Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  307  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100433529--100433634
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0
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20
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7
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2.5
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2
32
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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100479272--100479325
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1.30
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0
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179
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2
32
18
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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20
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3.8
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349
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23
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1.95
100520944--100521076
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3.1
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22
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16
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13
64
37
1
3
57
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100551655--100551731
39
2.0
39
87
5
111
36
1
2
59
1.19
100551660--100551730
27
2.7
26
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16
76
36
1
2
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1.21
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2.6
21
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16
21
16
1.85
100564998--100565038
21
2.0
20
85
4
55
56
21
4
17
1.60
100565301--100565359
30
2.0
30
100
0
118
40
23
18
16
1.91
100566200--100566284
33
2.7
30
81
13
84
41
16
3
38
1.66
100569982--100570214
104
2.2
105
83
8
305
23
32
21
22
1.98
100570184--100570351
42
4.0
42
76
0
138
17
29
26
26
1.98
100572429--100572478
25
2.0
25
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11
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32
8
0
60
1.26
100581080--100581189
44
2.5
44
92
0
184
30
22
15
30
1.95
100584408--100584432
12
2.1
12
100
0
50
24
36
24
16
1.94
100584593--100584665
9
8.2
9
90
1
103
42
27
10
19
1.84
100584760--100584848
39
2.3
39
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2
115
20
2
26
50
1.60
100584827--100584856
13
2.3
13
100
0
60
16
0
43
40
1.48
100589496--100589707
51
4.5
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8
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29
22
16
31
1.96
100589537--100589697
51
3.2
51
93
0
259
29
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14
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1.95
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95
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15
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1.95
100593396--100593449
23
2.4
22
84
9
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5
1
50
1.36
100593529--100593587
25
2.3
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2
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1
1
42
1.20
100594383--100594433
26
2.0
26
84
3
68
41
0
7
50
1.31
100594480--100594522
21
2.0
21
86
9
59
62
2
0
34
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100597665--100597695
15
2.1
15
93
0
53
35
0
3
61
1.12
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22
2.0
22
86
0
63
28
0
2
68
1.01
100611320--100611357
18
2.1
18
90
0
58
47
10
10
31
1.72
100611422--100611472
10
5.1
10
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15
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0
23
1.26
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27
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27
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5
0
38
1.21
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18
3.2
19
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4
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61
6
0
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1.22
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6
0
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1.22
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0
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17
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1.60
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0
0
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0.98
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2.0
46
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24
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53
3
0
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2.2
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10
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1.88
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1.9
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2
136
36
11
13
38
1.81
100644702--100644751
15
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15
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15
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1.60
100644687--100644752
31
2.1
31
83
5
80
21
9
13
56
1.65
100644703--100644752
16
3.2
16
75
16
59
24
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10
58
1.57
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21
2.0
21
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4
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26
14
2
57
1.50
100655001--100655066
26
2.6
25
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11
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34
0
0
65
0.93
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12
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0
0
59
1.03
100656737--100656782
22
2.0
22
84
12
58
34
0
0
65
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100656712--100656820
52
2.0
55
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13
129
38
0
0
60
1.03
100661396--100661448
16
2.9
17
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24
54
58
3
7
30
1.43
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2.0
44
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4
3
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100671336--100671365
15
2.0
15
100
0
60
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20
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0
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28
1.90
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54
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2
252
17
25
23
34
1.96
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193
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0
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0
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2.6
19
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6
64
48
0
28
22
1.50

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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