Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  6  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1844956--1845076
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2.7
45
92
0
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20
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0
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0
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1.26
1852520--1852553
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
1863741--1864131
132
3.0
130
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499
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18
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1.93
1863734--1864117
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3.0
123
83
7
484
30
17
16
35
1.92
1863880--1864189
124
2.5
120
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7
331
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18
20
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1869020--1869061
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2.9
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52
2
0
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2.0
104
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0
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2.2
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3
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2.0
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0
0
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1.20
1890344--1890406
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2.2
29
80
2
74
39
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1.31
1892840--1892872
16
2.1
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0
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0
0
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46
4
1
48
1.29
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47
5.2
47
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1
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33
4
18
43
1.71
1899190--1899434
95
2.6
94
94
1
436
33
4
18
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1.71
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2.3
25
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1
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23
52
42
0
3
53
1.19
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41
0
0
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2.3
43
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129
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26
0
1.22
1916592--1916740
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3.2
46
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20
141
18
26
19
35
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1916593--1916685
25
3.8
24
84
11
127
20
24
19
35
1.96
1916667--1916705
19
2.1
19
85
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53
23
30
17
28
1.97
1917638--1917665
13
2.2
13
100
0
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21
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12
3.3
12
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0
53
12
12
25
50
1.75
1917956--1918004
24
2.0
24
100
0
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12
12
20
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5
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40
0
0
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40
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41
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10
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8
27
0
1.21
1919669--1919772
44
2.3
44
83
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131
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7
26
0
1.20
1919667--1919772
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126
65
7
27
0
1.20
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10
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1929409--1929458
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2.7
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70
10
0
44
46
1.37
1951582--1951610
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2.0
146
100
0
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1957382--1957412
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2.4
13
100
0
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54
0
0
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22
2.2
22
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62
42
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1.47
1960571--1960622
22
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22
96
0
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51
0
3
44
1.19
1971315--1971365
25
2.0
26
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3
77
58
1
3
35
1.28
1971397--1971430
15
2.2
16
89
5
52
47
0
5
47
1.26
1974929--1974955
13
2.1
13
100
0
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1.9
15
100
0
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6
0
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1982216--1982312
33
2.8
35
72
20
89
50
1
3
45
1.24
1982251--1982331
33
2.7
30
76
16
78
50
1
1
46
1.17
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1991650--1991677
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2.0
14
100
0
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14
35
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1.9
126
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0
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15
30
1.88
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18
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78
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0
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1.39
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3.2
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94
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1
52
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2.0
37
100
0
150
16
0
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29
1.42
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2.4
44
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3
144
29
23
13
33
1.93
2009752--2009859
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
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2.0
26
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29
7
7
54
1.57
2013095--2013124
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1.9
15
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51
36
6
0
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1.9
14
100
0
54
37
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3
51
1.48
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2.7
131
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6
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18
18
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10.8
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9
67
43
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1
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3.8
11
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17
52
30
2
2
65
1.18
2033488--2033531
23
1.9
23
90
0
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2
4
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1.28
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23
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13
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1.76
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2.0
21
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0
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2.0
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25
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3
5
43
1.44
2082103--2082187
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2.1
41
97
0
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38
12
7
41
1.71
2083338--2083420
29
2.7
30
76
12
80
45
8
6
39
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2092289--2092533
49
4.9
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81
4
280
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18
26
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1.98
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11
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21
8
29
1.84
2094013--2094190
93
1.9
95
84
4
245
38
20
8
31
1.84
2095560--2095603
22
2.0
21
86
4
61
36
4
0
59
1.18
2096816--2096895
16
4.5
18
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20
62
30
1
2
66
1.13
2096817--2096882
35
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33
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1
3
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1.19
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16
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15
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50
5
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17
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16
2.0
17
88
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50
39
0
6
54
1.25
2116919--2116963
2
22.5
2
81
0
54
51
8
0
40
1.33
2116919--2116963
8
5.6
8
89
0
63
51
8
0
40
1.33
2126016--2126069
19
2.8
19
81
8
56
37
0
3
59
1.15
2126156--2126195
16
2.3
19
87
12
59
37
2
2
57
1.26
2126156--2126291
10
14.6
9
66
24
52
31
2
4
61
1.31
2126639--2126665
7
3.9
7
100
0
54
85
0
0
14
0.61
2131881--2131918
16
2.4
16
83
12
51
31
0
7
60
1.25
2132017--2132059
15
2.8
16
89
6
63
55
0
0
44
0.99
2137219--2137272
28
1.9
28
88
0
81
37
1
0
61
1.07
2139516--2139541
11
2.4
11
100
0
52
73
0
0
26
0.84
2144089--2144130
18
2.4
17
84
4
57
26
7
0
66
1.17
2144088--2144132
19
2.5
18
82
7
56
26
6
0
66
1.16
2145844--2145868
10
2.5
10
100
0
50
48
0
0
52
1.00
2151630--2151711
37
2.2
37
81
12
98
50
0
8
41
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2152422--2152503
43
1.9
43
84
0
110
57
7
3
31
1.44
2159672--2159700
3
9.7
3
100
0
58
0
31
0
68
0.89
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29
2.0
29
90
0
91
50
1
0
47
1.11
2171663--2171723
31
2.0
31
100
0
122
39
13
0
47
1.42
2171666--2171717
17
3.2
17
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25
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38
11
0
50
1.39
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19
2.7
20
80
11
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0
0
38
0.96
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22
3.9
23
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18
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56
2
0
41
1.12
2171806--2171875
22
3.0
24
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14
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2
0
38
1.13
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30
2.0
30
84
6
79
24
0
8
67
1.18
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7
3.7
7
100
0
52
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0
15
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1.38
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19
2.0
20
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60
7
2
28
1.38
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4
100
0
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25
0
25
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1.50
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26
2.2
24
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38
0
20
40
1.53
2198042--2198107
33
2.0
33
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0
123
34
27
18
19
1.95
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25
2.0
25
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0
100
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4
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18
2.7
18
80
6
62
58
8
2
31
1.39
2203631--2203670
20
2.0
20
90
4
64
32
0
7
60
1.25
2203631--2203670
19
2.1
18
86
13
53
32
0
7
60
1.25
2203855--2203916
31
2.1
30
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11
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45
12
3
38
1.59
2203913--2203945
17
1.9
18
88
11
52
27
6
6
60
1.44
2210173--2210233
32
1.9
32
89
0
95
31
9
9
49
1.69
2216142--2216170
12
2.5
12
94
5
51
31
0
6
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2221097--2221137
3
13.7
3
89
0
55
26
65
4
2
1.25
2221172--2221321
12
12.8
12
70
13
53
20
56
2
21
1.53
2221180--2221219
21
1.9
21
90
10
64
17
55
2
25
1.55
2221211--2221255
9
5.0
9
84
10
65
26
64
0
8
1.23
2221211--2221251
3
13.7
3
84
0
55
26
65
0
7
1.18
2221289--2221321
6
5.5
6
100
0
66
18
51
0
30
1.46
2221337--2221378
9
4.7
9
77
11
50
23
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2
9
1.35
2221097--2221563
120
3.9
118
79
8
397
21
55
4
18
1.62
2221506--2221746
129
1.9
129
91
0
401
20
52
6
20
1.68
2221732--2221813
42
2.0
42
80
4
94
26
52
2
18
1.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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