Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  261  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85949002--85949368
46
7.6
46
85
7
419
29
22
13
34
1.93
85949045--85949362
52
6.3
52
85
7
399
28
22
13
34
1.92
85949002--85949368
98
3.7
98
83
8
476
29
22
13
34
1.93
85949001--85949354
196
1.8
196
92
0
600
28
22
13
34
1.93
85951338--85951544
1
207.0
1
77
0
180
87
4
3
4
0.74
85951338--85951544
24
9.0
22
80
10
200
87
4
3
4
0.74
85951338--85951543
55
3.7
54
79
13
215
87
4
3
4
0.75
85951338--85951545
82
2.5
81
83
6
251
87
4
3
4
0.76
85951561--85951601
16
2.5
17
84
8
57
17
4
0
78
0.93
85951605--85951636
14
2.3
14
94
0
55
84
0
3
12
0.74
85951680--85951756
12
6.7
12
75
7
70
85
5
1
7
0.78
85951684--85951756
34
2.3
31
88
7
101
86
4
1
8
0.75
85951710--85951767
20
2.9
21
78
14
68
86
3
3
6
0.79
85951684--85951756
1
73.0
1
77
0
56
86
4
1
8
0.75
85951938--85952626
1
689.0
1
81
0
748
89
4
2
3
0.63
85953014--85953130
40
2.9
40
78
8
139
23
28
23
24
2.00
85953635--85953688
26
2.1
27
89
6
85
33
9
16
40
1.80
85953672--85953777
26
4.1
26
78
9
110
28
17
18
34
1.94
85955305--85955449
37
4.0
37
90
3
224
24
22
15
37
1.93
85955305--85955449
73
2.0
72
89
4
220
24
22
15
37
1.93
85955413--85955779
46
7.6
46
85
7
419
29
22
13
34
1.93
85955456--85955773
52
6.3
52
84
7
399
28
22
13
34
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85955413--85955779
98
3.7
98
82
8
476
29
22
13
34
1.93
85955412--85955765
196
1.8
196
92
0
600
28
22
13
34
1.92
85958892--85959086
49
4.0
49
93
0
309
31
29
14
24
1.95
85960549--85960692
36
4.0
36
88
4
211
25
21
15
36
1.93
85960656--85961021
46
7.6
46
83
9
394
29
22
13
34
1.93
85960699--85961014
52
6.3
52
81
10
379
29
22
13
34
1.92
85960656--85961021
98
3.7
99
81
11
457
29
22
13
34
1.93
85965773--85965934
86
1.9
85
83
8
213
31
26
17
24
1.97
85969945--85970114
46
3.7
47
77
17
153
27
28
21
22
1.99
85969945--85970114
93
1.8
92
93
1
295
27
28
21
22
1.99
85975439--85975607
46
3.7
46
78
13
202
28
27
20
22
1.99
85975444--85975614
93
1.8
93
94
0
306
28
28
21
22
1.99
85994330--85994368
17
2.3
17
95
0
69
64
10
5
20
1.44
85999716--85999791
21
3.6
21
74
0
62
18
31
34
15
1.92
86000396--86000461
20
3.1
21
79
18
59
80
1
4
13
0.94
86003703--86003805
42
2.4
43
82
6
111
31
22
18
28
1.97
86006245--86006284
21
1.9
21
84
0
53
25
2
25
47
1.64
86013332--86013375
14
3.1
15
84
15
58
15
47
0
36
1.46
86021195--86021522
165
2.0
164
91
0
530
30
22
14
32
1.93
86023257--86023293
19
1.9
19
100
0
74
32
16
10
40
1.83
86023668--86023887
41
5.4
40
95
1
316
31
23
23
21
1.98
86023668--86023887
82
2.7
82
92
1
352
31
23
23
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86023929--86023976
22
2.1
22
84
3
60
50
25
0
25
1.50
86024295--86024342
14
3.4
14
80
5
60
25
2
25
47
1.62
86024300--86024342
15
2.9
15
82
3
61
23
2
27
46
1.64
86024364--86024436
21
3.6
20
75
14
69
17
0
47
34
1.48
86024364--86024454
14
6.6
14
72
6
69
20
0
43
35
1.52
86024364--86024468
7
15.1
7
71
16
58
20
0
42
36
1.53
86024615--86024659
22
2.0
22
83
8
56
20
0
33
46
1.51
86024835--86024880
23
2.0
24
86
4
67
65
8
0
26
1.21
86027868--86027928
30
2.0
30
93
0
104
26
16
16
40
1.89
86029357--86029397
21
2.0
21
100
0
82
26
19
53
0
1.45
86029695--86029923
43
5.3
43
86
4
311
24
17
24
32
1.97
86029695--86029927
85
2.7
85
91
2
351
25
17
24
32
1.97
86042705--86042879
52
3.5
51
89
4
257
26
13
30
28
1.94
86051775--86051825
24
2.1
24
96
0
93
31
11
21
35
1.90
86052270--86052337
29
2.3
29
94
0
118
20
26
30
22
1.98
86057289--86057390
48
2.1
48
85
3
134
27
21
23
27
1.99
86058253--86058326
33
2.2
33
100
0
148
29
10
16
43
1.82
86058726--86058769
20
2.2
20
95
0
79
13
36
34
15
1.87
86062695--86062833
51
2.8
51
84
4
185
25
18
26
29
1.98
86062695--86062840
49
2.9
50
84
4
197
26
19
26
28
1.98
86068085--86068228
49
2.9
49
88
2
207
26
19
25
28
1.99
86068083--86068228
51
2.9
51
87
2
215
26
19
26
28
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86073157--86073387
48
4.9
48
75
14
203
25
19
26
28
1.99
86113151--86113241
45
2.0
45
97
0
173
13
20
27
38
1.90
86113398--86113428
6
5.2
6
100
0
62
67
0
0
32
0.91
86124663--86124707
22
2.0
22
86
0
63
37
0
2
60
1.09
86125812--86125867
18
3.5
15
81
18
60
37
10
14
37
1.81
86125818--86125881
17
3.6
17
87
8
92
37
12
12
37
1.81
86125818--86125881
18
3.6
18
91
4
94
37
12
12
37
1.81
86125810--86125881
19
3.9
19
87
10
114
37
11
13
37
1.81
86125810--86125890
17
4.2
22
84
13
69
38
9
14
37
1.80
86126172--86126205
18
1.9
17
88
5
50
29
0
0
70
0.87
86134360--86134838
44
10.9
44
68
14
204
30
16
24
28
1.96
86134218--86135022
308
2.6
308
93
0
1369
30
17
23
28
1.97
86135002--86135036
14
2.5
14
90
0
52
51
11
20
17
1.75
86134738--86135280
278
2.0
278
93
0
942
32
17
22
27
1.97
86135297--86135485
78
2.6
69
79
15
211
32
17
24
25
1.97
86135339--86135503
78
2.1
78
94
2
287
32
18
23
26
1.97
86135526--86135716
45
4.3
45
83
4
242
33
12
28
25
1.92
86135520--86135716
89
2.2
90
86
7
285
33
13
28
24
1.93
86136066--86136156
19
4.9
19
89
8
152
37
9
16
36
1.82
86136066--86136179
19
5.8
22
85
10
87
36
8
16
37
1.80
86138970--86139051
43
1.9
42
82
7
103
31
29
14
24
1.95
86139092--86139128
18
2.1
18
94
0
65
29
24
24
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86139165--86139213
21
2.2
23
79
17
59
46
2
0
51
1.12
86140622--86140652
15
2.0
16
93
6
55
38
6
3
51
1.44
86140783--86140808
13
2.0
13
100
0
52
61
7
7
23
1.49
86141563--86141653
45
2.0
45
100
0
182
35
17
17
29
1.93
86144316--86144357
20
2.3
18
80
15
50
23
4
0
71
1.05
86144317--86144358
19
2.2
19
87
8
59
21
4
0
73
1.01
86144474--86144499
7
3.7
7
100
0
52
11
0
0
88
0.52
86144475--86144521
14
3.3
14
85
5
58
25
0
0
74
0.82
86144482--86144554
22
3.3
22
79
14
78
30
0
2
67
1.05
86144494--86144558
9
8.4
8
70
23
50
35
0
3
61
1.12
86145263--86145314
14
3.7
14
78
0
59
42
36
1
19
1.62
86145376--86145406
14
2.2
14
94
0
53
51
29
0
19
1.47
86145524--86145593
14
4.9
14
72
8
61
47
30
2
20
1.64
86145931--86146042
40
2.8
39
81
10
113
28
20
22
28
1.98
86146137--86146239
40
2.6
40
79
10
113
30
16
19
33
1.94
86145979--86146376
155
2.6
155
83
3
471
34
16
18
31
1.93
86148621--86148651
16
1.9
16
93
0
53
54
22
19
3
1.58
86149325--86149463
60
2.3
60
85
8
176
28
19
25
26
1.99
86149361--86149473
28
3.9
28
68
21
72
28
19
25
26
1.99
86150759--86150809
26
2.0
26
84
7
68
33
35
5
25
1.80
86153700--86153758
26
2.3
26
90
0
91
18
27
37
16
1.93
86153820--86154430
27
22.7
27
90
1
859
33
21
21
23
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86154659--86154764
27
3.9
27
83
6
124
19
20
20
38
1.93
86154770--86154935
78
2.1
78
94
0
287
19
20
28
31
1.97
86154957--86155037
27
3.0
27
84
8
103
18
22
20
38
1.94
86155155--86155267
6
18.3
6
69
18
72
18
20
14
46
1.83
86155155--86155246
25
3.7
25
88
2
132
18
21
14
45
1.84
86157084--86157369
27
10.6
27
84
4
346
33
20
20
25
1.97
86157598--86157703
27
3.9
27
81
6
115
20
20
20
37
1.94
86157709--86157874
78
2.1
78
94
0
287
19
21
28
31
1.97
86157878--86157973
27
3.7
26
82
6
68
17
23
19
38
1.93
86157896--86157976
27
3.0
26
87
5
108
17
23
22
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352