Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  181  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.77
Indices
Period
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Copy
Number
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Score
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27
16
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1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
546
40
13
24
21
1.90
59625584--59625794
40
5.3
40
83
3
257
25
27
23
24
2.00
59628093--59628212
56
2.1
56
96
0
222
45
10
23
21
1.82
59629659--59629784
47
2.6
47
92
2
198
34
6
29
29
1.82
59637590--59637773
40
4.6
40
84
8
248
25
26
23
24
2.00
59640927--59641318
44
8.8
44
77
3
318
33
18
19
29
1.95
59640932--59641313
89
4.3
89
77
2
399
32
18
19
29
1.96
59642807--59642831
12
2.1
12
100
0
50
28
8
0
64
1.22
59645886--59646048
57
2.8
57
86
2
220
46
15
15
22
1.83
59646127--59646165
20
2.0
20
100
0
78
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7
10
41
1.68
59646287--59646340
18
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17
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10
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31
11
7
50
1.66
59646287--59646334
17
2.8
18
87
6
64
31
12
6
50
1.65
59646991--59647084
17
5.5
18
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52
3
3
41
1.33
59649724--59649841
43
2.8
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3
112
31
22
18
27
1.97
59650706--59650764
29
2.0
29
96
0
109
57
10
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1.63
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38
1.9
38
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0
146
35
26
13
24
1.93
59659955--59660187
126
1.8
126
86
0
340
31
22
19
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
85
98
0
349
37
8
27
26
1.85
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22
5.3
22
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21
61
33
11
29
25
1.91
59663640--59664377
47
15.7
47
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4
1143
31
10
30
27
1.90
59666415--59666456
11
3.9
11
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3
50
2
19
0
78
0.86
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2.3
22
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3
21
0
74
0.98
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1.9
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4
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1.32
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7.5
26
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36
26
15
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1.93
59683084--59683222
52
2.7
51
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152
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21
1.92
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2.0
64
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1
197
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22
1.93
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0
0
18
0.70
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4
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80
0
0
19
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2.0
17
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51
0
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12
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49
0
0
50
1.00
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2.3
57
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158
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1
3
48
1.26
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2.0
26
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50
7
0
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1.31
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2.0
46
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26
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1.83
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16
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0
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30
28
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1.85
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17
2.4
17
91
0
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52
12
12
22
1.72
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258
2.0
258
91
0
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25
18
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1.97
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23
2.0
23
95
0
85
19
21
19
40
1.92
59713684--59713723
20
2.2
20
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13
59
47
22
0
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1.52
59718814--59718905
42
2.2
42
82
5
105
29
22
20
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59721392--59721433
11
4.3
10
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11
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0
7
45
1.30
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16
1.9
16
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0
53
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16
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12
1.80
59733734--59733776
17
2.6
17
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17
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6
0
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1.32
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2.5
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0
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0
0
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0
1
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0.90
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7.5
6
82
17
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20
0
2
77
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352