Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  58  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18390262--18390343
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2.1
39
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0
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18390263--18390327
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2.1
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0
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1.98
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47
3.7
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0
271
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1.86
18391920--18392129
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30
28
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33
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18391941--18392091
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2.1
72
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0
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18391895--18392138
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2.1
119
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0
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2.0
166
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29
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2
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2.0
51
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0
200
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25
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0
100
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0
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2.1
22
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87
0.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.10
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146
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3.3
65
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0
1
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18448661--18448728
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0
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2.7
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2.0
253
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55
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1.81
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18
2.8
17
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78
52
2
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1.12
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220
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29
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93
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297
21
20
29
29
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0
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2.6
23
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2
57
25
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15
18
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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19
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1.90
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1.9
129
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2.0
20
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1.19
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2.0
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19
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21
2.2
21
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0
58
29
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0
63
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18582110--18582167
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0
1
65
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33
0
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18582103--18582148
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32
0
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3
1
59
1.24
18582105--18582244
50
2.9
48
81
10
126
32
7
2
56
1.43
18582504--18582555
26
2.0
26
88
0
77
28
7
3
59
1.43
18582516--18582576
26
2.5
26
79
12
67
31
6
4
57
1.46
18582744--18582775
15
2.1
15
94
0
55
31
3
0
65
1.08
18585306--18585438
63
2.1
63
81
0
149
30
33
9
26
1.89
18586595--18586686
21
4.4
22
72
20
65
68
3
21
6
1.27
18586634--18586684
22
2.3
23
83
6
70
72
1
21
3
1.11
18592835--18592917
41
2.0
42
83
2
105
27
15
20
36
1.93
18592835--18592928
42
2.3
41
83
1
107
27
14
22
35
1.94
18596748--18596860
55
2.1
55
91
3
183
35
7
23
34
1.82
18598209--18598292
27
3.1
27
83
13
127
34
22
23
19
1.96
18604494--18604589
42
2.3
41
78
8
104
28
17
20
33
1.96
18613213--18613258
24
1.9
24
81
0
56
41
4
39
15
1.67
18614601--18614654
27
2.0
27
85
7
74
27
20
20
31
1.97
18616413--18616465
22
2.5
21
78
6
61
62
5
3
28
1.35
18621822--18621855
18
1.9
17
88
5
50
20
11
2
64
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18623425--18623469
20
2.2
20
84
7
56
20
22
6
51
1.70
18640240--18640291
14
4.1
13
78
14
63
53
0
1
44
1.11
18640232--18640290
26
2.2
24
82
14
64
54
0
3
42
1.17
18641744--18641819
28
2.8
28
74
9
77
38
1
1
59
1.14
18641771--18641811
16
2.4
17
88
8
57
41
0
2
56
1.13
18641945--18642016
23
3.4
22
70
22
55
25
5
2
66
1.27
18642431--18642485
18
3.3
18
70
19
55
25
9
9
56
1.60
18642552--18642587
16
2.2
17
90
5
56
22
11
8
58
1.59
18643527--18643673
21
7.2
20
69
21
76
63
1
4
30
1.21
18643560--18643647
38
2.6
34
75
25
87
61
1
4
32
1.24
18645339--18646097
205
3.7
206
89
2
1125
28
20
18
32
1.96
18647924--18647973
22
2.3
22
93
3
84
42
6
28
24
1.78
18657930--18657978
14
3.8
13
76
15
57
53
0
2
44
1.12
18657922--18657975
26
2.1
24
83
13
63
53
0
3
42
1.18
18658145--18658206
17
3.5
17
77
12
61
66
1
4
27
1.21
18658194--18658298
7
14.1
7
73
18
70
60
0
3
36
1.15
18658187--18658269
36
2.5
33
81
18
93
60
0
4
34
1.18
18658184--18658307
44
3.1
38
76
20
110
62
0
4
33
1.14
18672893--18673084
47
4.1
47
84
1
224
22
16
28
32
1.96
18672913--18673112
94
2.1
94
79
6
217
25
15
28
31
1.96
18677853--18677917
32
2.0
32
96
0
121
38
23
6
32
1.79
18678862--18678893
8
4.0
8
91
0
55
59
0
0
40
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18678860--18678902
13
3.1
13
83
12
50
58
0
0
41
0.98
18678859--18678896
16
2.4
16
95
4
69
55
0
0
44
0.99
18678902--18678947
23
1.9
24
82
8
58
76
6
6
10
1.16
18680120--18680187
34
2.0
34
100
0
136
35
5
17
41
1.74
18687066--18687105
20
2.0
20
100
0
80
40
10
5
45
1.60
18688944--18688985
22
2.0
22
95
4
77
47
7
0
45
1.30
18698376--18698696
46
7.0
46
91
2
448
21
24
14
38
1.92
18700836--18700887
11
4.7
11
76
9
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3
0
32
1.12
18710105--18710146
20
2.1
20
100
0
84
59
11
9
19
1.59
18711512--18711705
67
2.9
69
80
7
209
35
18
6
39
1.76

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352