Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  60  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18955560--18955597
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22
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1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
21
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10
2
47
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
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63
68
5
0
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10
169
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16
25
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19103041--19103154
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18
25
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6
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0
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17
20
14
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12
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47
18
0
34
1.49
19115228--19115270
14
3.1
14
86
3
61
72
0
11
16
1.13
19115995--19116120
53
2.4
53
87
0
180
17
19
23
39
1.92
19116228--19116376
79
1.9
79
83
8
196
34
12
14
38
1.84
19116191--19116393
18
10.9
18
72
11
133
36
11
13
38
1.81
19118035--19118091
26
2.2
26
84
6
71
52
3
3
40
1.35
19118065--19118112
22
2.3
21
86
10
64
54
2
2
41
1.24
19121677--19121742
31
2.1
31
83
5
80
39
6
7
46
1.57
19121845--19121869
10
2.5
10
100
0
50
64
16
8
12
1.49
19122775--19123438
140
4.8
138
82
6
733
30
23
18
27
1.98
19125057--19125090
7
4.9
7
92
0
59
67
2
0
29
1.05
19126669--19126698
15
2.0
15
93
0
51
56
0
0
43
0.99
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21
2.0
22
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4
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45
4
2
47
1.36
19128638--19128686
20
2.5
20
75
0
53
30
6
2
61
1.32
19129477--19129524
26
1.9
24
87
8
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25
6
4
64
1.35
19129863--19129972
54
2.0
54
100
0
220
44
10
20
24
1.83
19131948--19132045
46
2.1
46
88
0
142
42
23
14
19
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19134275--19134624
174
2.0
173
90
0
547
31
19
8
40
1.82
19138664--19138712
18
2.7
18
83
3
71
63
0
2
34
1.06
19139964--19140003
21
1.9
21
84
0
53
37
2
2
57
1.26
19143288--19143352
31
2.1
31
100
0
130
40
6
20
33
1.77
19147990--19148053
19
3.4
19
77
12
60
26
3
1
68
1.13
19149346--19149375
13
2.2
14
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5
53
33
26
10
30
1.89
19149697--19149751
27
2.1
25
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6
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1
0
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1.11
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0
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1.15
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2.1
23
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15
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39
0
2
58
1.10
19149903--19149959
23
2.6
24
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13
61
40
3
1
54
1.28
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2.0
25
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7
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46
4
0
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1.20
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2.1
31
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0
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6
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1.56
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25
2.0
24
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4
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29
6
2
62
1.31
19156216--19156241
2
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2
100
0
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50
0
0
50
1.00
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205
29
29
20
20
1.98
19170993--19171136
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3.1
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20
1.97
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2.1
12
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0
50
32
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1.76
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80
2.0
80
97
0
302
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17
12
26
1.84
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18
1.9
19
88
11
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71
0
5
22
1.07
19193254--19193314
22
2.7
23
80
14
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52
6
1
39
1.37
19195750--19195815
31
2.1
32
91
2
107
28
0
18
53
1.45
19195779--19195831
23
2.5
22
85
14
67
28
1
15
54
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19199988--19200191
53
3.8
53
74
4
140
38
17
22
21
1.93
19201496--19201552
27
2.1
27
90
0
87
28
15
17
38
1.91
19202257--19202329
31
2.3
32
83
6
87
41
0
5
53
1.24
19207714--19207792
3
26.0
3
71
12
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59
5
7
27
1.46
19207713--19207771
30
2.0
30
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84
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8
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25
1.51
19207735--19207784
21
2.4
21
93
0
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6
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28
1.44
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2.7
15
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10
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0
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0
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0.83
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11
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0
5
13
0.85
19208921--19208961
15
2.5
17
80
7
50
0
17
21
60
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352