Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  22  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7009238--7009271
11
3.0
11
91
4
50
32
0
0
67
0.91
7009238--7009269
15
2.1
15
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5
55
31
0
0
68
0.90
7009127--7009260
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2.2
63
82
8
159
26
4
5
63
1.37
7009844--7009911
30
2.3
30
84
5
84
47
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19
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1.72
7012336--7012747
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9.0
46
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0
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38
15
23
22
1.93
7013552--7013795
126
1.9
126
94
0
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18
14
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1.90
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21
2.1
21
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0
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37
22
24
15
1.93
7019894--7019973
15
5.3
15
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15
60
75
2
21
1
1.00
7019891--7019957
12
5.2
13
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18
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1
20
0
0.85
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2.6
27
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15
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1
20
0
0.84
7019920--7019967
17
2.7
18
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3
53
77
2
18
2
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1.9
46
81
4
106
28
22
24
24
1.99
7021226--7021666
179
2.5
176
89
2
704
30
21
22
24
1.99
7021508--7021970
132
3.5
133
81
6
575
30
22
23
24
1.99
7021494--7021970
265
1.8
263
91
1
785
29
22
23
24
1.99
7021512--7022028
132
3.9
131
80
7
523
31
22
22
23
1.99
7021983--7022716
87
8.5
87
80
5
717
31
22
23
22
1.98
7022137--7022271
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3.1
43
63
14
114
34
25
22
16
1.95
7022154--7022712
172
3.3
171
89
2
824
30
23
26
20
1.99
7022154--7022715
85
6.6
85
85
3
736
29
23
25
20
1.99
7022953--7023016
29
2.2
29
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5
94
31
51
1
15
1.53
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37
2.0
37
100
0
150
29
54
0
16
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7022998--7023070
18
4.0
18
71
16
69
27
56
0
16
1.41
7023955--7024198
126
1.9
126
91
0
398
31
16
13
38
1.87
7033102--7033499
135
3.0
135
82
3
525
26
23
20
29
1.99
7035260--7035337
28
2.7
29
74
9
70
53
1
2
42
1.22
7035271--7035338
31
2.3
28
78
9
73
54
1
2
41
1.24
7035485--7035518
16
2.1
16
94
0
59
73
5
14
5
1.21
7036212--7036260
18
2.7
18
93
0
80
36
0
8
55
1.30
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3
16.0
3
82
0
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0
6
58
1.23
7036214--7036261
12
4.0
12
91
0
69
35
0
6
58
1.23
7036402--7036473
24
2.9
24
78
15
67
44
0
22
33
1.53
7036617--7036712
39
2.5
39
80
6
108
20
23
28
27
1.99
7049500--7049590
46
2.0
46
82
0
110
42
3
30
23
1.70
7051673--7051719
23
2.0
23
95
0
85
55
4
19
21
1.60
7055522--7055590
35
2.0
35
100
0
138
21
23
11
43
1.85
7071389--7071440
26
2.0
26
81
7
61
51
3
0
44
1.19
7086073--7086135
28
2.2
28
91
0
99
31
6
30
31
1.83
7087925--7088173
50
4.8
50
85
4
284
20
29
24
25
1.99
7087924--7088173
100
2.4
104
88
6
357
20
29
24
25
1.99
7088268--7088299
13
2.5
13
94
0
55
56
12
0
31
1.37
7088511--7088568
30
1.9
30
89
0
89
31
24
3
41
1.71
7094221--7094280
28
2.1
28
84
0
75
33
5
28
33
1.79
7094438--7094514
25
3.1
26
68
24
67
48
2
2
46
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7111595--7111753
76
2.1
76
98
1
309
30
13
17
38
1.88
7114307--7114368
12
5.9
10
74
22
56
64
3
3
29
1.25
7114321--7114352
3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
7115660--7116131
44
10.8
44
71
11
260
28
22
18
30
1.97
7115639--7116044
175
2.4
170
87
2
571
29
21
18
30
1.97
7128709--7128770
12
5.9
10
74
22
56
64
3
3
29
1.25
7128723--7128754
3
10.7
3
93
0
55
65
0
3
31
1.08
7132763--7132797
17
2.1
17
89
10
54
45
2
5
45
1.41
7136883--7136921
6
6.5
6
96
0
69
0
12
48
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1.42
7138853--7138894
6
7.0
6
94
0
57
16
4
59
19
1.54
7142194--7142282
44
2.0
44
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2
171
43
2
24
29
1.66
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45
2.6
45
84
0
151
37
17
24
21
1.94
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46
3.5
46
89
0
254
43
16
22
17
1.88
7152550--7152594
10
4.5
10
85
0
63
71
2
4
22
1.15
7152550--7152594
20
2.2
20
92
0
72
71
2
4
22
1.15
7152558--7152602
21
2.2
20
96
4
81
66
0
8
24
1.20
7156785--7156834
13
3.5
13
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19
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6
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38
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1.75
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21
2.0
21
100
0
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39
9
18
32
1.83
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14
2.0
14
100
0
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64
0
0
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0.94
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2.0
30
93
0
100
55
15
3
25
1.55
7166192--7166231
21
1.9
21
89
0
62
40
7
25
27
1.82
7191404--7191444
21
2.0
21
100
0
82
53
19
0
26
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7192994--7193039
23
2.0
23
95
0
83
45
13
15
26
1.82
7205923--7205982
30
2.0
30
96
0
111
48
3
18
30
1.64
7207431--7207914
132
3.7
132
85
3
605
34
17
19
28
1.95
7209370--7209399
15
2.1
15
93
6
53
76
0
10
13
1.01
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28
2.5
28
73
15
72
37
2
1
57
1.22
7215121--7215150
14
2.1
14
93
0
51
33
0
0
66
0.92
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18
2.3
18
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0
57
57
14
0
28
1.38
7215613--7215666
28
1.9
28
85
7
74
53
3
16
25
1.59
7218826--7218903
28
2.7
29
74
9
70
53
1
2
42
1.22
7218837--7218904
31
2.3
28
78
9
73
54
1
2
41
1.24
7219046--7219093
16
3.2
15
81
16
55
75
8
14
2
1.13
7219956--7220030
22
3.3
22
74
17
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38
0
25
36
1.56
7219956--7220005
23
2.2
24
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13
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42
0
22
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1.54
7220175--7220270
39
2.5
39
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6
108
20
23
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27
1.99
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20
2.8
20
77
2
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48
0
1
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1.11
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0
1
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2
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2
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0
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0
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1.00
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2.0
113
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2.0
64
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24
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1.75
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21
2.1
21
91
0
72
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2
0
37
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
30
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0
1
49
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9
3.1
9
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0
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0
0
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14
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0
18
0
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2.9
427
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0
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31
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2.0
75
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2.0
47
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20
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25
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2.0
29
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2.0
18
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12
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1.84
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2.9
22
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4
0
32
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2.1
16
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5
57
56
6
0
37
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7344620--7345062
114
3.9
113
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15
1
31
1.51
7344968--7345141
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15
0
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1.49
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0
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35
0
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0
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0
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0.95
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2.0
131
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25
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2.2
26
96
0
103
37
26
5
30
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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