Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  333  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107089301--107089405
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0
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0.99
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2.2
27
87
0
84
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5
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20
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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1.95
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1.95
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101
57
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3
38
1.15
107123492--107123589
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2.0
21
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3
1
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1.23
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3.6
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2.0
16
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0
0
67
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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2.1
17
100
0
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5
30
36
1.80
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1.9
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1
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10
71
79
2
14
2
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107173893--107173971
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21
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19
21
1.94
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1.79
107188442--107188478
19
1.9
19
88
0
56
32
0
0
67
0.91
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2.0
21
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2
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40
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21
2.0
21
85
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4
2
41
1.36
107204330--107204373
21
2.2
20
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2
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1.20
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0
22
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22
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70
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0
3
29
1.07
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10
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0
0
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0
0
36
0.94
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2.0
17
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0
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0
4
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1.20
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15
2.5
17
80
19
50
52
0
0
47
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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0
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21
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58
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0
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0
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1.96
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6
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0
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0
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0
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18
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107246757--107246826
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18
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1.23
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1.94
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5.6
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547
31
20
16
31
1.94
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2.1
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211
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19
16
30
1.95
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13.5
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17
29
1.95
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77
7.3
74
77
12
458
34
19
17
28
1.94
107248171--107249761
73
20.3
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71
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614
33
19
17
28
1.95
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2.1
90
88
1
277
36
17
20
25
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107248729--107249761
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13.3
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15
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32
20
18
29
1.96
107248805--107248973
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1.8
92
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3
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31
20
21
25
1.98
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9.3
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32
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16
30
1.94
107247585--107249983
244
10.2
223
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1860
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17
29
1.95
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483
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17
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1.95
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166
1.9
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3
502
31
20
17
30
1.96
107249765--107249983
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30
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1.97
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0
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0
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21
4.0
23
76
10
83
36
22
22
17
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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