Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  235  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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1.8
93
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2
310
28
29
20
20
1.98
77392538--77392713
46
3.8
46
79
14
209
29
29
20
20
1.98
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16
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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13
155
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25
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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93
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28
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21
1.99
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28
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1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
50
32
0
4
64
1.12
77572408--77572440
13
2.5
13
90
9
50
39
3
0
57
1.14
77572689--77572729
20
2.0
20
100
0
82
46
0
0
53
1.00
77572691--77572735
20
2.2
20
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0
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44
2
2
51
1.26
77576440--77576468
2
14.5
2
100
0
58
48
0
51
0
1.00
77576486--77576527
17
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18
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19
52
59
0
35
4
1.19
77581332--77581491
43
3.7
43
79
5
153
33
26
16
23
1.96
77586032--77586103
32
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32
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0
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1.90
77588168--77588210
20
2.2
20
86
0
59
69
0
23
6
1.12
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19
2.3
20
88
3
65
62
0
0
37
0.96
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20
2.8
19
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10
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1
1
31
1.14
77590301--77590352
20
2.7
20
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0
7
25
1.17
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26
1
1
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1.09
77590503--77590565
19
3.3
19
74
12
58
25
1
1
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1.04
77590502--77590565
28
2.2
30
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26
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1
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1.05
77590558--77590599
18
2.6
16
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17
50
26
0
2
71
0.98
77590809--77590965
82
1.9
83
84
3
210
33
10
14
42
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77590770--77590988
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84
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12
205
37
10
13
37
1.80
77599663--77599775
30
3.8
29
79
5
127
29
12
19
38
1.88
77599663--77599775
60
1.9
60
84
0
154
29
12
19
38
1.88
77600516--77600599
42
2.0
40
82
8
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33
4
1
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1.25
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9
6.1
9
77
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32
5
0
61
1.19
77600587--77600641
18
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18
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0
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5
0
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1.19
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5
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85
0
0
14
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46
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1
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1.89
77612090--77612347
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2
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15
24
18
1.89
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138
2.1
137
86
0
384
42
15
23
19
1.89
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17
2.4
17
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0
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47
5.7
47
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0
407
32
8
30
28
1.86
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44
2.0
44
100
0
180
46
2
11
40
1.52
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13
2.8
13
91
0
54
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0
2
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1.11
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19
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35
0
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1.32
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3.1
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54
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54
82
10
209
47
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14
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1.69
77661983--77662026
18
2.4
18
88
0
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27
2
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2.5
75
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220
25
22
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77664693--77664772
40
2.0
40
100
0
160
20
7
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0
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10
2.7
10
100
0
54
0
7
59
33
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77668135--77668200
33
2.0
33
93
0
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30
24
15
30
1.95
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38
1.9
38
100
0
146
45
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8
34
1.72
77679836--77679908
25
3.0
25
80
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1.94
77691174--77691292
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2.8
42
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10
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1.98
77694417--77694531
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28
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8
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0
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23
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26
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1.99
77705203--77705446
67
3.6
68
79
6
269
27
24
16
31
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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