Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  260  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85712230--85712259
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0
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0
2154
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11
12
35
1.80
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15
1.9
15
100
0
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2.0
183
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2.1
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33
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2.0
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3.0
16
79
17
55
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6
2
45
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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85724472--85724659
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3.1
61
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2
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1.41
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0
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0
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0
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12
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0
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1.61
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43
3.7
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15
25
27
1.96
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3.9
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2
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2
46
1.56
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27
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1.99
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27
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361
34
10
16
38
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85829693--85830008
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10
16
38
1.83
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121
2.0
121
98
0
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15
9
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1.78
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93
94
0
308
28
29
20
20
1.98
85849006--85849181
46
3.8
46
80
12
216
29
29
20
20
1.98
85852652--85852831
40
4.5
40
83
3
202
28
26
21
23
1.99
85859435--85859645
40
5.3
40
89
2
257
27
27
21
23
1.99
85866733--85866861
46
2.8
46
89
0
186
31
27
20
20
1.98
85869205--85869241
18
2.1
18
89
0
56
43
18
21
16
1.88
85870082--85870110
7
4.1
7
100
0
58
72
0
13
13
1.13
85870069--85870110
21
2.0
21
81
9
50
73
0
14
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1.09
85877427--85877473
18
2.7
18
90
3
69
46
4
12
36
1.62
85877726--85877801
40
1.9
40
91
0
125
22
15
28
32
1.95
85877812--85877865
28
1.9
28
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0
72
29
11
29
29
1.91
85892675--85892797
46
2.8
44
84
7
176
22
19
31
26
1.98
85897042--85897075
18
1.9
18
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5
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14
23
1.76
85897627--85897729
27
3.8
26
83
7
107
35
21
22
20
1.96
85897655--85897729
28
2.8
27
87
4
107
33
22
22
21
1.97
85897950--85898010
27
2.2
28
80
8
72
32
19
21
26
1.97
85897962--85898100
27
5.1
27
92
0
197
28
20
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85898097--85898441
27
12.8
27
81
5
367
39
8
22
29
1.84
85898097--85898441
81
4.3
81
82
2
426
39
8
22
29
1.84
85900437--85900470
18
1.9
17
88
5
50
50
14
14
20
1.78
85901042--85901131
27
3.3
28
81
10
105
40
21
18
20
1.92
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2.1
54
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3
120
29
16
22
31
1.96
85901366--85901507
27
5.3
27
85
0
176
28
17
17
35
1.93
85901464--85901549
27
3.2
27
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11
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37
10
20
31
1.87
85901360--85901534
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2.2
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32
15
18
33
1.92
85901501--85901845
27
12.8
27
83
4
365
40
8
22
28
1.84
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54
6.4
54
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3
403
40
8
22
28
1.84
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532
6.0
532
95
0
5652
28
29
14
28
1.95
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2.5
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80
11
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66
3
7
23
1.33
85917695--85917720
9
2.9
9
100
0
52
34
23
19
23
1.96
85918497--85918637
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2.4
58
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3
160
29
24
17
27
1.97
85937413--85937541
48
2.7
48
83
0
159
25
24
19
30
1.98
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2.0
35
88
0
106
36
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16
2.7
17
80
12
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36
8
21
34
1.84
85941406--85941522
41
2.9
41
89
0
180
25
28
23
23
1.99
85941786--85941892
27
4.0
27
75
4
90
33
12
15
38
1.85
85941859--85941919
26
2.3
26
85
2
77
36
6
13
44
1.69
85941938--85941996
26
2.2
26
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8
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32
10
18
38
1.84
85942021--85942075
26
2.1
27
93
3
94
32
10
16
40
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85942064--85942166
27
3.9
27
80
2
127
28
17
17
36
1.93
85943676--85943864
36
5.0
36
81
12
193
26
21
15
36
1.93
85943676--85943814
73
1.9
70
87
7
199
25
21
15
37
1.93
85943783--85944147
52
7.6
46
84
8
385
29
22
13
34
1.93
85943824--85944141
52
6.3
52
84
7
399
28
22
13
34
1.92
85943782--85944147
98
3.8
97
81
11
402
29
22
13
34
1.93
85943945--85944147
46
4.3
43
84
7
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22
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2
301
31
29
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1.95
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37
4.0
37
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3
224
24
22
15
36
1.94
85948894--85949038
73
2.0
72
89
4
220
24
22
15
36
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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