Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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This is table  64  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20042315--20042361
19
2.5
20
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6
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40
10
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25
1.87
20045845--20045883
17
2.4
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20
15
1.63
20046263--20046385
3
41.0
3
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9
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65
2
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26
1.27
20049908--20049956
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22
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17
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38
0
0
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0.96
20071333--20071362
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30
0
0
70
0.88
20081477--20081575
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13
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1.83
20081477--20081595
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50
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2
139
33
13
14
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1.85
20084723--20084771
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1.9
25
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2
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1.08
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2.1
23
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0
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39
10
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1.64
20085005--20085043
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0
69
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0
2
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0
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2
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2.0
101
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0
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17
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40
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20105760--20105814
27
2.0
28
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10
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0
7
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1.24
20105826--20105874
19
2.6
18
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15
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65
2
2
30
1.15
20105841--20105906
16
4.1
16
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1
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20109990--20110031
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2.3
18
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0
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11
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1.68
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2.7
264
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5
999
29
10
24
35
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2
15.5
2
100
0
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0
0
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1.00
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3.0
133
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3
531
30
18
17
33
1.94
20142111--20142526
132
3.1
130
85
2
544
31
18
16
33
1.93
20142647--20142889
130
1.9
129
84
2
326
25
19
20
34
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20147232--20147320
13
6.5
14
72
21
55
55
7
2
34
1.42
20147249--20147317
21
3.4
21
73
15
81
55
8
1
34
1.40
20154968--20155001
16
2.0
17
88
11
52
2
17
17
61
1.46
20155340--20155428
13
6.5
14
72
21
55
55
7
2
34
1.42
20155357--20155425
21
3.4
21
73
15
81
55
8
1
34
1.40
20164700--20164725
4
6.5
4
100
0
52
50
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0
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1.50
20166365--20166401
19
1.9
19
89
10
58
59
2
0
37
1.12
20166613--20166653
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2.0
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17
1.92
20175139--20175164
5
5.2
5
100
0
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19
19
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5.0
9
89
2
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15
15
39
1.88
20177386--20177412
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1.9
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100
0
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0
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0
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20177389--20177430
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4
30
0
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1.14
20180599--20180636
13
2.9
13
84
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34
23
7
34
1.84
20184153--20184209
20
3.0
19
76
20
57
57
1
1
38
1.19
20184153--20184209
19
3.0
21
75
17
61
57
1
1
38
1.19
20185335--20185403
27
2.7
26
82
6
95
8
8
4
78
1.09
20185398--20185445
11
4.4
11
78
0
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22
10
6
60
1.52
20198306--20198384
40
2.0
40
85
5
106
39
12
7
40
1.72
20203968--20204050
14
5.7
14
70
24
57
49
2
2
45
1.28
20203968--20204013
17
2.9
16
76
20
51
50
2
2
45
1.26
20206527--20206583
28
2.0
30
89
6
91
26
1
19
52
1.55
20207558--20207600
17
2.5
17
77
7
52
69
2
0
27
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20213157--20213211
6
9.2
6
91
0
92
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18
50
14
1.77
20216755--20216943
50
3.8
49
82
2
216
25
19
26
28
1.98
20218758--20218837
18
4.4
18
87
0
115
37
16
11
35
1.84
20218758--20218837
36
2.2
36
97
0
151
37
16
11
35
1.84
20218998--20219080
43
1.9
43
90
4
132
31
22
20
25
1.98
20219764--20219804
12
3.5
11
90
6
55
26
17
0
56
1.41
20224128--20224317
88
2.1
89
82
7
226
37
20
8
33
1.84
20224415--20224497
8
9.6
9
71
17
59
71
0
0
28
0.87
20224415--20224450
16
2.2
16
100
0
72
83
0
0
16
0.65
20224575--20224649
21
3.6
21
76
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64
65
4
4
26
1.28
20224860--20224913
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2.7
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20
1
1
75
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9
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26
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3
69
1.10
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1.82
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28
29
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25
1.97
20234164--20234205
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2.0
22
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20254450--20254513
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2
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1.27
20259110--20259150
20
2.0
20
95
0
73
48
9
12
29
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20259855--20259885
13
2.3
14
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5
55
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41
1.45
20259903--20259942
14
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0
0
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0.91
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1.96
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3.2
20
65
20
53
21
9
15
53
1.70
20267255--20267307
26
2.0
26
82
7
63
24
15
20
39
1.91
20268795--20268897
26
4.0
26
93
0
179
34
24
7
33
1.84
20270872--20271005
65
2.1
65
100
0
268
35
13
17
32
1.89
20274350--20274378
14
2.1
14
93
6
51
34
0
10
55
1.34
20277301--20277359
31
1.9
31
96
0
109
45
20
10
23
1.81
20279451--20279501
25
2.0
25
88
0
75
41
5
15
37
1.72
20284089--20284139
25
2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
20284092--20284139
12
3.9
12
75
5
51
39
4
18
37
1.70
20288284--20288425
75
1.9
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7
198
22
9
14
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1.68
20302395--20302446
22
2.4
22
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0
95
38
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17
1.82
20302675--20302718
20
2.2
20
91
0
70
34
25
22
18
1.96
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8
183
34
23
23
17
1.96
20302666--20302824
54
3.1
53
87
12
228
34
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23
17
1.96
20304443--20304550
26
4.2
26
89
2
164
37
23
6
33
1.80
20306550--20306607
29
2.0
29
100
0
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24
20
17
37
1.93
20307001--20307048
20
2.4
20
75
0
51
31
6
37
25
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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9
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20
0
2
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0.88
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26
2.2
26
100
0
112
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30
1.70
20327882--20328015
26
5.2
26
95
0
241
32
7
24
35
1.83
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42
2.2
43
86
5
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22
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28
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2.8
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1.9
20
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2
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1.56
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1.91
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20
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29
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137
2.0
137
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1.98
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2.0
26
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26
15
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4.2
26
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2
155
37
23
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32
1.82
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52
2.1
52
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2.0
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11
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0
0
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83
0
0
16
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23
2.0
23
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27
8
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1
1.34
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57
2.0
57
98
0
219
19
2
19
58
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20390687--20390721
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0
70
0
17
0
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0.66
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96
2.0
97
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3
221
32
17
14
35
1.90
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19
1.9
19
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10
10
2
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241
2.3
241
92
0
901
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30
1.85
20397315--20397893
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27
80
7
547
38
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27
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0
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22
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19
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1.82
20399194--20399257
25
2.6
25
92
0
101
18
21
14
45
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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