Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  14  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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1
46
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4533489--4533535
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18
70
10
0
44
46
1.37
4584188--4584223
16
2.2
16
90
0
54
41
0
11
47
1.39
4587740--4587797
30
1.9
30
89
0
89
48
15
5
31
1.67
4588267--4588312
5
9.0
5
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4
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39
0
0
60
0.97
4588329--4588389
30
2.0
30
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59
6
34
0
1.24
4589856--4589990
39
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39
76
8
123
23
20
27
28
1.99
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131
2.9
131
80
3
447
34
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18
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1.94
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33
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1
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4598539--4598625
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0
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0
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17
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0
33
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0.92
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3
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1.62
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39
2.7
39
88
5
146
39
9
16
34
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4601319--4601426
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2.7
39
87
5
146
39
9
16
34
1.81
4610851--4610948
41
2.3
43
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5
110
34
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16
26
1.95
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2.2
52
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3
189
37
0
7
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1.29
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30
3.5
30
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100
40
0
5
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3.1
23
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0
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3.0
33
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24
1.87
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16
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16
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8
22
1.83
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2.0
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0
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1.85
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2.0
44
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2
113
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1.75
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2.0
20
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0
2
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2.0
20
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0
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15
2.1
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54
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35
1.42
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21
3.4
20
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16
70
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7
1
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1.37
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1.9
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1.75
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19
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0
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0
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1.22
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0
0
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3
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0
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0
0
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47
0
4
47
1.23
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7
5.3
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72
0
13
13
1.13
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6
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6
90
3
58
67
0
17
14
1.22
4656186--4656240
13
4.3
13
80
11
69
69
0
16
14
1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4656231--4656271
21
2.0
21
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0
55
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2
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7
0.91
4658285--4658309
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0
50
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0
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2.1
21
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4
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1.55
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31
2.5
31
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1
0
50
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2.2
45
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130
30
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4691369--4691416
24
2.1
23
85
11
64
31
14
0
54
1.41

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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