Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  34  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10984213--10984315
38
2.7
39
85
7
97
21
25
22
31
1.98
10984231--10984315
38
2.2
38
89
6
127
22
23
21
32
1.98
10988628--10988753
60
2.1
61
82
4
148
42
3
7
46
1.49
10994569--10994686
29
3.9
30
75
14
111
55
2
2
38
1.27
10994569--10994683
32
3.8
30
72
13
94
56
2
2
38
1.27
10994619--10994696
30
2.6
30
78
11
88
57
2
1
38
1.20
10996704--10997054
181
2.0
174
85
6
472
29
18
13
39
1.89
11003512--11003545
15
2.3
15
89
0
50
35
14
2
47
1.60
11007660--11007699
12
3.1
13
79
13
55
40
17
5
37
1.72
11008622--11008662
18
2.3
18
91
0
64
46
0
2
51
1.14
11009604--11009675
31
2.3
31
83
4
83
37
6
8
47
1.61
11010446--11010491
19
2.3
20
88
7
76
23
15
13
47
1.80
11010855--11010911
29
2.0
29
100
0
114
38
17
12
31
1.87
11011874--11011966
32
2.9
32
95
0
159
51
16
3
29
1.59
11011874--11011979
32
3.5
30
83
11
128
51
17
2
27
1.59
11014137--11014170
16
2.1
17
88
5
52
55
8
11
23
1.63
11014725--11014765
19
2.2
19
86
8
57
68
4
2
24
1.22
11016516--11016830
119
2.6
119
91
1
497
27
20
19
32
1.97
11016639--11017024
202
1.9
202
87
1
558
30
20
17
32
1.95
11016837--11017189
118
3.0
118
92
0
571
31
19
15
33
1.93
11028537--11028570
16
2.1
17
88
5
52
55
8
11
23
1.63
11029123--11029163
19
2.2
19
86
8
57
68
4
2
24
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11033687--11033719
17
1.9
17
93
0
57
54
21
9
15
1.68
11038390--11038417
11
2.5
11
100
0
56
57
10
7
25
1.58
11043699--11043766
27
2.5
27
83
11
77
57
5
7
29
1.50
11044309--11044343
3
11.7
3
100
0
70
65
0
0
34
0.93
11044428--11044557
3
43.7
3
72
15
101
63
2
5
29
1.29
11044470--11044557
26
3.5
26
76
15
78
64
2
3
29
1.22
11044454--11044552
23
4.5
23
80
9
73
61
3
5
30
1.32
11044598--11044649
21
2.7
20
77
13
56
57
1
13
26
1.47
11044598--11044643
21
2.2
21
84
7
58
58
2
10
28
1.43
11044708--11044770
3
20.7
3
74
9
56
63
1
4
30
1.24
11048467--11048507
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
11051961--11052013
27
2.0
27
92
3
90
30
33
22
13
1.92
11051929--11052299
104
3.6
104
95
1
629
30
30
20
18
1.97
11052170--11052220
26
2.0
26
96
0
93
29
35
23
11
1.90
11052627--11052690
30
2.2
29
81
10
76
29
28
6
35
1.82
11052634--11052690
30
1.9
30
85
3
80
29
24
7
38
1.82
11057637--11057780
6
24.0
6
100
0
288
33
0
16
50
1.46
11058473--11058558
43
2.0
43
93
0
145
25
5
32
36
1.80
11059065--11059194
47
2.7
47
86
2
170
22
23
20
33
1.97
11063365--11063399
2
17.5
2
100
0
70
0
0
48
51
1.00
11072062--11072100
7
5.4
7
96
3
69
28
0
0
71
0.86
11073599--11073734
46
3.0
46
84
4
159
22
24
12
41
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11074173--11074240
23
2.9
24
77
12
70
32
20
30
16
1.94
11076325--11076365
21
1.9
22
90
5
66
46
7
0
46
1.30
11080690--11080732
13
3.3
13
80
9
52
74
2
0
23
0.93
11080992--11081305
161
2.0
161
97
0
592
15
22
20
41
1.90
11081513--11081540
2
14.0
2
100
0
56
0
0
50
50
1.00
11081696--11081752
15
3.9
15
88
2
89
35
0
12
52
1.39
11081692--11081750
30
2.0
28
93
6
100
32
0
11
55
1.36
11082118--11082203
44
2.0
41
86
6
118
17
25
24
32
1.97
11082136--11082206
21
3.3
21
92
4
115
14
26
26
32
1.94
11082147--11082217
21
3.4
21
92
0
97
16
28
25
29
1.97
11082123--11082231
42
2.5
42
82
2
119
17
22
23
35
1.95
11082393--11082433
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
11085674--11085711
20
1.9
20
89
10
60
76
13
10
0
1.02
11086063--11086143
39
2.1
39
97
0
153
11
39
37
12
1.78
11091794--11091825
12
2.7
12
90
0
55
0
9
0
90
0.45
11091894--11091926
17
1.9
17
93
0
57
51
0
9
39
1.34
11092611--11092894
141
2.0
141
99
0
561
31
21
15
32
1.94
11104278--11104321
22
2.0
22
82
8
54
38
13
18
29
1.89
11104548--11104809
40
6.6
40
93
1
429
28
26
22
22
1.99
11113168--11113197
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
11113932--11113961
15
1.9
16
93
6
53
53
0
3
43
1.17
11115747--11115784
20
1.9
20
89
10
60
60
0
7
31
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11117875--11117905
14
2.2
14
100
0
62
35
32
6
25
1.82
11122624--11122663
13
3.2
13
80
19
50
27
25
0
47
1.52
11122613--11122663
26
2.0
24
85
14
68
29
25
0
45
1.54
11123288--11123340
15
3.5
15
81
0
70
49
11
1
37
1.50
11124185--11124223
19
2.1
19
95
0
69
33
5
10
51
1.58
11124188--11124231
19
2.4
19
78
17
56
34
6
9
50
1.61
11125887--11125944
20
2.8
20
94
2
98
48
44
0
6
1.29
11128425--11128460
12
3.0
12
95
0
63
27
25
5
41
1.77
11136734--11136904
69
2.5
67
83
6
193
28
14
23
34
1.93
11136904--11137069
72
2.3
71
87
4
235
22
15
20
41
1.89
11137002--11137770
140
5.5
140
96
1
1398
25
17
20
37
1.93
11137608--11137641
13
2.5
13
90
4
50
20
11
8
58
1.59
11137695--11138222
72
7.0
74
85
4
551
31
17
18
32
1.94
11137691--11138598
244
3.9
223
78
11
727
30
17
18
33
1.94
11138144--11138315
93
1.8
93
87
2
256
27
20
19
32
1.97
11138216--11138808
88
7.2
77
71
17
374
27
16
18
36
1.93
11138215--11138598
79
4.7
78
76
12
283
28
17
18
35
1.94
11137996--11138808
252
3.3
241
82
8
887
28
16
19
34
1.94
11138581--11138640
30
2.1
30
90
6
97
20
10
30
40
1.85
11139467--11139516
20
2.5
21
83
9
68
68
28
0
4
1.08
11139467--11139516
21
2.5
20
83
6
66
68
28
0
4
1.08
11140296--11140363
19
3.5
19
71
16
50
32
5
4
57
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11140284--11140363
21
4.2
19
67
22
60
31
5
6
57
1.45
11144446--11144485
13
3.2
13
80
19
50
25
25
0
50
1.50
11144433--11144473
18
2.2
19
87
12
59
29
24
0
46
1.53
11145118--11145164
15
3.1
15
81
0
67
48
12
2
36
1.53
11146006--11146044
19
2.1
19
90
0
60
33
7
10
48
1.66
11148726--11148938
118
1.8
118
95
0
390
28
31
17
22
1.96
11149901--11149958
6
10.3
6
87
12
88
82
0
0
17
0.66
11149908--11149951
21
2.1
21
100
0
88
81
0
0
18
0.68
11149906--11149957
27
1.9
27
100
0
104
82
0
0
17
0.66
11157471--11157501
14
2.2
14
94
0
53
35
29
9
25
1.88
11167081--11167115
17
2.0
17
94
5
61
28
2
0
68
1.04
11167083--11167122
17
2.3
18
86
4
55
27
2
2
67
1.16
11167082--11167123
18
2.3
18
88
8
59
26
2
2
69
1.13
11177127--11177160
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
11181766--11181799
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
11196162--11196186
5
5.0
5
100
0
50
80
0
20
0
0.72
11200380--11200433
25
2.1
26
83
10
67
68
5
1
24
1.21
11208285--11208329
14
3.2
14
83
0
63
37
6
15
40
1.74
11208413--11208484
38
1.9
38
83
10
96
38
2
2
55
1.29
11210317--11210380
18
3.6
18
76
14
69
57
21
3
17
1.53
11211062--11211155
48
2.0
47
95
2
170
55
17
20
7
1.65
11214165--11214267
49
2.1
50
85
1
136
28
17
33
21
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11215801--11215860
25
2.4
25
82
0
75
28
15
30
26
1.96
11215998--11216076
26
3.2
25
71
21
85
34
25
18
21
1.96
11218386--11218558
93
1.9
93
91
2
285
28
30
20
21
1.98
11218379--11218554
46
3.8
46
76
11
180
29
29
19
21
1.98
11218430--11218573
46
3.1
44
70
21
107
29
28
19
22
1.98
11221072--11221160
30
3.0
30
77
8
92
57
14
16
11
1.65
11221072--11221151
15
5.4
15
77
7
83
58
12
17
11
1.62
11221083--11221160
15
5.2
15
74
9
61
56
14
16
12
1.68
11224095--11224269
46
3.8
46
75
15
171
28
29
20
21
1.98
11224146--11224289
46
3.1
45
71
14
123
29
27
20
23
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352