Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  27  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8691976--8692014
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20
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0
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0
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2.0
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24
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0
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46
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8755879--8756181
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315
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2.0
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25
0
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56
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8777706--8777790
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43
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8782683--8782724
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1.9
22
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2
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1.27
8783906--8783937
15
2.2
15
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0
0
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2.4
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18
2.4
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12
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2.8
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11
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8807331--8807521
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3.5
54
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169
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13
12
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1.82
8807331--8807523
18
10.7
18
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146
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4.4
45
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2
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19
19
1.92
8807712--8807909
88
2.2
89
88
1
290
39
21
19
19
1.92
8808318--8808374
5
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5
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60
42
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11
0
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1.12
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3.3
13
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16
11
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1.13
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2.0
29
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10
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11
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22
2.0
22
100
0
90
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22
17
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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0
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2.2
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5
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38
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2.0
20
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0
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1.24
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2.0
98
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14
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32
1.94
8851896--8852098
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4.0
51
81
9
227
24
14
29
32
1.94
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2.0
19
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0
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0
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0
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7
61
58
2
2
37
1.24
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2.2
16
100
0
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3
4
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1.38
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25
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2
6
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0
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0
0
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16
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36
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1.58
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200
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1.97
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1.8
94
93
1
301
29
29
19
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8894223--8894713
176
2.8
176
90
2
781
29
18
22
29
1.97
8896141--8896187
22
2.1
21
84
7
58
38
0
2
59
1.09
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21
2.3
20
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10
51
43
4
4
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1.41
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80
44
0
1
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0
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0
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0
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36
1.75
8935348--8935425
39
2.0
39
94
0
138
35
15
3
44
1.65
8937645--8937698
21
2.8
20
89
10
85
70
3
3
22
1.19
8937673--8937798
9
14.0
9
69
17
59
62
3
0
33
1.16
8937685--8937738
26
2.1
26
83
13
67
62
0
0
37
0.95
8937748--8937798
17
2.9
18
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66
1
0
31
1.03
8938470--8938524
9
5.7
10
78
18
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1
0
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1.10
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10
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11
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10
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40
0
0
59
0.97
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20
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20
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2
4
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1.31
8938562--8938597
18
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2
0
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1.06
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1
0
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1.14
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26
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56
2
0
41
1.11
8941590--8941712
18
7.0
17
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17
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2
0
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1.16
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1
0
41
1.10
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4
7.2
4
100
0
58
0
24
0
75
0.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.2
17
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10
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1
0
63
1.05
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87
2.5
87
81
6
239
33
9
21
36
1.85
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19
2.3
19
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4
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22
13
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1.72
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21
2.0
22
90
4
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28
2
47
21
1.63
8950511--8950552
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10
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1.63
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18
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0
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2.0
22
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2
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21
1.63
8955184--8955225
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10
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1.63
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1
0
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2
1
70
1.11
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2.9
21
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3
1
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1.11
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25
2.5
26
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28
1
0
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0.97
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1.25
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0
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0
0
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22
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2.1
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2.0
132
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1.74
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17
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0
0
31
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2.0
14
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0
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7
0
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2.0
19
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2
0
52
1.14
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26
2.5
26
77
0
69
33
19
7
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8999119--8999230
45
2.5
45
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0
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18
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9000322--9000369
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24
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0
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2.0
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2
0
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0
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31
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0
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2.9
11
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4
55
70
0
0
29
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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