Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  50  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16207291--16207368
15
5.2
15
70
11
70
41
7
23
28
1.82
16207285--16207378
30
3.1
30
93
1
152
40
6
25
27
1.80
16211947--16212054
15
7.2
15
69
12
87
42
7
23
26
1.80
16211941--16212064
30
4.1
30
96
1
221
41
6
25
26
1.79
16221831--16221865
18
1.9
18
94
0
61
25
11
14
48
1.77
16226703--16226730
3
9.3
3
100
0
56
67
0
0
32
0.91
16235220--16235265
15
3.0
15
83
3
56
50
36
6
6
1.54
16235240--16235280
15
2.5
17
84
7
50
48
43
4
2
1.37
16235740--16235781
19
2.3
18
87
4
57
26
2
2
69
1.13
16235766--16235847
33
2.3
38
83
12
102
34
12
0
53
1.38
16245187--16245852
206
3.3
206
92
1
1078
29
18
22
28
1.98
16245940--16246036
45
2.2
45
85
7
142
30
16
29
22
1.96
16246223--16246252
15
1.9
16
93
6
53
53
33
3
10
1.51
16246306--16246386
13
6.5
13
78
13
80
38
50
0
11
1.38
16246300--16246371
35
2.1
35
94
0
126
37
51
0
11
1.38
16246748--16246787
9
4.3
9
84
6
53
27
2
0
70
1.01
16247082--16247121
19
2.2
17
86
8
53
25
15
5
55
1.60
16249752--16249832
28
2.7
30
74
14
78
49
2
6
41
1.41
16250602--16250643
17
2.3
19
80
8
52
35
4
0
59
1.19
16273726--16273778
27
2.0
26
81
3
61
69
3
0
26
1.05
16274308--16274370
20
3.2
20
80
8
76
55
4
0
39
1.21
16274349--16274397
25
2.0
25
84
11
66
53
4
0
42
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16277971--16278022
20
2.7
19
76
5
59
53
3
3
38
1.37
16283531--16283568
15
2.5
15
87
8
51
60
5
5
28
1.40
16284891--16284915
13
1.9
13
100
0
50
64
12
0
24
1.27
16285843--16285886
21
2.1
20
84
16
54
54
0
6
38
1.27
16285844--16285886
23
2.0
21
86
9
59
53
0
6
39
1.28
16294581--16294647
29
2.3
29
97
2
127
35
7
10
46
1.66
16294581--16294661
29
2.8
29
88
3
92
37
8
11
43
1.71
16299653--16299733
31
2.6
31
80
0
90
27
20
16
35
1.94
16301156--16301229
34
2.2
32
79
11
78
48
8
0
43
1.32
16305370--16305444
30
2.5
30
81
10
82
41
0
6
52
1.28
16311577--16311614
20
1.9
20
100
0
76
39
10
0
50
1.37
16320491--16320534
6
7.3
6
97
0
61
0
38
52
9
1.33
16326961--16327017
26
2.2
26
81
12
64
42
3
0
54
1.17
16330468--16331194
177
4.1
177
86
1
981
26
22
19
31
1.97
16336734--16336763
10
3.0
10
90
0
51
53
6
0
40
1.27
16343112--16343142
9
3.3
9
95
4
53
22
3
0
74
0.96
16343291--16343340
15
3.4
15
72
5
57
46
6
0
48
1.27
16356461--16356512
23
2.3
22
81
15
61
23
7
0
69
1.14
16356462--16356537
23
3.3
23
75
12
59
26
7
0
65
1.19
16356554--16356647
25
3.7
25
73
8
73
30
6
3
59
1.38
16358262--16358356
47
2.0
47
97
0
181
47
22
4
26
1.69
16358383--16358421
14
2.8
14
96
0
69
33
20
7
38
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16367307--16367508
25
8.0
25
70
9
115
27
12
26
33
1.93
16367365--16367465
51
2.0
52
82
7
127
27
11
25
34
1.91
16367308--16367507
76
2.6
76
84
0
247
26
13
27
33
1.93
16367365--16367488
51
2.4
50
77
7
117
28
12
26
33
1.92
16380767--16380808
14
3.0
14
79
10
50
64
0
0
35
0.94
16386973--16386999
9
3.0
9
100
0
54
33
11
22
33
1.89
16395001--16395102
24
4.2
24
93
0
168
19
41
3
35
1.70
16401353--16401461
27
4.1
26
80
5
110
36
21
22
19
1.95
16401565--16401638
26
2.8
26
82
8
71
28
9
21
40
1.84
16402893--16402993
24
4.2
24
94
0
175
19
42
3
33
1.70
16403598--16403627
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
16403594--16403656
27
2.3
26
76
10
63
38
0
11
50
1.38
16403652--16403683
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
16404456--16404485
9
3.3
9
95
0
51
10
3
0
86
0.67
16404682--16404882
52
3.9
53
79
10
188
23
15
30
29
1.96
16404695--16404886
53
3.9
47
79
11
181
23
16
30
29
1.96
16405003--16405036
17
2.0
17
100
0
68
35
11
17
35
1.87
16405837--16405861
13
1.9
13
100
0
50
32
12
24
32
1.91
16414018--16414177
42
3.8
42
76
4
160
28
15
25
31
1.95
16414025--16414181
85
1.9
84
83
4
208
29
15
24
29
1.96
16419581--16419609
14
2.1
14
100
0
58
6
27
0
65
1.18
16419561--16419605
19
2.5
18
83
16
58
6
26
0
66
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16420248--16420340
41
2.2
41
98
1
177
24
2
33
39
1.67
16420335--16420394
19
3.1
19
88
9
68
30
5
25
40
1.77
16420348--16420394
19
2.4
19
96
3
85
29
4
21
44
1.71
16422165--16422196
16
1.9
17
93
6
57
53
0
0
46
1.00
16422189--16422401
61
3.4
63
69
17
194
41
2
6
49
1.41
16422151--16422443
120
2.4
120
92
2
482
42
2
5
50
1.36
16422272--16422306
18
2.0
17
88
5
52
40
0
0
60
0.97
16422392--16422426
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
16422380--16422654
147
1.9
149
96
1
509
47
2
3
46
1.33
16422539--16422573
18
2.0
17
88
5
52
45
0
0
54
0.99
16422735--16422829
45
2.1
45
86
1
129
32
26
5
35
1.79
16422810--16422861
16
3.2
16
88
0
77
34
34
0
30
1.58
16424494--16424552
26
2.3
25
82
8
75
42
1
1
54
1.20
16424500--16424559
26
2.4
25
76
20
63
41
1
1
55
1.20
16434561--16434599
14
2.8
14
84
0
51
43
2
15
38
1.60
16435046--16435099
15
3.3
15
74
18
54
44
0
1
53
1.11
16435132--16435172
14
3.0
14
82
10
50
46
0
0
53
1.00
16435176--16435235
22
2.8
22
85
5
70
51
0
0
48
1.00
16441130--16441316
94
2.0
93
83
7
236
40
11
14
33
1.83
16450845--16450918
28
2.6
28
82
2
85
29
32
14
22
1.94
16455150--16455198
18
2.9
17
77
19
57
40
22
0
36
1.54
16456266--16456308
17
2.6
17
82
7
54
6
13
9
69
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16458086--16458164
39
2.0
39
100
0
158
16
30
30
22
1.96
16459850--16460043
105
1.9
101
82
4
244
28
23
15
31
1.95
16462547--16462580
17
2.0
17
94
0
59
67
0
5
26
1.13
16466914--16466997
29
2.9
29
78
15
93
34
7
7
51
1.57
16470984--16471048
33
2.0
33
93
0
112
40
21
4
33
1.74
16477276--16477366
37
2.5
37
80
8
105
32
21
1
43
1.60
16478036--16478077
14
2.9
15
82
10
52
0
19
2
78
0.86
16479295--16479350
12
4.6
12
74
12
51
64
8
0
26
1.23
16479275--16479349
37
2.0
37
97
0
141
58
10
1
29
1.40
16481761--16481807
25
1.9
24
86
4
67
70
4
14
10
1.31
16482796--16482892
39
2.5
38
81
5
115
23
23
27
24
2.00
16483009--16483049
18
2.3
18
87
8
57
48
0
21
29
1.50
16483535--16483572
20
1.9
20
84
10
51
47
0
10
42
1.38
16487799--16487958
32
5.0
32
90
0
257
31
12
10
45
1.75
16489756--16489845
24
3.8
24
89
2
128
36
26
13
23
1.92
16489683--16489845
73
2.2
72
83
5
195
34
26
12
25
1.92
16489711--16489845
48
2.8
48
81
7
148
35
27
12
24
1.92
16491048--16491162
44
2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
16491048--16491181
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
16499007--16499038
14
2.3
14
100
0
64
34
6
21
37
1.79
16504488--16504525
20
1.9
20
89
10
60
57
2
2
36
1.26
16504509--16504564
27
2.1
26
80
9
67
51
5
3
39
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16505782--16505809
2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
16510860--16510925
33
2.0
33
100
0
132
27
15
15
42
1.86
16521829--16521871
21
2.1
20
87
12
61
41
6
0
51
1.29
16529694--16529744
6
8.7
6
80
2
59
13
47
0
39
1.43
16529694--16529744
18
2.9
18
85
2
68
13
47
0
39
1.43
16533236--16533300
23
3.0
23
73
8
64
41
21
18
18
1.90
16534320--16534375
23
2.3
23
78
6
58
35
5
5
53
1.47
16534565--16534606
16
2.7
16
78
14
52
57
0
0
42
0.99
16536583--16536659
28
2.8
28
72
14
79
41
0
23
35
1.55
16538377--16538420
18
2.4
18
84
3
52
47
4
0
47
1.22

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352