Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  136  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
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2.0
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22
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22
1.99
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22
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20
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27
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25
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26
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2.2
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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26
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.96
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82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
44229240--44229417
27
6.6
27
83
3
205
26
15
28
29
1.96
44229241--44229396
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
44229237--44229417
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
44231851--44231884
17
2.0
17
100
0
68
64
0
0
35
0.94
44231994--44232045
21
2.5
22
87
9
81
7
19
48
25
1.75
44231994--44232051
21
2.8
21
82
10
73
6
18
46
27
1.75
44232188--44232229
18
2.3
18
91
0
66
42
7
28
21
1.79
44232284--44232352
30
2.3
30
87
5
104
7
23
42
27
1.80
44233995--44234043
22
2.3
21
78
3
53
48
2
16
32
1.57
44235012--44235051
20
1.9
22
85
10
57
37
2
0
60
1.11
44237349--44237383
8
4.1
9
89
10
56
80
0
20
0
0.72
44237349--44237383
17
2.1
17
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0
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80
0
20
0
0.72
44238676--44238945
144
1.9
144
94
0
477
32
15
24
27
1.95
44239014--44239053
21
1.9
21
89
0
62
32
25
15
27
1.95
44242392--44242467
40
1.9
40
88
0
116
35
36
14
13
1.85
44243650--44243707
30
1.9
30
89
0
89
41
3
24
31
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44243919--44243950
13
2.5
13
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0
55
31
0
12
56
1.37
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50
4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
44244045--44244294
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
44248450--44248484
14
2.5
14
90
0
52
34
2
0
62
1.10
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26
3.2
26
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0
155
31
7
25
35
1.84
44261184--44261272
3
29.7
3
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0
169
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0
32
1
0.99
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21
2.2
21
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7
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2
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1.59
44265366--44265429
27
2.4
27
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0
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18
20
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1.95
44268780--44268912
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2.8
48
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6
144
30
18
17
33
1.94
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48
2.8
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6
175
30
16
18
34
1.93
44277876--44277922
24
2.0
24
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0
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25
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1.71
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15
2.5
15
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0
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7
26
28
1.84
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3.7
43
75
4
147
24
18
25
31
1.98
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7
3.6
7
100
0
50
40
0
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1.47
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2.2
68
78
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158
35
16
27
21
1.94
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13
3.8
13
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0
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16
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1.90
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14
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13
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3
51
15
2
2
79
0.95
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18
1.9
19
88
5
56
36
0
8
55
1.30
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43
2.8
43
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131
26
15
27
31
1.96
44333149--44333325
27
6.6
27
81
5
196
27
15
28
29
1.96
44333150--44333304
81
1.9
81
88
5
233
27
15
28
29
1.96
44333146--44333325
81
2.2
81
83
3
229
27
15
27
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
44342180--44342375
35
5.6
35
81
4
191
31
10
24
33
1.90
44361864--44362081
40
5.5
40
89
2
316
24
22
27
25
2.00
44363919--44364287
47
7.9
47
73
17
195
27
17
29
25
1.97
44363922--44364137
46
4.7
45
75
14
172
28
18
29
24
1.98
44371443--44371473
12
2.6
12
100
0
62
48
0
12
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2.0
136
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0
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24
17
25
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26
4.0
26
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156
35
24
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32
1.84
44375221--44375324
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2.0
52
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0
172
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1.84
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9
6.0
9
100
0
108
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11
11
44
1.75
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19
3.3
19
74
12
58
58
9
1
30
1.39

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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