Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  9  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2784952--2785069
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3.2
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2785199--2785365
80
2.1
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1
255
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5
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1.71
2785199--2785329
39
3.2
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151
21
4
51
22
1.65
2785835--2786042
85
2.5
86
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252
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1.75
2785850--2786042
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289
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1.72
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1.8
169
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0
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2805466--2805511
19
2.4
19
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65
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39
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15
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2
62
37
2
12
47
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
19
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0
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2.1
22
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2.2
26
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52
0
1
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100
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2.5
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1
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1.33
2842926--2842979
24
2.3
23
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12
1
29
1.48
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2.1
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92
0
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9
37
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28
2.2
26
77
11
66
26
26
11
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1.91
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28
2.6
28
88
0
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29
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30
1.93
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29
12.5
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242
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35
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17
1.94
2864840--2865141
29
10.6
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2
288
28
36
17
16
1.92
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57
6.2
57
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1
516
29
36
17
17
1.93
2864840--2865169
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3.8
86
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2
367
28
36
17
16
1.93
2867083--2867142
28
2.2
26
77
11
66
26
26
11
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1.91
2867097--2867168
28
2.6
28
88
0
99
29
27
12
30
1.93
2870341--2870410
34
2.1
34
97
0
131
38
5
15
40
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
81
0
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21
58
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10
1.59
2875394--2875428
15
2.3
15
85
0
52
22
54
11
11
1.68
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29
2.2
30
83
2
78
41
0
9
49
1.35
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21
1.9
19
85
15
51
39
21
31
7
1.82
2902305--2902377
4
18.2
4
83
5
76
24
5
24
45
1.74
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20
1.9
20
84
10
51
39
0
5
55
1.23
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2.0
26
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1
50
1.12
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1.32
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22
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27
9
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1.87
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2.6
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5
163
28
28
8
35
1.86
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2.3
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0
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0
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1.08
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3.7
15
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61
5
5
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1.40
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44
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3
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2
1
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0
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0
0
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561
51
4
1
42
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2924345--2924816
117
4.3
117
78
16
522
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4
1
42
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2.0
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0
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0
0
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26
66
23
89
53
3
1
41
1.26
2924382--2924816
217
2.0
207
92
5
719
51
4
1
42
1.30
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20
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5
0
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0
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0
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2.0
54
98
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207
58
14
20
5
1.56
2952928--2953001
30
2.4
30
82
8
87
40
0
8
51
1.32
2956671--2956753
30
2.7
30
86
3
103
54
6
7
32
1.52
2956730--2956784
28
2.0
27
89
3
83
63
3
1
30
1.22
2964352--2964403
18
2.7
20
79
8
63
42
1
0
55
1.10
2964366--2964425
23
2.7
23
78
17
72
43
1
0
55
1.10
2964366--2964425
22
2.7
22
80
14
70
43
1
0
55
1.10
2966303--2966383
20
4.0
21
74
17
64
41
9
3
44
1.55
2966325--2966383
27
2.2
27
81
6
66
42
11
3
42
1.58
2966386--2966424
20
2.0
20
84
0
51
38
10
12
38
1.78
2967982--2968033
26
2.0
26
96
0
95
34
25
19
21
1.96
2967987--2968043
26
2.2
26
84
6
71
33
28
22
15
1.95
2982506--2982552
23
2.0
23
84
8
60
44
4
0
51
1.21
2982711--2982763
23
2.3
23
80
3
63
13
13
3
69
1.31
2990813--2990851
18
2.2
18
86
13
55
76
0
0
23
0.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2991225--2991274
21
2.5
20
84
12
59
44
0
2
54
1.11
2991498--2991589
40
2.2
40
81
11
98
56
3
3
36
1.32
2992228--2992257
14
2.1
15
93
6
53
40
0
0
60
0.97
2992235--2992273
19
2.0
20
90
5
62
35
0
0
64
0.94
3003598--3003631
18
1.9
18
88
5
52
44
2
2
50
1.32
3004055--3004093
14
2.8
14
88
0
51
56
33
0
10
1.33
3004789--3004893
41
2.6
41
90
0
165
26
26
18
28
1.98
3011701--3011893
47
4.0
48
81
8
196
23
17
28
30
1.97
3013618--3013951
35
9.5
35
85
1
411
31
13
23
31
1.93
3015468--3015527
30
2.0
30
90
0
93
55
10
3
31
1.50
3028611--3028651
21
2.0
21
90
0
64
29
21
29
19
1.98
3032536--3032613
29
2.6
30
79
18
92
58
5
7
28
1.47
3050373--3050397
9
2.8
9
100
0
50
60
0
20
20
1.37
3051438--3051573
66
2.1
66
100
0
272
37
19
10
32
1.86
3053801--3053831
16
1.9
16
93
0
53
35
3
0
61
1.12
3056272--3056323
21
2.4
21
81
9
61
32
1
7
57
1.38
3063217--3063275
21
2.7
21
82
14
75
30
1
0
67
1.00
3063219--3063271
11
4.7
11
76
4
52
28
1
0
69
0.99
3063217--3063275
22
2.8
21
80
10
66
30
1
0
67
1.00
3076847--3076924
39
2.0
39
100
0
156
43
7
7
41
1.62
3081047--3081096
22
2.2
24
82
13
61
62
8
4
26
1.41
3085628--3085653
3
8.7
3
100
0
52
34
30
34
0
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3092560--3092593
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
3097200--3097233
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
3099401--3099466
33
2.0
33
90
0
105
21
15
10
53
1.72
3099513--3099539
10
2.7
10
100
0
54
0
7
0
92
0.38
3099506--3099531
13
2.0
13
100
0
52
0
7
0
92
0.39
3105079--3105103
3
8.3
3
100
0
50
0
32
0
68
0.90
3109175--3109229
30
1.9
29
82
17
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40
3
5
50
1.43
3118889--3118963
24
3.2
24
69
17
75
57
5
16
21
1.58
3118889--3118971
26
3.4
26
67
21
70
57
4
16
20
1.57
3118867--3118983
47
2.5
47
87
2
173
57
4
17
21
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352