Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A11
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  113101708

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   

This is table  20  of  352  ( 42160 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6370466--6370604
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59
92
0
224
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0
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0
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3.2
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62
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22
1.48
6373963--6374027
24
2.7
24
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0
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10
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0
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42
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12
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47
2.4
47
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2.5
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1
0
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2.4
24
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1
0
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2.5
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0
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0
1
35
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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0
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46
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2
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15
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2.5
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0
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3
0
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1.12
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2.5
31
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1.63
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0
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2.0
20
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1.00
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1.9
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100
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2.0
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1.60
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2.0
15
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33
10
23
33
1.88
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19
2.8
20
75
17
55
44
1
1
51
1.22
6493399--6493453
25
2.2
25
78
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27
3
1
67
1.17
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1.9
19
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2
0
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2.1
27
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50
0
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1.19
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2.0
58
100
0
236
25
27
8
38
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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2.5
17
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35
0
0
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2.5
19
82
7
58
35
0
0
64
0.94
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2.3
15
90
0
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2
0
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10
52
23
2
0
74
0.93
6505575--6505640
17
4.0
17
71
11
57
25
1
0
72
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2.0
20
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9
55
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2
4
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1.25
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0
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2.5
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6515848--6516074
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1
294
22
22
14
39
1.91
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2.5
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5
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1
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2.4
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2
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13
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19
30
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1.97
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1.8
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19
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29
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17
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1.70
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3.2
15
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19
50
40
0
3
55
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6543489--6543514
10
2.6
10
100
0
52
42
15
19
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21
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1.74
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10.7
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93
0
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0
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0
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0
0
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0
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5
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12
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0
1
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1.10
6560385--6560442
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
6560387--6560442
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
6561750--6561788
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
6564085--6564155
23
3.0
23
84
8
74
19
9
1
69
1.25
6564126--6564167
12
3.8
11
84
15
52
19
4
0
76
0.96
6564118--6564206
35
2.4
37
90
5
137
21
6
0
71
1.08
6564118--6564206
14
7.1
14
70
29
85
21
6
0
71
1.08
6564118--6564225
36
3.0
36
80
14
116
23
8
0
68
1.16
6564412--6564511
5
18.6
5
79
10
83
21
21
0
58
1.40
6564412--6564505
16
5.8
16
74
12
75
21
21
0
57
1.41
6564412--6564511
11
9.3
11
74
14
59
21
21
0
58
1.40
6564508--6564612
22
5.0
21
71
20
85
32
3
0
62
1.19
6564529--6564660
44
2.8
47
75
15
130
28
7
2
61
1.36
6564690--6564976
76
3.8
77
87
5
370
27
13
1
57
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6564756--6564897
28
5.4
27
71
23
83
26
14
1
57
1.45
6564726--6565011
152
1.9
153
84
7
386
26
15
1
56
1.48
6564726--6564976
76
3.3
76
89
5
373
26
14
1
57
1.45
6565215--6565307
25
3.5
25
69
13
87
65
0
12
21
1.26
6565232--6565278
14
3.2
14
84
6
58
74
0
8
17
1.05
6565230--6565301
16
4.0
17
78
21
76
68
0
12
19
1.21
6565271--6565338
15
4.6
14
76
9
55
60
1
13
25
1.42
6565291--6565323
14
2.3
15
89
5
50
57
3
12
27
1.49
6565614--6565693
41
2.0
41
89
0
124
48
10
8
32
1.67
6566731--6566847
58
2.0
58
100
0
234
35
6
13
43
1.71
6567048--6567087
19
2.1
20
86
9
57
35
5
0
60
1.19
6567497--6567592
48
2.0
48
95
0
174
42
13
7
36
1.72
6568445--6568487
22
2.0
21
86
8
61
18
9
6
65
1.44
6576487--6576546
31
1.9
31
89
0
93
30
6
13
50
1.67
6578903--6578948
19
2.4
19
92
3
74
34
2
0
63
1.07
6579439--6579464
8
3.2
8
100
0
52
11
0
0
88
0.52
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11
2.9
12
86
13
52
30
0
0
69
0.88
6587367--6587433
30
2.2
30
91
0
107
38
10
28
22
1.87
6591256--6591298
22
2.0
22
85
0
59
55
9
13
20
1.66
6597728--6597774
22
2.1
22
88
0
67
51
8
27
12
1.69
6612655--6612718
30
2.2
30
88
2
94
53
7
3
35
1.46
6618889--6618939
25
2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6618892--6618939
12
3.9
12
75
5
51
39
4
18
37
1.70
6620050--6620105
28
2.0
28
100
0
112
25
7
32
35
1.83
6623582--6623632
25
2.0
25
92
0
84
39
5
17
37
1.74
6623585--6623632
12
3.9
12
75
5
51
39
4
18
37
1.70
6629828--6629879
26
2.0
26
84
3
68
32
1
0
65
1.04
6644704--6644866
90
1.8
89
80
6
195
42
14
3
39
1.64
6645275--6645349
16
4.4
17
76
14
64
42
1
0
56
1.08
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17
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50
0
0
50
1.00
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80
14
56
38
0
0
61
0.96
6645973--6646026
18
2.9
18
81
15
65
38
0
0
61
0.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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