Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  1  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1754--1796
21
2.0
21
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8
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23
20
4
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2840--2932
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2.5
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1.98
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3
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0
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5
0
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1.19
3287--3322
12
3.0
12
95
0
63
61
5
0
33
1.19
3974--3999
11
2.4
11
100
0
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0
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1.31
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2.0
21
81
0
50
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1.25
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127
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19
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1.8
104
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23
11
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1.91
15528--15720
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3
255
32
23
11
31
1.91
18471--18558
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1.9
46
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20717--20773
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3.4
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73
17
62
21
24
15
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20715--20780
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1.9
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100
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0
204
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22322--22363
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2.6
16
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38
2
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1.34
23092--23171
25
3.3
25
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5
94
18
25
18
37
1.94
25560--25680
18
6.7
18
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7
57
37
17
9
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25626--25785
36
4.4
36
78
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16
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25626--25785
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18
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10
130
34
16
16
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1.91
25899--26067
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3.1
54
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0
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21
19
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1.9
27
85
14
74
50
1
0
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1.11
27352--27404
18
2.9
17
86
11
61
54
3
0
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1.18
28947--29194
82
3.0
82
96
0
451
53
12
14
18
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29318--29358
11
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11
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12
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21
48
0
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1.50
31332--31372
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2.0
20
100
0
82
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9
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4
1.44
32454--32487
14
2.5
14
85
4
52
47
5
0
47
1.26
35762--36021
37
6.3
44
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8
192
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35695--35910
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4.6
47
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244
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13
22
29
1.92
35761--35910
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3.3
46
94
0
248
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35874--36019
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242
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16
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24
1.94
37711--37855
72
2.0
72
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195
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7
21
26
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100
0
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2.0
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20
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100
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0
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2.2
37
91
2
128
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2
19
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63900--63940
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2.6
16
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21
50
34
0
2
63
1.08
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29
2.2
29
84
7
80
45
0
3
51
1.16
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15
2.1
17
88
11
52
48
6
6
39
1.53
70509--70604
31
3.1
31
77
3
104
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12
35
1.75
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2.3
18
100
0
84
35
16
19
28
1.93
91155--91220
28
2.3
28
82
7
80
50
6
0
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1.27
92675--92745
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2.3
31
85
4
90
43
7
0
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1.29
97536--97575
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2.0
20
85
9
55
45
7
0
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104090--104132
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2.9
15
75
10
52
16
11
18
53
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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111
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0
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19
11
34
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13
100
0
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0
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30
1.24
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2.0
24
100
0
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12
16
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115436--115485
24
2.1
24
100
0
100
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4
10
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119000--119303
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3.5
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87
0
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22
29
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42
3.0
41
66
17
94
22
21
23
33
1.97
119797--119838
13
3.2
13
83
6
50
7
16
2
73
1.15
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6
8.2
6
88
4
55
4
24
0
72
1.02
120229--120314
34
2.5
34
81
5
102
8
12
5
73
1.24
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17
1.9
19
88
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57
0
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2.0
19
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10
51
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2
0
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1.9
32
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86
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0
10
58
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2.0
26
100
0
104
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11
11
34
1.77
152067--152110
14
3.3
14
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11
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4
2
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1.25
174187--174231
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0
0
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187248--187280
14
2.4
14
100
0
66
51
0
30
18
1.46
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
187824--187848
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1.9
13
100
0
50
60
0
0
40
0.97
195721--195773
27
2.0
27
100
0
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1.71
195640--195791
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156
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2.0
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0
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2.0
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24
9
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21
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1
4
30
1.24
221627--221742
44
2.7
43
85
4
144
25
24
23
27
2.00
221659--222002
46
7.8
45
77
10
261
26
20
20
31
1.98
230813--230857
23
2.0
23
82
8
56
37
8
13
40
1.76
232535--232596
30
2.0
31
84
3
81
53
11
0
35
1.37
233763--233812
26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
234941--234986
23
2.0
23
84
12
60
45
10
6
36
1.65
234948--234992
23
2.0
23
82
8
56
40
13
8
37
1.76
236569--236664
47
2.0
47
100
0
192
33
14
10
41
1.80
238719--238854
44
3.0
46
82
5
154
26
19
19
34
1.96
251324--251363
20
2.0
20
85
0
53
60
12
0
27
1.33
251478--251526
24
2.1
23
82
14
57
51
2
8
38
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
251560--251615
3
18.7
3
81
7
69
62
1
5
30
1.28
255674--255747
35
2.1
35
97
0
139
14
14
21
48
1.80
258913--258967
4
13.8
4
80
0
56
29
5
20
45
1.73
258914--258967
20
2.7
20
79
0
72
29
5
20
44
1.74
258910--258969
28
2.1
28
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0
75
31
5
18
45
1.71
260789--260850
31
2.0
30
84
9
81
41
4
4
48
1.46
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11
2.3
11
100
0
50
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0
0
32
0.90
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18
2.4
18
96
0
77
58
0
0
41
0.98
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21
1.9
22
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5
66
31
0
36
31
1.58
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23
2.1
23
85
14
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39
2
6
52
1.39
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1.9
13
100
0
50
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8
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31
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8
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1.59
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21
1.9
21
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0
53
10
15
0
75
1.05
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3
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3
100
0
50
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0
0
32
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2.1
17
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5
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23
11
0
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11
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11
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18
50
47
2
0
49
1.16
299118--299190
36
2.0
37
82
12
89
47
2
0
49
1.15
305126--305197
7
10.3
7
92
0
72
19
29
11
40
1.86
305126--305197
21
3.4
21
76
0
81
19
29
11
40
1.86
305793--305834
21
2.0
21
85
0
57
45
16
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1.69
315855--316005
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2.8
53
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4
214
29
27
16
25
1.97
346092--346149
30
1.9
30
89
3
89
43
0
0
56
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
355305--355366
31
2.0
31
81
12
74
64
3
9
22
1.38
356431--356478
22
2.2
22
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10
73
54
0
0
45
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26
2.0
24
88
7
73
64
6
0
30
1.18
363300--363347
5
9.4
5
93
2
60
45
2
12
39
1.54
363362--363396
16
2.2
17
90
10
56
57
0
0
42
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363364--363403
20
2.0
20
90
5
62
55
0
0
45
0.99
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2.0
17
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0
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0
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2.0
17
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0
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0
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2.4
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15
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33
17
0
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15
2.3
15
90
9
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5
0
14
80
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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