Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  311  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101534168--101534209
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156
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44
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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0
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184
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9
0
66
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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12
12
1
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1.18
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
4
48
1.21
101729500--101729560
32
2.0
32
83
6
81
50
0
4
44
1.23
101730917--101730949
16
2.1
16
88
11
50
45
3
0
51
1.16
101731618--101731658
11
3.6
11
86
3
55
68
0
0
31
0.90
101735755--101735781
14
1.9
14
100
0
54
18
0
0
81
0.69
101743916--101744016
40
2.5
40
96
0
184
31
33
17
16
1.93
101745507--101745543
17
2.2
18
90
9
60
67
2
0
29
1.04
101746303--101746328
7
3.7
7
100
0
52
11
11
0
76
1.01
101748925--101749137
107
2.0
108
94
2
376
29
26
15
28
1.96
101754021--101754072
18
3.1
16
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15
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67
3
0
28
1.08
101757741--101757792
28
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26
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14
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42
5
1
50
1.37
101758429--101758490
27
2.3
27
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8
90
35
0
3
61
1.12
101758425--101758477
18
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18
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2
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0
3
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1.13
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0
0
55
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0
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0
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0
0.63
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27
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2
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15
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48
1.70
101762613--101762639
12
2.2
12
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0
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1.89
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4
2
17
1.07
101767750--101767799
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101772389--101772438
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2.7
20
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18
70
10
0
44
46
1.37
101777136--101777161
13
2.0
13
100
0
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7
23
7
61
1.49
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72
2.1
72
91
1
237
30
16
13
40
1.87
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15
1.9
15
100
0
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2.0
37
100
0
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13
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1.76
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27
3.2
26
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4
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20
20
1.94
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0
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1
335
22
24
29
22
1.99
101804376--101804573
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2.5
77
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3
335
22
24
29
22
1.99
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22
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11
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29
0
3
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1.09
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2.8
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0
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1.90
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0
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0
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28
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10
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1.9
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0
104
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228
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1.99
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33
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108
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10
22
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101843701--101843750
26
2.0
25
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18
22
24
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25
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25
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0
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26
26
17
28
1.98
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2
19.0
2
100
0
76
50
0
50
0
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101867208--101867269
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2.1
30
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115
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58
1.48
101871282--101871403
58
2.1
58
98
0
235
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32
1.90
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24
2.3
24
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0
74
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0
3
49
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0
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0
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4.3
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0
0
41
0.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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