Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  334  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107254747--107254803
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
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Period
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Copy
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Score
A
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3
14.0
3
100
0
84
66
0
0
33
0.92
107376560--107376766
72
2.9
72
82
4
247
38
18
14
28
1.90
107380441--107380508
28
2.3
30
75
10
68
50
2
1
45
1.26
107381528--107381564
9
4.1
9
85
0
56
48
10
10
29
1.72
107384091--107384122
16
2.0
16
93
0
55
81
9
0
9
0.88
107387046--107387154
26
4.2
26
92
1
182
35
23
7
33
1.83
107394182--107394289
26
4.2
26
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0
198
37
26
5
30
1.79
107395731--107395853
43
2.8
43
74
3
104
30
8
4
55
1.52
107395832--107395918
4
21.8
4
69
13
54
29
2
2
65
1.17
107395836--107395916
12
7.3
11
71
21
62
30
2
2
64
1.20
107395856--107395907
16
3.2
16
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2
68
32
1
0
65
1.04
107395856--107395922
13
4.7
15
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31
2
0
65
1.07
107395868--107395921
17
3.2
18
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17
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1
0
68
1.00
107396150--107396211
29
2.1
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0
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1.37
107398094--107398144
14
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14
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39
5
1
52
1.37
107402014--107402078
32
2.0
32
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0
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24
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107405307--107405446
39
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1
228
13
24
22
39
1.90
107405385--107405448
18
3.4
18
73
12
65
14
23
25
37
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107409241--107409279
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2.3
17
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0
51
33
2
5
58
1.33
107409380--107409436
27
2.1
28
77
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38
3
0
57
1.16
107409390--107409445
27
2.1
27
86
3
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39
1
0
58
1.08
107409453--107409546
26
3.6
26
79
2
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28
5
7
58
1.47
107411164--107411401
122
1.9
123
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0
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32
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37
1.87
107415205--107415276
35
2.1
35
97
0
135
34
2
25
37
1.70
107422465--107422493
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2.0
15
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17
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0
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1.47
107431803--107432011
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2.9
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38
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13
28
1.90
107436199--107436745
273
2.0
273
100
0
1094
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12
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1.85
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1.9
25
82
0
60
27
14
8
50
1.71
107447026--107447072
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2.0
24
100
0
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10
25
1.90
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1.9
16
93
0
53
16
35
0
48
1.46
107447699--107447735
6
6.2
6
100
0
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32
16
0
51
1.45
107448578--107448619
20
2.1
20
100
0
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1.95
107449737--107449826
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2.6
34
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0
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14
10
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1.71
107452087--107452152
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1
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1.19
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131
1.9
131
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285
27
16
17
38
1.91
107457288--107457434
3
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3
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66
57
1
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30
1.42
107457565--107457669
3
34.3
3
70
11
52
60
2
6
30
1.37
107457736--107457775
16
2.5
16
83
0
53
62
0
7
30
1.23
107460475--107460568
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4
6
30
1.42
107460481--107460538
14
4.3
14
77
16
68
58
5
5
31
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107460474--107460543
20
3.5
20
82
1
79
57
4
7
31
1.45
107460822--107460863
12
3.3
12
86
6
57
59
2
9
28
1.41
107460774--107460871
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4.6
21
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13
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58
2
10
29
1.43
107460839--107460896
16
3.9
15
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14
50
55
0
10
34
1.34
107460956--107461163
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30
1.40
107460956--107461008
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0
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2.2
23
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1.40
107465354--107465380
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100
0
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0
0
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107465888--107465920
14
2.3
15
89
5
50
21
6
6
66
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352