Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  301  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98691664--98691721
20
2.8
21
80
15
66
37
0
6
55
1.27
98691661--98691723
21
3.0
20
79
6
72
36
0
6
57
1.24
98696500--98696658
82
1.9
82
92
2
266
28
18
13
38
1.89
98700038--98700105
28
2.5
28
78
2
66
35
1
2
60
1.21
98707009--98707068
17
3.8
16
76
14
54
40
1
1
56
1.19
98706995--98707070
11
6.8
11
72
21
52
42
1
1
55
1.16
98707258--98707305
26
2.0
22
84
15
60
41
6
12
39
1.68
98712093--98712161
21
3.4
21
65
15
63
46
10
7
36
1.65
98712097--98712165
23
3.3
23
61
23
60
44
8
7
39
1.63
98712100--98712192
40
2.3
40
100
0
186
44
9
8
37
1.68
98712110--98712174
21
3.2
21
62
16
55
40
10
10
38
1.75
98715419--98715458
14
2.9
14
84
0
53
42
17
7
32
1.77
98715384--98715450
34
1.9
35
87
3
100
44
13
10
31
1.77
98718280--98718355
37
2.1
37
94
0
134
30
11
6
51
1.64
98738044--98738180
73
1.9
73
84
0
184
25
26
24
23
2.00
98738731--98738836
52
2.0
52
92
0
176
47
8
17
26
1.77
98741465--98741528
24
2.7
24
82
0
74
35
3
40
20
1.68
98744915--98745186
131
2.1
131
95
0
481
38
14
13
33
1.86
98748323--98748376
27
2.0
27
100
0
108
29
29
3
37
1.75
98748648--98748678
8
4.0
8
95
4
55
12
12
35
38
1.82
98753384--98753508
43
3.0
40
87
9
128
61
1
1
35
1.15
98753405--98753549
31
5.0
29
73
16
124
61
0
2
36
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98753405--98753530
43
3.0
41
88
9
182
60
0
2
37
1.10
98753405--98753548
74
1.9
74
92
2
245
61
0
2
36
1.08
98753473--98753530
11
5.4
11
74
17
59
58
0
3
37
1.15
98753514--98753547
17
2.0
17
88
0
50
64
0
0
35
0.94
98760887--98760960
34
2.4
28
73
23
76
32
1
0
66
1.00
98775055--98775082
6
4.7
6
100
0
56
50
0
14
35
1.43
98780050--98780090
22
1.9
23
85
14
61
24
4
7
63
1.40
98780707--98780751
17
2.4
19
82
13
58
68
11
2
17
1.29
98784353--98784384
3
10.7
3
100
0
64
31
0
0
68
0.90
98792869--98792942
9
8.2
9
71
5
51
17
29
48
4
1.65
98792869--98792948
27
3.0
27
88
0
106
17
30
47
5
1.69
98792929--98793080
39
3.9
39
93
1
234
13
34
43
7
1.74
98802362--98802404
22
2.0
22
86
9
61
30
0
2
67
1.03
98804378--98804433
23
2.4
23
90
0
85
23
19
23
33
1.97
98807150--98807189
19
2.1
19
85
0
53
20
12
22
45
1.84
98813995--98814045
4
12.8
4
87
0
75
47
21
1
29
1.62
98826955--98827012
27
2.1
27
100
0
116
37
0
20
41
1.53
98829740--98829776
11
3.4
11
96
0
65
54
0
5
40
1.24
98829762--98829824
26
2.4
26
89
2
90
65
0
0
34
0.93
98830366--98830428
26
2.5
25
75
12
65
52
1
1
44
1.20
98833173--98833218
2
23.0
2
90
0
74
0
47
2
50
1.13
98838839--98838874
3
12.0
3
100
0
72
33
0
0
66
0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98864425--98864471
19
2.4
20
75
13
53
25
2
2
70
1.10
98867402--98867452
25
2.0
25
88
0
75
41
5
15
37
1.72
98872073--98872123
25
2.0
25
88
0
75
39
7
17
35
1.79
98881163--98881236
37
2.0
37
100
0
148
27
13
27
32
1.94
98883156--98883192
16
2.3
16
90
0
56
35
21
5
37
1.77
98885697--98885953
39
6.5
39
89
1
372
20
21
28
29
1.98
98895459--98895519
31
2.0
32
83
6
81
27
14
16
40
1.88
98904501--98904548
16
3.1
16
78
3
53
77
6
8
8
1.14
98910768--98910821
27
2.0
27
92
0
90
14
18
22
44
1.86
98924987--98925429
69
6.4
68
75
5
293
35
20
19
23
1.96
98925127--98925429
138
2.2
137
82
2
358
35
21
19
23
1.96
98925806--98925876
35
2.0
35
84
10
92
38
5
12
43
1.66
98925867--98925917
14
3.8
14
76
10
61
56
9
0
33
1.32
98925851--98925921
12
5.7
12
71
14
54
52
11
1
35
1.46
98925860--98925927
26
2.6
26
88
0
91
54
10
1
33
1.43
98926182--98926235
26
2.1
25
83
10
65
51
11
5
31
1.60
98926248--98926717
207
2.3
207
79
3
516
34
25
21
18
1.96
98926249--98926749
69
7.3
69
79
2
461
34
24
20
19
1.96
98926767--98926924
69
2.3
69
87
2
210
28
24
20
26
1.99
98943131--98943171
19
2.2
20
86
8
59
29
4
2
63
1.28
98955171--98955308
71
1.9
71
98
0
267
30
9
5
55
1.54
98956175--98956199
2
12.5
2
100
0
50
48
0
0
52
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
98957097--98957149
18
3.1
17
81
10
63
62
7
0
30
1.23
98959511--98959600
40
2.2
40
84
0
117
40
28
17
13
1.88
98962855--98962925
25
2.8
25
83
12
92
32
21
30
15
1.94
98963738--98963784
23
2.0
23
95
0
85
44
19
4
31
1.70
98972076--98972105
12
2.4
12
94
5
51
30
0
0
70
0.88
98972956--98972983
8
3.5
8
100
0
56
85
0
0
14
0.59
98973811--98973878
9
7.6
9
100
0
136
11
22
55
10
1.65
98974552--98974594
21
2.0
22
81
9
52
34
2
0
62
1.08
98976914--98976956
18
2.4
18
88
0
59
25
18
9
46
1.79
98977330--98977508
60
3.0
60
94
0
313
32
2
8
55
1.45
98982940--98982965
13
2.0
13
100
0
52
38
23
7
30
1.83
98993175--98993211
16
2.4
16
95
4
67
43
13
10
32
1.79
98997330--98997371
18
2.3
18
87
0
57
21
26
7
45
1.77
98997726--98997909
62
3.0
60
87
8
241
35
4
8
51
1.53
98997796--98997922
62
2.1
61
86
4
175
38
5
9
46
1.60
99000919--99000981
25
2.5
25
84
0
72
20
19
6
53
1.66
99000940--99000990
25
2.0
25
88
7
77
19
21
3
54
1.60
99001148--99001727
126
4.7
126
87
2
796
27
17
15
39
1.90
99001815--99001942
28
4.4
28
78
13
132
40
13
0
45
1.49
99001845--99001910
33
2.0
33
90
3
105
43
12
0
43
1.41
99001815--99001943
62
2.1
61
86
4
179
41
13
0
44
1.49
99001875--99001952
28
2.8
28
88
2
120
42
14
0
43
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99002721--99002760
20
2.0
20
95
0
71
50
7
0
42
1.30
99009886--99009956
21
3.3
21
88
4
106
14
25
26
33
1.94
99009897--99009967
21
3.4
21
86
0
88
16
26
25
30
1.97
99009873--99009981
42
2.5
42
77
2
128
17
22
23
36
1.94
99012638--99012700
25
2.5
25
84
0
72
20
19
6
53
1.66
99012659--99012709
25
2.0
25
88
7
77
19
21
3
54
1.60
99012807--99013447
126
5.1
126
86
3
844
27
17
14
39
1.89
99012807--99013448
248
2.6
250
86
3
871
27
17
14
39
1.89
99013532--99013660
62
2.1
61
86
4
179
41
12
0
45
1.47
99013562--99013627
34
2.0
33
90
3
105
43
10
0
45
1.38
99013532--99013659
28
4.3
29
78
13
127
40
12
0
46
1.47
99013592--99013669
28
2.8
28
86
2
111
42
12
0
44
1.42
99014438--99014477
20
2.0
20
100
0
80
50
10
0
40
1.36
99015282--99015327
17
2.5
19
89
6
69
63
0
0
36
0.95
99015390--99015428
18
2.2
17
86
4
51
69
2
2
25
1.14
99031842--99031920
26
3.5
22
74
19
81
43
0
1
55
1.07
99031843--99031914
22
3.1
24
77
13
71
41
0
0
58
0.98
99031918--99031965
22
2.1
23
92
3
80
37
2
0
60
1.09
99031897--99032058
65
2.5
65
77
10
179
38
1
1
57
1.20
99032000--99032055
21
2.6
23
81
13
75
39
0
1
58
1.08
99032325--99032390
12
5.1
13
72
22
50
65
0
0
34
0.93
99032894--99032932
19
2.0
20
95
5
71
17
0
5
76
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
99032894--99032932
20
2.0
19
90
5
60
17
0
5
76
0.96
99032895--99032959
19
2.9
23
84
13
66
26
0
6
67
1.13
99033533--99033604
20
3.6
20
71
14
67
37
6
2
52
1.43
99033531--99033615
40
2.1
41
91
2
136
37
7
3
51
1.46
99033540--99033626
40
2.2
40
85
4
113
37
6
3
51
1.46
99034135--99034203
33
2.1
33
100
0
138
26
5
8
59
1.50
99035961--99036060
30
3.3
30
83
6
96
29
27
17
27
1.97
99035983--99036064
30
2.7
30
92
3
130
28
26
19
25
1.99
99040170--99040255
30
2.9
29
78
13
77
56
0
0
43
0.99
99040223--99040248
13
2.0
13
100
0
52
61
0
0
38
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352