Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  53  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17113853--17113892
21
1.9
21
94
0
71
67
5
0
27
1.11
17120097--17120162
22
2.7
24
82
13
66
28
0
6
65
1.17
17120407--17120457
20
2.7
20
85
8
63
5
11
3
78
1.06
17126180--17126228
17
2.8
18
74
17
50
36
0
16
46
1.47
17129949--17129978
14
2.1
14
93
0
51
46
36
0
16
1.47
17134687--17134726
19
2.0
20
90
4
64
45
0
2
52
1.14
17145345--17145373
14
2.1
14
100
0
58
48
6
0
44
1.29
17146636--17146669
10
3.5
10
88
4
52
79
0
0
20
0.73
17146697--17146734
19
2.1
19
85
5
51
63
5
2
28
1.30
17146646--17146736
18
5.2
17
71
12
60
65
3
1
29
1.15
17146947--17146988
20
2.1
20
100
0
84
40
9
9
40
1.70
17152288--17152370
41
2.0
41
100
0
166
21
26
16
34
1.95
17153461--17153486
13
2.0
13
100
0
52
15
23
23
38
1.92
17154959--17154991
17
1.9
17
88
11
50
27
0
0
72
0.85
17156808--17156846
17
2.3
17
91
8
62
71
2
17
7
1.21
17156809--17156857
18
2.8
17
84
6
62
71
2
20
6
1.18
17170570--17170602
12
2.8
12
95
0
57
36
9
0
54
1.32
17176359--17176450
46
2.0
46
93
0
157
21
13
29
35
1.91
17188053--17188160
52
2.1
52
92
3
182
56
5
1
36
1.33
17189934--17189967
14
2.2
16
90
10
54
52
0
2
44
1.16
17189948--17189989
20
2.2
20
86
4
59
57
2
0
40
1.12
17190616--17190651
18
2.0
18
88
0
54
61
0
0
38
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17190694--17190834
10
14.8
9
70
17
72
62
1
4
31
1.25
17192852--17192893
17
2.5
17
76
11
50
54
0
0
45
0.99
17203859--17203894
18
2.0
18
100
0
72
55
11
11
22
1.66
17210368--17210438
37
1.9
37
88
8
110
36
11
29
22
1.89
17211546--17211586
19
2.2
20
86
8
59
58
2
4
34
1.32
17213744--17213778
16
2.2
16
89
0
52
54
0
5
40
1.24
17215788--17215831
18
2.4
18
88
0
61
20
29
9
40
1.83
17216250--17216305
25
2.3
24
76
11
60
44
0
5
50
1.25
17216255--17216302
25
1.9
25
83
8
62
37
0
6
56
1.25
17219346--17219742
126
3.2
124
86
5
539
29
16
15
38
1.90
17219796--17219921
34
3.7
32
79
13
128
46
15
0
38
1.46
17223177--17223209
17
2.0
17
88
5
50
60
0
0
39
0.97
17224716--17224760
23
2.0
23
86
8
65
37
13
0
48
1.42
17229992--17230051
5
12.2
5
92
3
104
56
0
1
41
1.09
17229994--17230051
29
2.0
29
96
0
107
56
0
1
41
1.09
17231145--17231173
10
2.9
10
100
0
58
51
0
6
41
1.28
17233871--17233898
1
28.0
1
100
0
56
100
0
0
0
0.00
17236393--17236782
192
2.0
192
97
0
753
32
17
21
28
1.96
17236889--17236948
6
10.0
6
100
0
120
50
0
33
16
1.46
17239088--17239128
21
2.0
21
95
0
73
14
24
19
41
1.89
17240189--17240228
21
1.9
21
84
0
53
35
15
2
47
1.58
17240739--17240784
24
1.9
24
90
0
74
30
4
0
65
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17243453--17243490
19
2.0
19
89
0
58
60
5
2
31
1.33
17243989--17244055
32
2.1
32
100
0
134
38
5
14
40
1.71
17246206--17246236
3
10.3
3
100
0
62
67
0
0
32
0.91
17246836--17246873
17
2.1
19
90
9
62
0
23
0
76
0.79
17250522--17250650
46
2.8
46
95
0
222
19
21
29
29
1.98
17252773--17252906
41
3.4
39
76
13
132
32
26
17
23
1.96
17252769--17252906
40
3.5
38
75
12
120
31
25
18
24
1.97
17253706--17253740
17
1.9
18
88
11
54
0
31
0
68
0.90
17253783--17253829
5
9.4
5
100
0
94
59
0
0
40
0.97
17254694--17254735
11
3.8
11
83
0
57
23
19
4
52
1.65
17254893--17254926
16
2.1
16
89
10
52
23
0
0
76
0.79
17259074--17259112
21
1.9
20
84
5
51
17
17
5
58
1.56
17261228--17261330
34
3.0
34
95
2
181
27
3
33
35
1.75
17263876--17263904
15
1.9
15
100
0
58
44
0
55
0
0.99
17267075--17267113
13
3.1
13
81
3
53
66
0
0
33
0.92
17267273--17267321
19
2.6
18
78
9
53
28
2
0
69
1.00
17267476--17267547
28
2.5
27
75
16
65
30
0
4
65
1.12
17267567--17267601
14
2.6
14
95
4
63
42
0
0
57
0.99
17267775--17267869
48
2.0
48
100
0
190
41
12
6
40
1.68
17270297--17270436
27
5.2
28
88
5
175
35
22
23
17
1.95
17270539--17270614
26
2.8
27
88
4
100
30
13
22
34
1.92
17270541--17270614
28
2.8
26
87
4
94
31
10
22
35
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17272056--17272139
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
17272530--17272570
22
1.9
22
85
5
57
46
4
9
39
1.58
17272993--17273054
31
1.9
32
83
6
81
40
1
0
58
1.08
17273846--17273899
20
2.6
21
82
11
67
35
0
7
57
1.27
17276048--17276366
46
6.9
46
93
0
496
38
15
23
22
1.92
17277654--17277693
12
3.1
14
86
13
52
45
0
0
55
0.99
17280029--17280123
39
2.5
39
76
20
101
49
1
1
48
1.15
17280029--17280123
7
14.1
7
72
16
58
49
1
1
48
1.15
17281292--17281348
22
2.6
22
77
8
71
15
24
17
42
1.88
17285691--17285742
28
2.0
25
84
7
59
61
0
1
36
1.07
17285792--17285845
20
2.6
21
72
13
58
72
1
1
24
1.05
17285792--17285852
11
5.8
11
73
21
51
68
1
1
27
1.08
17286025--17286147
19
6.3
19
67
20
67
39
1
3
55
1.26
17286041--17286084
20
2.1
21
84
12
56
34
0
2
63
1.07
17286090--17286144
28
2.0
28
89
7
85
41
0
0
58
0.98
17286026--17286137
38
2.9
37
74
10
100
38
1
3
56
1.27
17295000--17295063
12
5.3
12
71
12
51
53
3
0
43
1.16
17300932--17301156
48
4.7
49
81
5
219
23
27
20
29
1.99
17308582--17308749
43
4.0
41
75
10
142
25
17
26
30
1.97
17308560--17308757
43
4.7
43
72
10
129
24
18
26
30
1.98
17308560--17308757
84
2.3
85
77
5
204
24
18
26
30
1.98
17310776--17310894
59
2.0
59
98
0
229
37
7
18
36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17311331--17311396
25
2.7
25
78
2
71
25
18
21
34
1.96
17312564--17312617
21
2.6
21
87
0
81
16
37
31
14
1.89
17314293--17314361
26
2.7
26
79
0
66
44
5
18
30
1.73
17317621--17317681
30
2.0
30
87
6
88
36
8
26
29
1.85
17318102--17318274
46
3.7
46
76
13
192
22
21
27
28
1.99
17324551--17324609
22
2.7
21
82
10
73
40
18
3
37
1.68
17326419--17326447
5
5.8
5
100
0
58
82
0
17
0
0.66
17329193--17329237
22
2.1
21
84
12
56
28
15
2
53
1.54
17329725--17329763
21
1.9
21
89
5
62
51
10
2
35
1.50
17330647--17330686
15
2.7
15
85
11
55
60
0
0
40
0.97
17349385--17349422
18
2.1
19
90
5
60
42
0
5
52
1.24
17350896--17350986
44
2.1
42
89
4
137
47
18
13
20
1.82
17353088--17353122
17
2.1
17
88
0
52
54
8
14
22
1.67
17353161--17353185
11
2.3
11
100
0
50
8
28
0
64
1.22
17354442--17354493
25
2.1
25
85
0
68
36
11
13
38
1.81
17361621--17361765
59
2.5
58
80
4
166
49
14
8
26
1.73
17368017--17368062
19
2.4
19
96
0
83
39
23
0
36
1.55
17374122--17374194
10
7.1
10
73
14
60
4
20
4
71
1.20
17383388--17383422
18
1.9
18
88
11
54
65
0
34
0
0.93
17384063--17384101
20
2.1
19
90
9
62
41
0
20
38
1.53
17387919--17388011
38
2.4
39
76
18
95
47
3
6
43
1.45
17400049--17400619
177
3.2
177
91
1
910
29
18
22
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17412048--17412087
21
1.9
21
85
10
55
27
5
0
67
1.11
17412632--17412682
23
2.2
23
83
13
61
54
1
11
31
1.47
17415632--17415758
42
3.0
42
86
6
170
29
26
14
29
1.95
17415865--17416075
31
6.8
31
89
5
286
26
26
19
27
1.99
17415865--17416075
93
2.3
93
90
3
318
26
26
19
27
1.99
17418836--17418982
39
3.8
39
85
0
186
40
10
12
37
1.77
17418836--17418923
18
4.4
20
68
15
67
42
9
11
37
1.73
17418846--17418912
18
3.6
18
75
11
71
43
4
11
40
1.62
17418836--17418986
78
1.9
78
87
0
221
39
9
12
37
1.77
17421385--17421446
19
3.5
19
65
17
60
32
11
3
53
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352