Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  24  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7656134--7656187
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2.1
26
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3
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3
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0
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0
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1.15
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0
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2.1
105
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2.0
346
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22
1.9
21
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2
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30
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19
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53
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17
26
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2.0
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2.0
126
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26
17
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1.98
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17
2.7
18
80
12
53
32
0
2
65
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5.1
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18
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161
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10
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3.8
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92
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59
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9
0
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0.87
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9
0
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7776271--7776318
18
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17
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7776320--7776393
21
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0
2
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0
2
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0
0
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2.6
26
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2
1
46
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23
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21
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0
4
54
1.20
7777064--7777110
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2.2
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36
2
0
61
1.08
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21
3.6
22
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14
56
37
1
2
58
1.20
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18
2.8
18
80
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58
0
0
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0
6
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1.27
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3.9
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2
0
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1.12
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2.6
22
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10
64
60
1
0
37
1.07
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35
3.4
35
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1
1
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1.19
7780004--7780094
23
4.1
22
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13
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54
2
0
42
1.12
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18
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61
67
0
3
28
1.08
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9
3.8
9
92
8
59
81
0
9
9
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7780165--7780195
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3.8
8
91
8
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0
9
9
0.90
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1.9
74
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2
174
53
18
10
17
1.71
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2.0
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0
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15
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0
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19
0
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0
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0
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41
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0
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20
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24
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20
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0
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14
29
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25
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15
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20
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5
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22
5
5
66
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2
0
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3.5
22
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75
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18
15
1.90
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13
3.1
13
81
14
53
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7900121--7900166
23
2.0
23
86
0
65
13
10
10
65
1.48
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20
1.9
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10
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10.5
10
69
16
61
30
5
1
64
1.22
7901899--7902046
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19
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17
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4
1
60
1.26
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2.2
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3
1
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1.24
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29
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1
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0
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37
0
0
62
0.95
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11
2.8
11
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0
53
35
12
9
41
1.76
7916360--7916397
19
2.0
19
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10
51
2
0
28
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1.03
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28
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28
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0
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20
10
13
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1.66
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75
2.0
75
97
0
288
34
31
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24
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19
2.1
19
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26
2.0
26
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0
104
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3
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30
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18
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37
2.0
37
100
0
150
24
24
17
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
1
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1.98
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0
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0
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0
0
46
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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7
31
1.81

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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