Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  239  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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19
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32
22
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.2
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1.91
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2.2
40
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140
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1.97
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2.0
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1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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17
24
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
1.82
79094495--79094535
17
2.4
17
91
0
73
53
9
31
4
1.55
79096645--79096920
46
6.0
46
96
0
444
38
14
24
22
1.92
79098647--79098734
43
2.0
43
97
0
167
39
23
9
27
1.85
79098924--79099077
42
3.7
42
82
3
195
30
25
13
30
1.94
79109399--79109536
40
3.5
40
94
3
226
23
28
23
23
1.99
79117304--79117439
40
3.4
40
84
7
152
25
25
23
25
2.00
79131721--79131855
40
3.4
40
93
0
234
29
28
20
21
1.98
79134345--79134456
56
2.0
56
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3
208
32
26
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1.84
79147012--79147094
41
2.0
41
97
0
157
22
28
10
37
1.88
79154350--79154450
29
3.5
29
83
1
123
27
13
26
31
1.94
79157897--79158022
46
2.8
44
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10
139
25
30
17
26
1.97
79160631--79160661
14
2.2
14
100
0
62
45
6
12
35
1.68
79173683--79173781
42
2.4
42
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3
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31
25
15
28
1.95
79238128--79238311
40
4.7
40
79
8
189
26
27
23
22
2.00
79238128--79238311
78
2.3
81
79
9
200
26
27
23
22
2.00
79254914--79255136
49
4.5
50
83
2
279
26
18
25
29
1.98
79254914--79255136
101
2.2
98
87
3
313
26
18
25
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79267136--79267259
47
2.7
45
85
3
142
25
17
29
27
1.98
79269777--79269820
23
1.9
23
100
0
88
40
4
11
43
1.61
79272996--79273028
16
2.0
17
88
5
50
0
21
21
57
1.41
79274400--79274570
54
3.2
54
88
0
261
35
19
19
25
1.95
79274400--79274571
27
6.4
27
86
0
236
35
19
19
25
1.95
79274412--79274595
81
2.3
81
85
1
217
35
21
19
24
1.96
79274712--79275022
155
2.0
155
100
0
622
23
16
21
38
1.93
79275131--79275196
28
2.4
28
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0
105
24
22
25
27
2.00
79278747--79278835
27
3.3
27
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0
115
40
15
17
25
1.90
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27
2.8
26
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7
64
19
18
20
41
1.90
79292155--79292224
21
3.2
21
68
18
61
20
14
27
38
1.91
79297479--79297613
68
2.0
68
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1
189
48
5
4
42
1.45
79298371--79298437
35
1.9
35
100
0
134
37
17
19
25
1.94
79302024--79302200
35
5.0
35
79
2
167
40
19
9
30
1.83
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42
78
10
168
32
16
24
26
1.96
79310587--79310620
16
2.0
18
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11
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2
17
20
58
1.51
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47
5.4
47
91
0
375
27
29
8
34
1.86
79328440--79328672
49
4.7
50
83
2
299
26
19
25
28
1.99
79328442--79328681
100
2.4
98
85
4
311
26
20
25
28
1.99
79328440--79328715
150
1.8
150
86
3
403
27
18
24
28
1.98
79337804--79337894
46
2.0
46
82
0
110
25
32
8
32
1.87
79337911--79338126
22
9.3
21
63
23
60
26
28
12
33
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79337908--79338383
47
10.1
47
93
0
781
26
27
12
32
1.93
79338287--79338362
22
3.3
22
67
22
66
25
28
13
32
1.93
79342113--79342176
31
2.1
31
87
0
92
21
21
15
40
1.91
79342370--79342535
24
7.0
24
84
4
212
27
21
22
28
1.99
79342370--79342535
71
2.3
71
88
3
235
27
21
22
28
1.99
79342370--79342535
47
3.5
48
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4
212
27
21
22
28
1.99
79342585--79342651
20
3.3
20
93
0
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9.4
27
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171
32
9
19
38
1.84
79343998--79344253
54
4.7
54
78
6
212
31
9
18
39
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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