Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  54  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17422720--17422769
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
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0
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113
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1
54
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2.5
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46
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13
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35
23
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
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2
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57
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17591160--17591306
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1.83
17603605--17603831
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3.0
74
81
13
273
25
18
22
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17603810--17603844
14
2.5
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17
20
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57
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89
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2
441
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18
20
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1.96
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2.5
14
90
0
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22
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17
18
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14
2.5
14
95
0
61
17
22
5
54
1.64
17603675--17604484
254
3.1
256
87
5
1048
28
17
20
34
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17603988--17604484
179
2.8
179
82
8
649
28
17
18
34
1.94
17603605--17604484
343
2.6
339
87
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1158
27
17
20
34
1.95
17609054--17609092
18
2.2
18
86
9
53
35
10
0
53
1.35
17609011--17609088
30
2.5
31
78
14
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33
8
0
57
1.30
17609262--17609308
21
2.4
20
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19
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38
2
2
57
1.23
17609682--17609751
20
3.5
20
74
3
68
31
7
1
60
1.33
17612475--17612900
115
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24
2
13
59
1.46
17612573--17612900
114
2.9
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365
22
2
14
60
1.47
17612573--17612919
115
3.0
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2
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17619721--17619785
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3
6
27
1.33
17619849--17619905
15
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15
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1
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1.18
17619894--17619953
14
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14
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58
0
6
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1.24
17619933--17619974
20
2.2
19
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4
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59
0
7
33
1.25
17620045--17620074
3
10.0
3
100
0
60
66
0
0
33
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.7
210
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1
1636
29
22
19
29
1.98
17630870--17630899
14
2.1
14
93
0
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46
3
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43
1.46
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14
5.4
14
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26
50
63
2
2
30
1.22
17634811--17634861
15
3.3
15
75
17
50
60
1
1
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20
2.2
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4
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59
0
7
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1.25
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3
100
0
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0
0
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0
0
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0
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0
0
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0
0.91
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2.1
19
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1.91
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0
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17657722--17657907
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2.3
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88
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208
27
18
19
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54
2.6
54
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0
237
29
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107
2.3
108
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276
27
17
19
35
1.94
17657910--17658051
27
5.3
27
88
0
203
28
11
21
38
1.88
17658034--17658110
27
2.9
27
74
0
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31
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38
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81
2.1
81
81
4
194
30
10
21
37
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17659065--17659102
17
2.2
18
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13
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7
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0
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0
0
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0.96
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0
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0
0
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0
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0
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9
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1088
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29
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1.90
17675455--17675718
40
6.6
39
83
6
203
25
22
27
25
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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