Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  178  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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A
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1.48
58593567--58593646
34
2.5
31
78
18
92
42
21
0
36
1.53
58593577--58593645
34
2.0
34
91
5
113
40
20
0
39
1.52
58593580--58593661
34
2.4
34
84
9
105
43
15
0
40
1.47
58594682--58594722
21
2.0
21
85
4
57
68
0
9
21
1.18
58595205--58595265
24
2.6
24
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2
70
19
3
4
72
1.18
58595216--58595260
24
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23
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20
2
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71
1.20
58595217--58595284
23
3.0
23
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20
1
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72
1.14
58595249--58595296
23
2.0
23
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20
0
6
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1.05
58595323--58595414
21
4.8
20
72
21
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40
0
2
57
1.11
58595323--58595399
34
2.2
35
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11
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42
0
2
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1.14
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19
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20
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3
87
53
0
8
38
1.32
58595705--58595763
21
2.8
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33
1.15
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206
28
18
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31
1.96
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21
2.2
21
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3
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2
4
52
1.33
58602794--58602881
29
3.1
30
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1
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1.14
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18
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5
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58
0
0
41
0.98
58602954--58603011
19
3.1
18
87
9
73
62
1
0
36
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
23
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57
0
2
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1.11
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13
100
0
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14
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29
1.71
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111
2.1
112
80
12
250
49
17
4
28
1.66
58615474--58615750
48
5.8
46
82
7
258
27
21
29
22
1.99
58615467--58615750
96
3.0
95
82
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315
27
21
29
22
1.99
58621702--58621919
98
2.3
95
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6
282
40
21
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30
1.82
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18
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17
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1
4
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1.11
58622046--58622115
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9
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1
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1.12
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10
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2
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1.9
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237
33
8
18
39
1.82
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100
28
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2.0
20
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0
0
60
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2.7
19
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0
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5
0
37
1.23
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37
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3
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0
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4
4
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19
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16
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2
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1.19
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14
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0
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0.80
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2.0
35
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12
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86
0
13
0
0.58
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426
2.0
426
94
0
1465
26
22
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58695865--58695902
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2.0
19
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0
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1.71
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24
2.0
24
100
0
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24
18
0
57
1.41
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3.1
23
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14
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1.92
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25
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1.90
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50
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1.96
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26
15
28
29
1.96
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15
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1.96
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207
26
15
28
29
1.96
58726171--58726326
82
1.9
81
87
6
226
26
16
28
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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