Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  317  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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241
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21
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
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Score
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23
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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0
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7
24
36
1.83
103392259--103392311
26
2.0
26
100
0
106
32
15
22
30
1.94
103392581--103392688
21
5.1
21
78
6
67
32
20
45
1
1.62
103394664--103394734
31
2.3
31
82
4
81
47
9
7
35
1.64
103400454--103400487
11
3.1
11
91
8
52
61
2
0
35
1.11
103400876--103400917
18
2.3
19
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4
2
52
1.35
103407093--103407255
39
4.2
39
84
4
213
23
23
29
23
1.99
103415128--103415247
39
3.1
39
83
6
154
26
20
26
25
1.99
103415121--103415245
38
3.3
38
81
8
146
26
20
27
25
1.99
103415121--103415265
77
1.9
78
83
1
193
26
22
26
24
2.00
103426112--103426284
46
3.7
46
74
14
167
28
27
20
22
1.99
103426160--103426303
46
3.1
44
72
15
114
28
29
20
22
1.98
103426705--103426765
30
2.0
30
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0
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1.80
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30
2.0
30
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0
86
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24
6
39
1.80
103429696--103429815
49
2.4
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172
27
25
21
25
1.99
103429696--103429815
25
4.9
25
90
4
174
27
25
21
25
1.99
103429696--103429840
50
2.9
50
84
8
147
28
24
22
24
1.99
103430040--103430103
31
2.1
31
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5
112
34
12
25
28
1.92
103439122--103439175
28
1.9
28
85
7
74
42
9
11
37
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103441669--103441739
33
2.1
34
84
2
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26
22
21
29
1.99
103441918--103441983
27
2.4
27
82
0
87
37
21
21
19
1.94
103446996--103447052
25
2.3
25
76
11
64
36
3
0
59
1.14
103447116--103447192
25
3.1
24
75
19
70
38
5
0
55
1.22
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12
10.8
12
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20
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4
1
57
1.28
103447126--103447265
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3.1
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12
108
35
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2
55
1.37
103447114--103447231
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5.1
23
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109
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5
0
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0
5
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100
35
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1
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2.1
48
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18
1.90
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0
2
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1.08
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0
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22
1.91
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16.2
44
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2
883
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25
28
1.94
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2.5
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21
1.12
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21
3.0
22
77
15
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35
46
0
17
1.49
103468942--103469025
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1
28
1.61
103468925--103469014
46
2.0
46
95
0
162
42
24
2
31
1.67
103468980--103469033
7
7.7
7
78
0
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50
25
0
24
1.50
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41
4.4
40
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214
17
20
22
39
1.92
103469190--103469368
82
2.2
82
88
5
256
17
20
22
39
1.92
103469190--103469396
41
5.1
42
80
10
207
17
20
22
39
1.93
103469190--103469396
82
2.5
82
84
6
246
17
20
22
39
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103470549--103470651
21
4.9
21
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17
63
37
2
1
57
1.25
103470571--103470673
14
7.1
15
76
17
94
37
2
0
58
1.20
103470571--103470655
31
2.7
32
77
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38
3
0
57
1.16
103470550--103470650
18
5.5
18
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20
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38
2
0
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1.21
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32
0
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4.1
27
84
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140
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24
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1.94
103479497--103479608
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2.1
54
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163
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0
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0
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0
0.87
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2.3
51
87
1
167
16
21
20
42
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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