Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  176  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57451526--57451566
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22
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118
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2.2
24
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1
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54
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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57535502--57535772
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29
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2
75
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57659379--57659411
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55
4
8
32
1.48
57678049--57678080
14
2.2
15
94
5
57
62
6
3
28
1.34
57682000--57682027
12
2.3
12
100
0
56
57
0
0
42
0.99
57701946--57702022
31
2.5
31
86
0
100
18
31
24
25
1.97
57703670--57703732
31
2.0
31
93
0
108
17
26
4
50
1.66
57707769--57707811
21
2.0
21
95
0
77
18
39
9
32
1.83
57707963--57708000
19
2.0
19
100
0
76
47
15
10
26
1.78
57709764--57709801
19
2.0
19
100
0
76
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0
21
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1.51
57714299--57714327
11
2.6
11
100
0
58
48
0
24
27
1.51
57722300--57722375
31
2.5
31
97
0
143
14
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27
21
1.92
57722318--57722382
18
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18
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20
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24
18
1.89
57723731--57723771
11
3.7
11
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0
55
19
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60
1.51
57723765--57723849
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0
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25
3
14
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1.54
57725825--57725875
16
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16
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5
1
62
1.29
57732221--57732316
49
2.0
49
91
0
156
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16
17
35
1.93
57735473--57735521
18
2.7
18
90
3
71
36
4
12
46
1.60
57737224--57737264
17
2.4
17
91
4
64
29
4
9
56
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57738570--57738620
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19
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57
54
3
0
41
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63
2.0
63
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2
170
15
13
13
57
1.66
57745708--57745745
17
2.4
16
86
8
51
26
0
5
68
1.11
57745719--57745759
18
2.4
17
87
4
55
29
0
4
65
1.13
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126
2.2
125
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1
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26
16
19
37
1.92
57775155--57775218
32
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3
112
26
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20
1.82
57777776--57777812
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12
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0
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45
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1.77
57782523--57782802
126
2.2
125
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1.93
57783337--57783490
42
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1.94
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2.6
29
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89
35
25
14
24
1.94
57785212--57785493
29
10.0
28
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1.93
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57
4.2
57
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3
253
37
21
15
26
1.92
57785202--57785449
86
2.9
86
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3
259
37
22
14
25
1.92
57785218--57785439
115
1.9
115
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0
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1.92
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2.0
30
90
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30
25
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1.81
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2.4
38
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7
109
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16
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29
1.97
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17
2.7
17
93
3
67
23
6
10
59
1.53
57806110--57806148
17
2.3
17
100
0
78
20
5
12
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1.50
57823916--57823950
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2.3
15
100
0
70
74
0
0
25
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10
172
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23
15
29
1.95
57832949--57833199
40
6.3
40
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1
391
26
23
27
23
2.00
57841066--57841324
40
6.6
40
92
3
402
26
23
27
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
57853823--57853888
29
2.3
29
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5
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30
25
1
42
1.64
57857721--57857822
42
2.5
40
83
9
134
38
21
15
24
1.92
57863406--57863497
18
4.9
19
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13
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21
23
6
47
1.74
57865590--57865669
29
2.8
29
80
0
97
16
11
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46
1.80
57867857--57867896
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10
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0
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0
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0
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13.2
5
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16
72
78
0
2
18
0.87

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352