Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  81  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25522350--25522390
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1.99
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19
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0
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1.10
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4.5
12
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55
1
0
42
1.10
25524241--25524296
26
2.2
26
90
6
69
55
1
0
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1.10
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0
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26
0
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2.1
18
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0
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0
0
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217
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24
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60
0
0
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2.1
21
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20
2.0
20
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60
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
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1.00
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2.1
17
100
0
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38
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25555782--25555829
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6
10
58
1.54
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1.9
54
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40
14
3
40
1.64
25557731--25557794
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2.1
31
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10
3
26
1.46
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5
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7
79
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1.59
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15
5.6
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81
0
96
52
15
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2
1.55
25559028--25559100
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14.6
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0
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1.53
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100
0
50
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0
1.00
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11
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39
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2
3
42
1.32
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2
0
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2.1
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2
53
1.28
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1.9
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53
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2.1
75
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48
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24
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4
52
38
8
0
52
1.33
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5
100
0
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0
20
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.3
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33
5.8
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6
119
32
13
24
29
1.94
25612633--25612749
33
3.6
33
81
1
128
29
14
27
28
1.95
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13
2.1
13
100
0
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37
0
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55
1.28
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2.0
27
96
0
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40
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10
36
1.79
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2.3
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37
9
21
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1.85
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78
0
122
31
13
25
29
1.94
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7
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1.62
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18
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52
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18
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1.32
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1.27
25637754--25637811
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1.27
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21
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0
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25652844--25652941
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1.53
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42
2.0
42
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0
125
41
17
17
23
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25675276--25675307
16
2.0
16
100
0
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43
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25
25
1.77
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6
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0
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60
0
5
34
1.21
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23
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0
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8
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0
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59.3
3
71
15
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64
1
6
27
1.28
25683337--25683420
26
3.1
26
76
8
71
69
3
5
21
1.26
25683423--25683511
28
3.3
27
77
11
103
61
0
5
32
1.19
25683488--25683518
15
2.1
15
93
0
53
67
0
0
32
0.91
25685215--25685341
43
2.9
42
77
7
137
28
22
18
30
1.97
25685410--25685520
43
2.6
44
82
5
120
30
24
17
27
1.97
25685229--25685703
179
2.6
179
87
1
655
28
21
18
32
1.96
25690002--25690178
43
4.0
43
75
14
166
29
23
16
30
1.96
25693085--25693144
21
2.8
20
73
14
57
41
0
3
55
1.16
25695026--25695137
39
2.8
40
76
8
113
23
19
25
31
1.98
25697379--25697464
9
9.6
9
86
5
120
44
19
9
26
1.81
25697484--25697530
6
7.5
6
86
9
67
17
0
4
78
0.90
25697489--25697527
20
2.0
20
94
0
69
20
0
5
74
1.01
25697555--25697579
13
1.9
13
100
0
50
12
0
48
40
1.40
25703777--25703828
24
2.2
24
86
6
70
9
19
13
57
1.63
25708135--25708316
3
60.3
3
73
12
106
63
2
6
26
1.32
25708149--25708285
29
4.6
29
68
16
75
64
2
7
24
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25708214--25708285
32
2.3
31
78
9
74
66
1
8
23
1.27
25708251--25708331
28
3.0
28
76
7
78
62
2
4
29
1.29
25709241--25709282
14
3.0
14
80
13
50
0
9
21
69
1.17
25710734--25710884
43
3.5
43
81
6
180
31
24
15
29
1.95
25713985--25714052
25
2.8
25
75
2
66
32
20
25
22
1.98
25715310--25715398
44
2.0
44
97
0
169
47
11
2
39
1.52
25715701--25715760
12
5.5
11
78
13
61
60
0
10
30
1.30
25716030--25716110
33
2.5
33
79
14
91
30
1
1
66
1.07
25716123--25716179
19
2.8
20
81
5
53
54
3
3
38
1.35
25716104--25716228
66
1.9
66
82
11
157
53
3
4
38
1.38
25716274--25716321
24
2.0
24
87
0
69
37
4
2
56
1.30
25726910--25727010
30
3.3
30
97
2
184
41
11
18
27
1.86
25733535--25733576
20
2.2
19
87
12
59
16
21
4
57
1.58
25741500--25741546
20
2.3
20
100
0
94
36
0
17
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1.48
25744310--25744363
27
2.0
27
100
0
108
33
7
25
33
1.84
25745216--25745244
5
5.8
5
100
0
58
82
0
0
17
0.66
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65
2.1
65
94
0
232
24
13
29
32
1.93
25749326--25749386
20
3.1
19
81
9
77
67
1
8
22
1.27
25749326--25749386
10
6.1
10
77
19
65
67
1
8
22
1.27
25749326--25749407
40
2.1
39
84
11
105
64
3
7
24
1.35
25750028--25750214
96
1.9
97
89
1
286
31
24
14
29
1.95
25750712--25750741
15
2.0
15
100
0
60
40
33
26
0
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25750976--25751030
15
3.2
17
81
18
62
78
0
1
20
0.85
25750981--25751032
6
8.5
6
82
18
63
76
0
1
21
0.87
25758413--25758541
46
2.8
46
91
0
204
19
21
29
29
1.98
25760123--25760178
10
5.6
10
85
8
62
67
1
3
26
1.16
25760119--25760178
20
3.0
19
80
9
75
68
1
5
25
1.19
25760119--25760200
39
2.1
40
84
6
105
64
4
4
25
1.34
25768382--25768430
6
7.8
6
84
8
53
69
4
2
24
1.17
25768370--25768431
18
3.3
19
82
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83
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3
3
22
1.16
25770122--25770177
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11.2
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7
60
73
1
5
19
1.12
25777309--25777358
6
8.5
6
78
8
50
76
0
2
22
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352