.33
22459920--22459987
30
2.3
30
94
0
118
8
19
44
27
1.80
22460482--22460517
7
5.0
7
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3
54
55
13
5
25
1.60
22461400--22461499
24
4.1
26
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18
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2
5
30
1.27
22461437--22461512
22
3.3
22
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22
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1
9
30
1.37
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47
2.2
48
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1
192
60
1
6
30
1.33
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11
3.5
11
86
13
53
43
0
25
30
1.55
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93
2.8
93
96
1
478
29
29
20
21
1.98
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46
5.8
45
78
11
301
29
29
19
21
1.98
22467544--22467655
29
3.7
30
81
12
133
33
21
3
41
1.70
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21
2.0
21
100
0
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14
4
42
1.66
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3
12.3
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100
0
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0
0
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0.91
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3.1
21
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21
54
59
5
4
30
1.40
22492370--22492511
2
75.5
2
70
16
54
57
3
2
37
1.28
22492391--22492512
34
3.6
33
76
19
126
58
4
1
36
1.27
22495342--22495373
15
2.1
15
100
0
64
50
6
18
25
1.70
22496879--22496916
19
2.1
19
85
9
53
68
0
5
26
1.11
22498495--22498548
23
2.5
23
82
8
60
61
5
0
33
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22498486--22498651
24
6.6
25
66
12
74
58
3
7
31
1.40
22498757--22498857
14
7.3
14
67
22
61
64
1
6
26
1.30
22498720--22498857
40
3.3
41
75
16
106
63
1
7
27
1.29
22501967--22502010
20
2.2
20
88
8
63
0
61
2
36
1.09
22502472--22502511
11
3.5
11
80
6
53
40
0
2
57
1.12
22502573--22502603
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2.3
14
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5
55
41
0
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1.27
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7.4
12
69
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36
5
1
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1.31
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1.9
71
88
0
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30
16
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28
1.97
22515377--22515934
160
3.5
160
97
0
1046
28
16
22
32
1.96
22515628--22515759
71
1.9
71
86
0
192
29
16
25
28
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345