Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  25  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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0
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0
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0
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24
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8045572--8045712
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2.6
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2
248
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4.9
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9
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44
47
0
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1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.9
22
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5
57
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2
2
19
1.03
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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138
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0
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6.3
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93
0
67
31
0
2
65
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8239411--8239447
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0
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0
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2.0
55
91
0
177
34
17
9
39
1.81
8269294--8269322
9
3.2
9
100
0
58
41
0
0
58
0.98
8274454--8274528
37
2.0
37
92
0
123
29
52
1
17
1.53
8274507--8274541
18
1.9
18
94
0
61
25
57
0
17
1.40
8274603--8274630
11
2.5
11
100
0
56
25
0
42
32
1.55
8274956--8274992
19
2.0
18
94
5
65
32
0
0
67
0.91
8274964--8274994
14
2.2
14
94
0
53
32
0
0
67
0.91
8284885--8284928
21
2.0
22
86
4
63
38
0
2
59
1.10
8285490--8285519
15
2.0
15
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0
51
43
6
6
43
1.57
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21
1.9
20
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46
0
5
48
1.24
8295469--8295679
99
2.1
99
96
0
386
16
30
18
35
1.92
8304854--8304906
26
2.3
23
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18
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30
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7
22
1.82
8304862--8304915
26
2.1
26
100
0
108
35
37
7
20
1.81
8322321--8322351
3
10.3
3
92
0
53
29
0
3
67
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8326597--8326627
7
4.4
7
100
0
62
41
0
29
29
1.56
8329774--8329812
18
2.1
19
85
4
53
25
5
0
69
1.09
8329783--8329819
11
3.8
10
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20
51
21
8
0
70
1.13
8329775--8329819
19
2.3
20
80
3
56
24
6
0
68
1.13
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17
2.6
17
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3
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25
2
2
69
1.12
8329911--8329957
16
2.7
18
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9
62
25
2
2
70
1.10
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31
2.8
30
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15
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33
10
10
44
1.74
8339705--8339739
15
2.2
16
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5
54
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2
17
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1.31
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25
2.4
25
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0
102
18
21
18
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2.1
12
100
0
50
16
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40
1.91
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45
2.3
45
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0
147
20
19
19
41
1.90
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2.5
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74
15
134
18
19
20
41
1.90
8342421--8342630
18
11.3
18
68
12
84
36
11
14
37
1.83
8346383--8346423
21
2.0
21
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0
55
46
0
2
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1.14
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3
13
1.11
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20
1.9
19
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10
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0
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0
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27
2.1
27
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0
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23
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27
2.5
27
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2
80
28
22
25
22
1.99
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71
1.9
72
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7
165
53
6
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32
1.54
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33
2.3
33
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0
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24
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13
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60
2.0
60
90
3
186
51
13
0
35
1.41
8354366--8354425
29
2.2
27
78
18
70
61
1
0
36
1.06
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8354988--8355034
24
2.1
22
84
11
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44
0
14
40
1.46
8355183--8355272
44
2.0
44
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8
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20
22
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32
1.98
8355432--8355543
36
3.1
35
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7
118
35
13
16
34
1.87
8355432--8355543
18
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18
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93
35
13
16
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1.87
8356701--8356727
12
2.2
12
100
0
54
51
0
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18
2.1
18
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2
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15
2.5
16
79
4
53
23
5
5
66
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352