Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  121  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
38789897--38789967
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3.0
24
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1.75
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2
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1.11
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2.8
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0
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2.1
34
100
0
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3.5
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28
26
17
27
1.98
38810151--38810269
42
2.8
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130
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1.97
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1.98
38815629--38815832
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180
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25
1.98
38815942--38816111
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1.98
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0
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2.0
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11
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2.2
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1
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20
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1.9
90
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229
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20
23
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50
0
0
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17
1.92
38865522--38865652
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3.3
40
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10
151
35
16
30
17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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36
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0
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22
1.99
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26
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26
26
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15
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19
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1.99
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2.7
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17
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1.98
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5.5
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280
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24
27
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4.6
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88
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260
22
23
28
25
1.99
38912381--38912584
40
5.1
40
86
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250
22
23
28
25
1.99
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28
20
23
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1.99
38927322--38927492
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1.8
93
93
0
297
28
28
21
21
1.98
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46
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27
20
21
1.98
38932929--38933071
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3.6
40
92
1
216
20
25
27
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
25
1.99
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2.0
30
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2.0
24
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19
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22
1.98
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1
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2.0
20
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188
25
21
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39005697--39005871
56
3.1
56
99
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22
1.81
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36
1.39
39012403--39012459
26
2.2
26
78
12
64
56
12
3
28
1.52
39012492--39012538
3
15.7
3
100
0
94
68
31
0
0
0.90
39012537--39012575
3
13.0
3
100
0
78
66
0
0
33
0.92
39012552--39012699
61
2.4
61
97
2
278
61
4
3
31
1.31
39012552--39012720
61
2.8
60
89
5
171
63
3
4
28
1.29
39012781--39012830
12
4.2
12
84
5
66
64
0
2
34
1.05
39012781--39012830
24
2.1
24
88
7
75
64
0
2
34
1.05
39017316--39017351
15
2.4
14
86
13
54
88
0
0
11
0.50
39017319--39017353
12
3.1
12
92
8
56
85
0
0
14
0.59
39018715--39018779
31
2.1
30
83
8
78
35
9
13
41
1.77
39018715--39018779
30
2.1
31
83
8
80
35
9
13
41
1.77
39018896--39018967
31
2.3
31
90
4
110
37
13
9
38
1.78
39019443--39019688
128
1.9
127
88
0
366
30
11
25
32
1.91
39026809--39026850
12
3.5
12
86
0
66
61
19
4
14
1.49
39027036--39027061
7
3.7
7
100
0
52
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0
26
11
1.30
39044065--39044148
44
1.9
44
92
0
141
34
22
11
30
1.90
39048457--39048580
29
4.3
29
90
6
182
34
12
28
24
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39048457--39048580
59
2.2
57
89
7
189
34
12
28
24
1.92
39048585--39048704
33
3.7
33
82
2
161
33
12
21
32
1.91
39048585--39048711
65
1.9
66
88
3
193
34
11
21
32
1.90
39054271--39054330
20
2.9
19
76
11
57
11
26
15
46
1.79
39056777--39056819
21
2.0
21
100
0
86
41
4
18
34
1.71
39057923--39057966
19
2.2
20
92
4
72
65
0
6
27
1.17
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41
1.9
40
82
5
95
20
39
21
18
1.93
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47
5.8
47
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12
242
23
27
19
30
1.98
39069002--39069249
46
5.3
46
76
10
202
25
28
18
27
1.98
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94
2.9
94
81
8
287
25
28
17
28
1.98
39073127--39073162
17
2.1
17
100
0
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47
5
11
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1.63
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20
2.0
20
85
10
53
23
10
12
53
1.69
39075732--39075915
40
4.6
40
82
6
196
23
20
27
28
1.99
39075732--39075912
80
2.3
81
83
9
221
23
20
27
27
1.99
39075813--39075962
40
3.8
38
80
8
122
24
22
28
24
1.99
39105150--39105356
53
3.8
53
76
5
191
36
17
23
22
1.94
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13
2.2
13
100
0
56
71
0
14
14
1.15
39112539--39112638
50
2.0
50
94
0
173
40
5
21
34
1.75
39115775--39115818
13
3.5
13
78
15
56
40
0
9
50
1.34
39116225--39116294
25
2.8
25
77
2
68
27
22
15
34
1.95
39133310--39133480
93
1.8
93
91
2
281
27
28
22
22
1.99
39133302--39133477
46
3.8
46
75
15
191
28
27
21
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
39135383--39135467
15
5.8
14
77
8
71
57
16
16
9
1.64
39135394--39135471
15
5.2
15
74
11
79
56
15
16
11
1.67
39143986--39144018
14
2.4
14
90
10
50
39
0
0
60
0.97
39147307--39147541
96
2.4
96
89
0
344
26
17
27
28
1.98
39147321--39147594
48
5.7
48
78
6
261
27
17
26
28
1.98
39147321--39147584
144
1.8
144
87
4
399
26
17
26
28
1.98
39150315--39150426
3
36.7
3
68
19
63
35
2
0
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1.10
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5.2
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3
0
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1.12
39150366--39150526
7
23.1
7
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20
63
36
4
0
59
1.22
39150370--39150531
29
5.6
29
70
13
97
35
4
0
59
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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