Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16540502--16540543
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2.1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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197
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2.1
25
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2.7
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89
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2.2
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1.28
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
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15
78
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1.97
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39
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0
239
21
21
30
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16738118--16738219
30
3.4
30
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5
134
29
20
26
23
1.99
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17
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2
1
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1.24
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3
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42
3
2
52
1.32
16740776--16740847
20
3.5
20
71
16
67
50
4
6
38
1.49
16740771--16740856
40
2.1
39
93
4
127
53
3
5
37
1.42
16740791--16740854
20
3.2
20
70
16
69
56
3
6
34
1.40
16741164--16741193
15
1.9
16
93
6
53
0
26
0
73
0.84
16741287--16741341
20
2.7
20
85
2
74
36
1
0
61
1.06
16741302--16741358
20
3.4
17
77
20
57
36
1
0
61
1.07
16741351--16741394
18
2.7
16
77
16
54
36
6
0
56
1.26
16741785--16741845
12
4.9
14
69
30
57
60
0
0
39
0.97
16741756--16741824
22
3.1
21
83
8
75
53
0
0
46
1.00
16741787--16741879
35
2.6
36
85
12
131
60
0
0
39
0.97
16741789--16741856
34
2.0
34
94
5
120
61
0
0
38
0.96
16741790--16741831
22
2.0
22
90
4
68
61
0
0
38
0.96
16741822--16741868
22
2.1
23
96
4
87
61
0
0
38
0.96
16750642--16750685
20
2.3
19
80
4
52
45
4
0
50
1.22
16751307--16751368
24
2.6
23
78
14
72
51
3
4
40
1.39
16753892--16754137
132
1.9
131
89
5
388
30
19
19
30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16756229--16756329
48
2.1
48
81
7
116
46
3
45
3
1.40
16775643--16775684
21
2.0
21
100
0
84
47
19
14
19
1.82
16776354--16776410
21
2.8
21
81
5
55
56
8
21
14
1.65
16785167--16785227
31
2.0
31
84
9
81
49
1
0
49
1.10
16785263--16785304
22
2.1
19
86
13
57
42
4
0
52
1.22
16787280--16787350
18
3.9
18
75
3
70
46
14
8
30
1.74
16798266--16798304
18
2.1
19
85
4
53
33
2
0
64
1.08
16803501--16803582
37
2.2
38
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6
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26
6
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64
1.29
16804225--16804260
9
3.8
9
92
7
54
30
25
2
41
1.69
16809438--16809481
21
2.1
21
95
0
79
38
0
2
59
1.10
16810322--16810357
18
2.0
18
94
0
63
50
0
25
25
1.50
16810322--16810357
12
3.0
12
83
0
54
50
0
25
25
1.50
16810463--16810595
39
3.4
38
73
12
110
25
18
26
30
1.98
16810762--16810829
34
2.0
34
100
0
136
50
8
20
20
1.75
16811766--16811799
17
2.0
17
100
0
68
58
5
5
29
1.45
16815528--16815597
35
2.0
35
100
0
140
45
11
5
37
1.64
16836128--16836432
151
2.0
150
92
0
502
40
11
6
42
1.66
16838093--16838133
14
3.1
14
76
20
52
48
0
4
46
1.23
16840423--16840451
6
4.8
6
100
0
58
17
0
0
82
0.66
16847437--16847463
2
13.5
2
100
0
54
48
0
0
51
1.00
16848168--16848209
20
2.2
20
86
4
59
76
2
7
14
1.10
16853663--16853738
3
25.7
3
72
2
64
31
5
2
60
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16853695--16853727
17
1.9
17
93
0
57
30
9
3
57
1.45
16853907--16853967
3
20.3
3
76
6
52
32
4
3
59
1.35
16853907--16853966
21
2.9
21
82
0
66
33
5
3
58
1.36
16854910--16854943
9
3.7
9
96
4
59
76
0
0
23
0.79
16856584--16856622
12
3.5
12
86
13
57
61
7
5
25
1.44
16857445--16857791
113
3.0
113
95
2
613
31
0
15
52
1.48
16862782--16863030
108
2.3
108
90
4
383
40
6
10
42
1.65
16863852--16863916
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2.0
33
93
3
114
41
10
6
41
1.65
16871813--16871855
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3.1
14
86
0
59
6
13
0
79
0.93
16873503--16873536
18
2.0
17
88
11
52
47
2
11
38
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352