Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  39  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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0
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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8
22
4
64
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10
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2
27
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40
2.1
40
100
0
166
48
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39
1.49
12675034--12675080
21
2.3
20
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13
60
55
4
0
40
1.19
12675034--12675147
21
5.8
20
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21
53
59
4
1
34
1.27
12675532--12675580
20
2.4
21
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13
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30
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4
59
1.41
12675582--12675624
11
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4
0
72
1.04
12675583--12675638
23
2.4
24
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23
7
0
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1.12
12675692--12675837
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9
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19
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0
0
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0.93
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1.30
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2.0
149
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25
2.0
25
100
0
98
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10
8
44
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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25
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0
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0
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130
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50
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2.2
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0
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107
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2.0
20
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5
53
35
15
0
48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12765583--12765634
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3.6
39
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0
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13
22
23
40
1.90

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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