Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  26  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8370574--8370658
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2.2
39
95
2
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3
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8371493--8371526
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0
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0
0.79
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10
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1
14
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1.47
8371873--8372319
98
4.5
96
80
12
490
29
1
13
54
1.49
8371873--8372319
197
2.2
202
90
3
692
29
1
13
54
1.49
8372337--8372372
16
2.2
16
90
5
54
27
2
2
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1.19
8374768--8374892
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21
122
28
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11
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1.62
8374742--8374951
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2.7
79
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7
265
30
6
10
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1.61
8381928--8382164
90
2.6
89
76
5
251
42
22
4
30
1.74
8384483--8384615
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2.9
46
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42
24
1
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1.64
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43
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2
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14
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11
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24
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4.3
41
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0
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6.7
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90
0
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17
2.1
17
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0
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2.0
20
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1
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30
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19
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60
16
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11
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27
2.1
27
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0
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8395698--8395843
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4.0
37
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22
15
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8395807--8396173
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7.6
46
87
7
446
28
22
14
34
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8395850--8396167
52
6.3
52
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7
426
28
22
13
34
1.93
8395807--8396173
98
3.7
98
85
8
503
28
22
14
34
1.93
8395807--8396159
196
1.8
196
92
0
607
28
22
14
34
1.93
8404453--8404503
25
2.0
25
100
0
102
27
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25
11
1.91
8425696--8425832
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2.2
61
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22
1.9
22
90
9
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2
4
38
1.34
8437616--8437693
22
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0
1
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8445121--8445147
9
3.0
9
100
0
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1.60
8455836--8455873
4
9.2
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2
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15
4.9
15
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11
62
62
6
1
29
1.29
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14
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6
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62
2
0
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2.2
51
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0
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2.4
17
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4
55
75
2
0
22
0.93
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5.1
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93
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57
0
0
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0.99
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4.2
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0
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6
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8497199--8497337
69
2.0
69
94
0
242
30
15
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12
2.9
12
91
0
61
54
17
11
17
1.71
8505768--8505808
15
2.9
14
83
16
50
26
4
0
68
1.10
8505783--8505832
25
2.0
24
81
11
57
36
2
0
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1.07
8505786--8505832
20
2.3
21
82
10
62
36
2
0
61
1.08
8515493--8515644
78
1.9
79
91
2
252
40
21
9
28
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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2.4
19
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4
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1.9
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0
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12
0
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1.40
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3.7
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10
130
35
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9
32
1.86
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2.0
17
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59
36
15
0
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1
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23
13
41
1.88
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137
2.1
138
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1
408
20
23
12
42
1.87
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24
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5
11
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2.4
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0
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2.2
33
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83
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0
4
49
1.21
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17
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0
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17
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1.91
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46
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2
341
40
14
23
21
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8573647--8573716
22
3.3
22
72
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48
1
1
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157
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0
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23
15
29
1.95
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1.9
43
87
5
121
47
12
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1.66
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2.0
77
100
0
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10
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63
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1.11
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20
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1
1
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1.16
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4.1
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51
58
0
0
41
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2.4
24
81
0
69
61
8
3
26
1.42
8611429--8611453
9
2.8
9
100
0
50
48
0
0
52
1.00
8612783--8612840
9
6.6
9
75
18
50
60
1
6
31
1.33
8612783--8612815
3
11.0
3
93
0
57
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0
3
33
1.10
8612773--8612811
12
3.2
12
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0
51
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0
7
30
1.24
8613024--8613064
9
4.7
9
82
14
50
63
0
0
36
0.95
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23
3.8
24
73
19
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58
4
1
35
1.25
8613030--8613066
14
2.7
14
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4
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59
0
0
40
0.97
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24
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3
26
1.42
8626248--8626339
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20
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1.98
8627247--8627310
34
1.9
34
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15
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17
3
28
1.60
8627846--8628065
46
5.0
46
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9
251
21
23
15
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1.91
8627980--8628055
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2.0
38
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0
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23
22
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1.96
8630917--8630958
17
2.5
17
92
7
68
0
21
4
73
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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3
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5
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61
2
0
35
1.09
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21
2.3
23
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21
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52
3
0
43
1.19
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17
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8
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0
4
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1.19
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2.0
32
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0
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41
7
3
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1.48
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131
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1.61
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14
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2.0
25
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0
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17
5
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25
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2
102
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6
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1.61
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231
13
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1.93
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1.87
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57
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57
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0
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3
0
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23
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0
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22
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18
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1.97
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21
3.5
21
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5
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17
21
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25
2.0
25
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27
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1.60
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46
6.0
46
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7
343
21
24
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1.92
8663925--8664000
38
2.0
38
100
0
152
23
26
18
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8669870--8669932
30
2.1
30
96
0
117
39
11
11
38
1.76
8670090--8670144
27
2.0
27
85
0
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2.0
15
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0
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20
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35
3
1
60
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1
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0
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13
0
0
86
0.58

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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