Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  13  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4035395--4035431
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18
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2.1
17
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0
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1.43
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2.0
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4
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0
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2.4
17
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45
0
2
52
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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2
2
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2.0
21
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2.0
29
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2.0
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3
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22
2.5
20
80
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11
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0
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2.0
29
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19
21
27
1.97
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5.0
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1.97
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16
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1.9
19
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0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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1.24
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5
0
47
1.24
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0
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2.5
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17
28
28
1.97
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10.4
44
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680
28
17
32
22
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4239659--4240121
128
3.6
129
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668
28
17
31
21
1.96
4239673--4240121
172
2.6
172
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28
17
32
22
1.96
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9
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85
0
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19
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10
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228
26
21
23
29
1.99
4255792--4256200
222
1.8
222
91
2
671
26
21
24
28
1.99
4256075--4256289
45
4.8
45
69
11
120
26
20
24
29
1.99
4255266--4256085
402
2.0
400
87
3
986
25
21
23
28
1.99
4255658--4256308
356
1.8
355
93
2
1128
25
20
23
29
1.99
4256012--4256308
136
2.2
136
95
1
524
25
19
23
30
1.98
4256276--4256777
44
11.4
43
76
5
393
26
16
26
29
1.97
4256286--4256777
132
3.7
132
91
1
770
26
17
26
29
1.97
4260783--4260965
96
1.9
96
96
0
339
45
12
8
33
1.72
4271648--4271678
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
4271665--4271733
21
3.4
20
67
16
61
53
7
2
36
1.44
4276666--4276799
46
3.0
45
82
4
153
35
13
23
28
1.92
4280249--4280279
15
2.1
14
94
5
53
54
6
3
35
1.42
4280266--4280334
21
3.4
20
71
16
70
55
7
1
36
1.37
4282726--4282803
37
2.1
37
95
0
138
37
19
5
38
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4286388--4286556
58
2.9
58
93
0
286
28
29
18
23
1.98
4286395--4286553
29
5.5
29
70
12
112
28
28
19
23
1.98
4286733--4286794
27
2.3
27
83
13
83
40
33
17
8
1.79
4286773--4286958
43
4.3
43
91
0
282
33
32
21
12
1.91
4288353--4288468
39
3.0
39
87
9
184
39
17
5
37
1.72
4288353--4288468
37
3.1
37
92
5
180
39
17
5
37
1.72
4292765--4292857
39
2.5
37
80
7
98
27
29
22
20
1.98
4293001--4293061
24
2.4
26
82
17
76
31
27
0
40
1.57
4293951--4293985
16
2.2
16
89
0
52
2
14
8
74
1.17
4293988--4294051
31
2.2
29
80
8
76
48
1
1
48
1.20
4297207--4297313
35
3.1
35
91
0
178
20
23
11
44
1.83
4297474--4297525
26
2.0
26
100
0
104
19
11
19
50
1.77
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30
2.5
31
88
2
107
45
10
21
22
1.82
4301511--4301615
31
3.6
30
80
10
105
51
11
16
20
1.75
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17
3.2
17
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62
0
1
35
1.06
4303296--4303362
20
3.6
19
71
22
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61
0
1
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1.05
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13
2.0
13
100
0
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46
0
0
53
1.00
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19
2.0
20
89
5
60
73
0
0
26
0.83
4314764--4314805
23
1.9
23
85
9
61
57
0
2
40
1.12
4314998--4315040
24
1.9
24
86
13
65
58
2
0
39
1.11
4315019--4315069
17
2.9
17
81
16
52
45
3
0
50
1.20
4316125--4316171
23
2.0
23
83
0
58
51
4
0
44
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4332518--4332562
22
2.1
21
91
4
72
11
0
13
75
1.05
4332521--4332587
11
5.9
11
77
11
64
17
1
10
70
1.23
4349659--4349708
25
1.9
27
84
8
68
58
10
2
30
1.42
4350536--4350574
17
2.4
17
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4
53
25
0
5
69
1.09
4350699--4350759
28
2.2
27
82
8
70
47
0
3
49
1.18
4353815--4353859
13
3.7
13
77
14
51
15
0
4
80
0.87
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52
2.8
52
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3
175
25
15
26
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4356447--4356580
47
2.9
47
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4
139
25
13
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2.0
16
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0
55
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0
9
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1.34
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31
2.0
31
100
0
124
48
9
22
19
1.78

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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