Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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This is table  206  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68001754--68001925
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1.8
93
93
0
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20
21
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27
1.98
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29
20
20
1.98
68004563--68004733
93
1.8
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1
315
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29
21
21
1.98
68010657--68010780
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2.0
64
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3
234
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1.80
68014469--68014640
46
3.7
46
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10
197
21
20
28
29
1.98
68014462--68014633
93
1.8
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0
290
22
21
27
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1.99
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90
28
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1.95
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3.0
29
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25
14
30
29
1.95
68020422--68020462
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2.4
17
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17
1.69
68020422--68020462
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2.4
17
80
19
50
46
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4
17
1.69
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1.9
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2.4
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2.0
27
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31
1.94
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2.3
25
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24
2.00
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20
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1.9
17
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21
21
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51
1.69
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2.7
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60
22
22
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1.96
68064854--68064899
17
2.6
18
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6
58
23
21
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1.94
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30
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4.1
29
79
4
116
28
13
29
27
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.9
42
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29
1.94
68078250--68078333
23
3.7
23
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7
100
28
21
17
32
1.96
68082023--68082101
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2.1
37
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115
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30
18
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1.98
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47
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35
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1.99
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2.2
78
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251
27
29
22
21
1.99
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3.6
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12
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31
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2.0
30
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2.0
16
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2.7
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2.3
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2.0
35
100
0
142
39
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33
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22
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27
7
0
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1.20
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2.0
38
97
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143
27
7
0
64
1.21
68218399--68218461
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3.5
17
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28
7
0
63
1.22
68218395--68218473
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2.1
38
92
4
133
27
10
0
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1.28
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2.1
36
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1.80
68224348--68224408
6
9.3
6
78
21
61
4
21
0
73
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
20
0
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0.88
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79
18
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5
19
0
75
1.00
68224348--68224426
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2.5
33
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24
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1.06
68224392--68224437
20
2.3
20
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3
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23
2
67
1.25
68226250--68226626
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14.0
27
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432
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20
7
31
1.80
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16.6
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20
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1.81
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54
87
0
508
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20
7
31
1.80
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3
370
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20
7
31
1.81
68226259--68226762
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18.7
27
76
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260
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1.81
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2.1
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188
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18
17
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1.91
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17
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1.91
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1.9
102
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1.96
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21
25
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1.98
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1.99
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2.4
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84
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271
26
19
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68237041--68237359
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2.0
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1.8
93
91
0
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22
22
29
26
1.99
68247483--68247551
29
2.4
29
85
0
93
8
15
17
57
1.62
68247479--68247540
15
4.2
15
77
4
72
11
16
16
56
1.67
68249925--68250101
46
3.9
44
77
11
194
24
20
27
27
1.99
68249925--68250093
93
1.8
93
90
0
275
24
21
27
27
1.99
68254594--68254759
40
4.2
40
95
0
280
22
22
27
27
1.99
68256107--68256181
36
2.1
36
97
0
141
42
20
12
25
1.86
68256268--68256390
48
2.6
48
85
1
167
31
13
21
33
1.92
68256147--68256445
133
2.2
133
86
1
411
30
15
23
31
1.95
68260804--68260849
6
7.7
6
85
0
65
32
15
32
19
1.93
68262733--68262879
40
3.7
39
78
9
136
36
22
14
25
1.93
68263078--68263108
12
2.5
13
94
5
55
45
19
0
35
1.51
68267591--68267629
21
1.9
20
94
5
69
46
17
0
35
1.49
68268525--68268732
101
2.0
103
95
4
375
43
24
8
23
1.81
68271755--68271793
20
2.0
20
90
5
62
28
12
5
53
1.60
68278651--68278770
59
2.0
60
98
1
233
34
25
8
32
1.86
68291013--68291132
58
2.1
58
98
0
231
51
10
1
36
1.45
68291340--68291379
16
2.4
17
84
15
57
60
0
17
22
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68292217--68292269
19
3.0
17
86
13
72
71
5
0
22
1.06
68295647--68295683
2
18.5
2
94
0
65
51
0
48
0
1.00
68298763--68298817
27
2.0
27
82
13
67
41
3
5
49
1.43
68298935--68298993
22
2.7
22
97
0
109
25
10
10
54
1.65
68304874--68304929
24
2.4
24
90
3
87
30
26
28
14
1.95
68308556--68308590
17
2.1
17
89
10
54
65
5
8
20
1.40
68308577--68308640
12
5.7
12
80
17
75
79
4
1
14
0.96
68308603--68308639
19
1.9
19
94
0
65
81
2
2
13
0.92
68308577--68308620
13
3.5
13
93
3
72
79
4
2
13
0.98
68310682--68310722
15
2.8
15
85
3
57
80
2
14
2
0.92
68314586--68314774
40
4.7
40
89
0
297
25
26
21
26
2.00
68322666--68322854
40
4.7
40
90
0
306
25
26
21
25
2.00
68325230--68325285
27
2.1
26
90
9
87
33
8
17
39
1.81
68329558--68329765
67
3.2
64
75
8
168
31
17
28
22
1.96
68332842--68332895
26
2.1
26
100
0
108
18
18
11
51
1.74
68333021--68333065
22
2.1
21
83
4
54
11
24
4
60
1.49
68333056--68333097
14
2.9
14
77
16
50
4
19
0
76
0.96
68343941--68344592
49
13.6
49
93
2
1017
33
8
29
28
1.86
68343941--68344592
145
4.5
143
93
2
1042
33
8
29
28
1.86
68346934--68347038
23
4.4
24
88
7
151
28
21
19
30
1.97
68346945--68347037
48
1.9
48
91
4
152
30
21
20
27
1.98
68347091--68347154
20
3.2
20
93
0
110
32
20
12
34
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
68347091--68347143
11
5.2
11
69
17
51
32
18
13
35
1.90
68349626--68349669
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
68351885--68351955
23
3.0
24
87
10
101
26
22
21
29
1.99
68352008--68352071
20
3.2
20
90
0
110
32
21
12
32
1.91
68354535--68354578
19
2.4
18
85
7
54
40
9
0
50
1.34
68362845--68362997
39
3.9
39
89
0
198
45
18
2
33
1.63
68363032--68363070
16
2.5
15
87
4
51
48
25
0
25
1.51
68364090--68364155
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2.1
32
100
0
132
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0
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40
6.5
42
74
9
147
26
21
26
25
1.99
68366713--68366973
80
3.3
80
76
3
249
26
21
26
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352