Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14039588--14039621
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0
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2.6
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48
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1.74
14047037--14047074
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20
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138
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0
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2.2
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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21
1.98
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2.3
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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2
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1.8
138
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109
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323
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10
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30
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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(0-2)
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1
33
1.24
14222844--14222940
10
8.8
10
73
18
61
50
3
0
46
1.17
14222921--14222977
18
3.2
17
73
14
53
47
0
0
52
1.00
14222919--14222977
23
2.5
23
91
5
91
47
0
0
52
1.00
14222919--14223001
13
7.5
11
73
18
57
44
0
0
55
0.99
14226153--14226192
20
2.0
20
85
0
53
47
0
0
52
1.00
14226218--14226258
16
2.5
17
84
11
59
68
0
2
29
1.03
14227425--14227482
17
3.7
17
78
17
63
34
0
3
62
1.12
14231664--14231690
6
4.5
6
100
0
54
48
14
18
18
1.82
14232878--14232919
9
3.8
11
85
14
52
57
4
0
38
1.20
14233171--14233195
5
5.0
5
100
0
50
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20
0
40
1.52
14234360--14234417
30
1.9
30
85
0
80
22
12
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58
1.57
14234644--14234737
14
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14
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18
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35
5
0
59
1.20
14234748--14234789
7
5.9
7
78
15
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28
2
0
69
1.01
14235218--14235244
14
1.9
14
100
0
54
29
0
7
62
1.22
14235232--14235353
64
1.9
62
86
3
172
29
7
12
50
1.67
14242931--14242957
14
1.9
14
100
0
54
29
0
7
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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8
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0
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0
11
11
1.01
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46
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46
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0
474
44
14
22
18
1.86
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26
2.7
25
76
13
70
34
2
25
37
1.71
14264030--14264073
20
2.2
20
87
0
61
36
29
2
31
1.70
14264159--14264272
43
2.7
42
79
2
120
28
24
16
30
1.97
14264159--14264280
42
2.9
42
80
2
136
28
24
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1.96
14292718--14292748
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0
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0
32
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0
0
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2.0
232
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15
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1.90
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2.1
28
100
0
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13
24
10
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1.72
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0
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1.47
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7
10.6
7
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16
1
34
47
1.55
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17
2.2
17
85
0
58
42
7
7
42
1.63
14327824--14327865
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2.0
21
95
0
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40
28
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22
2.2
22
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47
0
20
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1.50
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25
2.6
25
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24
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3.5
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90
2
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26
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22
20
1.98
14332053--14332168
39
3.0
39
96
0
205
26
29
21
22
1.99
14334479--14334519
21
1.9
21
85
5
55
31
7
0
60
1.24
14336032--14336400
64
5.8
64
95
3
624
32
8
17
42
1.78
14336520--14336800
41
6.9
41
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5
336
21
17
27
33
1.96
14336524--14336800
123
2.3
123
98
0
527
21
17
27
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14337469--14337503
15
2.3
15
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9
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25
0
22
51
1.48
14343237--14343605
64
5.8
64
95
3
624
32
8
17
42
1.78
14343725--14344005
41
6.9
41
83
5
336
21
17
27
33
1.96
14343729--14344005
123
2.3
123
98
0
527
21
17
27
33
1.96
14344673--14344707
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
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1.48
14345734--14345771
19
2.0
19
94
0
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34
15
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36
1.87
14348079--14348137
22
2.6
22
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2
91
38
23
23
13
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2.7
24
85
0
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16
1.91
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3.4
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5
138
33
22
15
29
1.95
14359810--14360670
318
2.7
316
90
2
1358
39
10
15
33
1.82

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352